238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0128 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0128  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  100 
 
 		 139 aa  275  1e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007912  Sde_3201  hypothetical protein  55.15 
 
 		 137 aa  158  3e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1684  Class I peptide chain release factor  58.96 
 
 		 138 aa  151  2.9999999999999998e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.270418  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1494  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  56.25 
 
 		 137 aa  149  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.129787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1970  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  52.94 
 
 		 137 aa  146  9e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0828493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1495  class I peptide chain release factor  53.68 
 
 		 137 aa  144  6e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000011773 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0012  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  50.75 
 
 		 137 aa  144  6e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0875  class I peptide chain release factor  53.73 
 
 		 138 aa  143  8.000000000000001e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.174449  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2164  Class I peptide chain release factor  54.48 
 
 		 137 aa  142  1e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3229  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  52.99 
 
 		 137 aa  142  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.168853  normal  0.123551 
 
 
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NC_010831  Cphamn1_2216  Class I peptide chain release factor  52.21 
 
 		 136 aa  142  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0838  class I peptide chain release factor  49.25 
 
 		 137 aa  141  3e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.329463 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2409  class I peptide chain release factor  55.12 
 
 		 140 aa  141  4e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0842293  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3579  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  53.91 
 
 		 137 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.440076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4041  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  50.75 
 
 		 137 aa  138  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.733627 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1818  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  53.91 
 
 		 137 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0215  Class I peptide chain release factor  53.91 
 
 		 132 aa  139  1.9999999999999998e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_002947  PP_2946  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  51.49 
 
 		 137 aa  138  3e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.661173  normal  0.230853 
 
 
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NC_008639  Cpha266_2352  class I peptide chain release factor  52.31 
 
 		 138 aa  137  3.9999999999999997e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_014248  Aazo_2829  Class I peptide chain release factor  56.15 
 
 		 137 aa  137  6e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009439  Pmen_1309  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  52.99 
 
 		 137 aa  136  7.999999999999999e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.892435  normal  0.470671 
 
 
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NC_007969  Pcryo_0867  class I peptide chain release factor  47.01 
 
 		 137 aa  136  1e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.485704  normal  0.838908 
 
 
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NC_011992  Dtpsy_2102  Class I peptide chain release factor  55.91 
 
 		 141 aa  135  2e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4649  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  50.75 
 
 		 137 aa  135  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008782  Ajs_1612  class I peptide chain release factor  55.91 
 
 		 141 aa  135  2e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.554845  normal  1 
 
 
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NC_008740  Maqu_2919  class I peptide chain release factor  54.1 
 
 		 137 aa  134  3.0000000000000003e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0177067  n/a   
 
 
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NC_011059  Paes_1981  Class I peptide chain release factor  53.38 
 
 		 136 aa  134  3.0000000000000003e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000274722  normal  1 
 
 
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NC_008463  PA14_53030  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  50 
 
 		 137 aa  133  8e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007963  Csal_0173  class I peptide chain release factor  50 
 
 		 137 aa  133  9e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.221041  n/a   
 
 
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NC_009512  Pput_2442  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  50 
 
 		 137 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0547672  normal  0.232418 
 
 
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NC_011060  Ppha_1045  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  48.85 
 
 		 137 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.290835  n/a   
 
 
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NC_011071  Smal_0179  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  53.79 
 
 		 143 aa  132  1.9999999999999998e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013457  VEA_000501  class I peptide chain release factor  49.25 
 
 		 137 aa  131  3e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00818872  n/a   
 
 
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NC_012560  Avin_34690  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  51.49 
 
 		 137 aa  131  3.9999999999999996e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.370131  n/a   
 
 
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NC_008709  Ping_0890  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  51.15 
 
 		 138 aa  130  6e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.245575  normal  1 
 
 
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NC_007298  Daro_0536  class I peptide chain release factor  51.2 
 
 		 133 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007651  BTH_I2849  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  58.2 
 
 		 134 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.10078  n/a   
 
 
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NC_007951  Bxe_A2835  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  53.91 
 
 		 134 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010681  Bphyt_1617  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  53.91 
 
 		 134 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.599417 
 
 
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NC_008228  Patl_2836  class I peptide chain release factor  44.78 
 
 		 137 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007404  Tbd_1523  hypothetical protein  50.77 
 
 		 141 aa  127  5.0000000000000004e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.331021  normal  0.193244 
 
 
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CP001637  EcDH1_3411  Class I peptide chain release factor  47.01 
 
 		 140 aa  127  6e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009832  Spro_3760  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  52.34 
 
 		 137 aa  127  7.000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000181211  normal  0.0838449 
 
 
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NC_009080  BMA10247_0474  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  57.38 
 
 		 134 aa  127  8.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.578239  n/a   
 
 
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NC_006348  BMA1767  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  57.38 
 
 		 134 aa  127  8.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007948  Bpro_1858  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  50 
 
 		 135 aa  126  8.000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.102554  normal  0.117146 
 
 
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NC_009076  BURPS1106A_1392  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  57.38 
 
 		 134 aa  127  8.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.367103  n/a   
 
 
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NC_008785  BMASAVP1_A1191  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  57.38 
 
 		 134 aa  127  8.000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.273593  n/a   
 
 
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NC_008836  BMA10229_A0678  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  57.38 
 
 		 134 aa  127  8.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.283064  n/a   
 
 
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NC_009074  BURPS668_1388  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  57.38 
 
 		 134 aa  127  8.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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CP001509  ECD_00190  hypothetical protein  47.76 
 
 		 140 aa  125  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.40568  n/a   
 
 
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NC_009720  Xaut_0332  class I peptide chain release factor  54.33 
 
 		 140 aa  126  1.0000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.451275  normal  0.841401 
 
 
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NC_010465  YPK_1089  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  50 
 
 		 146 aa  126  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.900586  n/a   
 
 
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NC_009524  PsycPRwf_1377  class I peptide chain release factor  44.78 
 
 		 138 aa  125  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000189898 
 
 
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NC_010498  EcSMS35_0203  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  47.01 
 
 		 140 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010159  YpAngola_A3412  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  50 
 
 		 146 aa  126  1.0000000000000001e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.44659  normal  1 
 
 
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NC_012892  B21_00189  hypothetical protein  47.76 
 
 		 140 aa  125  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.420944  n/a   
 
 
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NC_008390  Bamb_1100  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  53.6 
 
 		 134 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009708  YpsIP31758_1036  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  50 
 
 		 146 aa  126  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.501059  n/a   
 
 
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NC_010468  EcolC_3468  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  47.01 
 
 		 140 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.437856 
 
 
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NC_009800  EcHS_A0194  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  47.01 
 
 		 140 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3102  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  51.52 
 
 		 144 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.614248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1522  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  56.56 
 
 		 134 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.876893  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0196  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  47.01 
 
 		 140 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010658  SbBS512_E0185  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  47.01 
 
 		 140 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010725  Mpop_3428  Class I peptide chain release factor  55.83 
 
 		 141 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4325  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  54.4 
 
 		 134 aa  124  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0375174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4033  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  56.03 
 
 		 139 aa  125  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.471406  normal  0.87398 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0202  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  48.09 
 
 		 136 aa  125  3e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.869706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1100  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  53.6 
 
 		 134 aa  124  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.910918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1772  Class I peptide chain release factor  56.72 
 
 		 139 aa  124  3e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0992468  normal  0.67648 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0736  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  54.4 
 
 		 134 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.564723  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1190  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  54.4 
 
 		 134 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.285712  normal  0.465318 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1217  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  54.4 
 
 		 134 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.29015  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0730  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  50.78 
 
 		 140 aa  124  5e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.460757  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3557  Class I peptide chain release factor  54.2 
 
 		 140 aa  124  6e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.450326  normal  0.411853 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3233  class I peptide chain release factor  54.2 
 
 		 140 aa  123  7e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.521154 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4177  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  55.17 
 
 		 139 aa  123  7e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.378927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05388  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  45.52 
 
 		 137 aa  123  8.000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2742  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  49.59 
 
 		 134 aa  123  9e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0464887 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02765  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  51.54 
 
 		 143 aa  122  1e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.489905  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0246  release factors family protein  57.81 
 
 		 134 aa  122  1e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03821  hypothetical protein  46.88 
 
 		 138 aa  123  1e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4856  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  53.45 
 
 		 139 aa  122  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2298  class I peptide chain release factor  48.46 
 
 		 146 aa  122  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.956925 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2126  Class I peptide chain release factor  51.61 
 
 		 134 aa  121  3e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.44766  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1326  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  52.99 
 
 		 137 aa  121  3e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.000000000000388083  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2086  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  52.8 
 
 		 133 aa  121  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1147  Class I peptide chain release factor  46.27 
 
 		 142 aa  121  3e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1842  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  49.19 
 
 		 135 aa  120  6e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010581  Bind_0245  class I peptide chain release factor  50.37 
 
 		 140 aa  120  6e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.84131  normal  0.608303 
 
 
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NC_010002  Daci_2493  class I peptide chain release factor  50 
 
 		 132 aa  119  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.201964  normal  0.890427 
 
 
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NC_007908  Rfer_1386  class I peptide chain release factor  46.72 
 
 		 141 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.402498  n/a   
 
 
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NC_008825  Mpe_A3557  hypothetical protein  53.39 
 
 		 136 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012856  Rpic12D_2737  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  52.46 
 
 		 169 aa  118  3e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_003910  CPS_4400  peptidyl-tRNA hydrolase domain-containing protein  45.31 
 
 		 137 aa  117  4.9999999999999996e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.485154  n/a   
 
 
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NC_011205  SeD_A0262  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  45.52 
 
 		 140 aa  117  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.232254  normal  0.925704 
 
 
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NC_011149  SeAg_B0281  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  45.52 
 
 		 140 aa  117  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011083  SeHA_C0278  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  45.52 
 
 		 140 aa  117  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.292576  normal  0.437885 
 
 
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NC_011080  SNSL254_A0262  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  45.52 
 
 		 140 aa  117  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.430585  normal  1 
 
 
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