278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4258 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_4258  class I peptide chain release factor  100 
 
 		 141 aa  278  2e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4768  Class I peptide chain release factor  89.21 
 
 		 141 aa  221  2e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.561656  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3233  class I peptide chain release factor  77.3 
 
 		 140 aa  194  3e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.521154 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3557  Class I peptide chain release factor  77.94 
 
 		 140 aa  192  1e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.450326  normal  0.411853 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3428  Class I peptide chain release factor  78.42 
 
 		 141 aa  192  2e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0097  class I peptide chain release factor  61.76 
 
 		 140 aa  167  3e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1523  hypothetical protein  61.65 
 
 		 141 aa  160  6e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.331021  normal  0.193244 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0332  class I peptide chain release factor  60.43 
 
 		 140 aa  159  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.451275  normal  0.841401 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2541  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  59.85 
 
 		 140 aa  155  2e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3102  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  59.71 
 
 		 144 aa  155  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.614248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3167  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  62.2 
 
 		 139 aa  151  4e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.519033  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1373  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  58.02 
 
 		 140 aa  150  4e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.150956 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3071  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  54.68 
 
 		 140 aa  150  8e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2547  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  59.69 
 
 		 139 aa  148  2e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.256849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4177  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  55.4 
 
 		 139 aa  149  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.378927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0430  class I peptide chain release factor  59.85 
 
 		 141 aa  146  9e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3695  class I peptide chain release factor  56.93 
 
 		 143 aa  146  9e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.681232 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4033  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  56.12 
 
 		 139 aa  145  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.471406  normal  0.87398 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1725  class I peptide chain release factor  57.89 
 
 		 140 aa  145  3e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0208717  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2737  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  62.4 
 
 		 169 aa  144  3e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02765  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  59.7 
 
 		 143 aa  145  3e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.489905  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0634  class I peptide chain release factor  52.55 
 
 		 140 aa  141  3e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0245  class I peptide chain release factor  55.22 
 
 		 140 aa  140  6e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.84131  normal  0.608303 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0026  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  55.15 
 
 		 139 aa  140  7e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0636  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  57.36 
 
 		 143 aa  139  9e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00765778  normal  0.516786 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0024  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  59.69 
 
 		 141 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1366  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  59.69 
 
 		 141 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0034  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  59.69 
 
 		 141 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4856  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  51.8 
 
 		 139 aa  138  3e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0179  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  56.39 
 
 		 143 aa  138  3e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2666  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  54.74 
 
 		 139 aa  138  3e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1970  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  50.76 
 
 		 137 aa  137  6e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0828493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1390  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  56.92 
 
 		 140 aa  137  6e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.884369 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1772  Class I peptide chain release factor  55.56 
 
 		 139 aa  134  4e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0992468  normal  0.67648 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1858  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  53.85 
 
 		 135 aa  133  8e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.102554  normal  0.117146 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3201  hypothetical protein  51.15 
 
 		 137 aa  132  9.999999999999999e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2742  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  53.6 
 
 		 134 aa  131  3e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0464887 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1242  class I peptide chain release factor  51.49 
 
 		 139 aa  131  3e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00357715 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1709  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  55.56 
 
 		 139 aa  130  9e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.44949 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1309  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  54.26 
 
 		 137 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.892435  normal  0.470671 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1842  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  53.49 
 
 		 135 aa  129  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53030  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  51.16 
 
 		 137 aa  128  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3713  Class I peptide chain release factor  53.91 
 
 		 140 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.116579 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34690  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  51.16 
 
 		 137 aa  127  6e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.370131  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3579  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  51.16 
 
 		 137 aa  127  6e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.440076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4041  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  51.16 
 
 		 137 aa  127  6e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.733627 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2442  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  49.61 
 
 		 137 aa  126  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0547672  normal  0.232418 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3342  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  56.39 
 
 		 140 aa  126  9.000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2864  Class I peptide chain release factor  54.62 
 
 		 137 aa  126  9.000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.10878  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4649  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  50.39 
 
 		 137 aa  126  9.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1494  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  49.61 
 
 		 137 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.129787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000501  class I peptide chain release factor  48.48 
 
 		 137 aa  125  1.0000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00818872  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2835  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  55.93 
 
 		 134 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0890  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  43.61 
 
 		 138 aa  125  1.0000000000000001e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.245575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2216  Class I peptide chain release factor  48.84 
 
 		 136 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1147  Class I peptide chain release factor  53.03 
 
 		 142 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1818  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  50.39 
 
 		 137 aa  125  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3229  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  50.39 
 
 		 137 aa  124  3e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.168853  normal  0.123551 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1386  class I peptide chain release factor  52.31 
 
 		 141 aa  124  3e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.402498  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2409  class I peptide chain release factor  50.79 
 
 		 140 aa  124  4.0000000000000003e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0842293  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1617  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  55.08 
 
 		 134 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.599417 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2126  Class I peptide chain release factor  54.7 
 
 		 134 aa  124  5e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.44766  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2102  Class I peptide chain release factor  53.08 
 
 		 141 aa  124  5e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1612  class I peptide chain release factor  53.08 
 
 		 141 aa  124  5e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.554845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2836  class I peptide chain release factor  48.41 
 
 		 137 aa  124  5e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2849  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  57.26 
 
 		 134 aa  123  9e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.10078  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1684  Class I peptide chain release factor  49.62 
 
 		 138 aa  123  9e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.270418  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2946  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  48.84 
 
 		 137 aa  122  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.661173  normal  0.230853 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1045  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  48.12 
 
 		 137 aa  122  1e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.290835  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2086  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  52.46 
 
 		 133 aa  121  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1495  class I peptide chain release factor  48.48 
 
 		 137 aa  122  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000011773 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0474  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  57.26 
 
 		 134 aa  120  4e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.578239  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1767  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  57.26 
 
 		 134 aa  120  4e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1191  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  57.26 
 
 		 134 aa  120  4e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.273593  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0867  class I peptide chain release factor  45.8 
 
 		 137 aa  121  4e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.485704  normal  0.838908 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3254  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  57.86 
 
 		 144 aa  121  4e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0678  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  57.26 
 
 		 134 aa  120  4e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.283064  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1388  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  57.26 
 
 		 134 aa  120  4e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1392  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  57.26 
 
 		 134 aa  120  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.367103  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1089  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  46.21 
 
 		 146 aa  120  5e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.900586  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1036  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  46.21 
 
 		 146 aa  120  5e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.501059  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3412  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  46.21 
 
 		 146 aa  120  5e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.44659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03821  hypothetical protein  45.52 
 
 		 138 aa  120  8e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1522  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  56.41 
 
 		 134 aa  120  9e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.876893  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0512  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  48.84 
 
 		 137 aa  120  9e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3519  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  48.84 
 
 		 137 aa  120  9e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0512  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  48.84 
 
 		 137 aa  120  9e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0012  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  46.21 
 
 		 137 aa  119  9.999999999999999e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1100  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  51.64 
 
 		 134 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.910918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1100  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  51.64 
 
 		 134 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0730  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  46.21 
 
 		 140 aa  119  1.9999999999999998e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.460757  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0128  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  50.79 
 
 		 139 aa  118  1.9999999999999998e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0838  class I peptide chain release factor  46.56 
 
 		 137 aa  118  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.329463 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0536  class I peptide chain release factor  47.29 
 
 		 133 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4325  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  51.64 
 
 		 134 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0375174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0736  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  51.64 
 
 		 134 aa  118  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.564723  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1217  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  51.64 
 
 		 134 aa  118  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.29015  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1190  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  51.64 
 
 		 134 aa  118  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.285712  normal  0.465318 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2919  class I peptide chain release factor  45.11 
 
 		 137 aa  118  3e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0177067  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0535  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  45.71 
 
 		 140 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000252738  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>