More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2864 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_2864  Class I peptide chain release factor  100 
 
 		 137 aa  268  2e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.10878  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4856  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  55.12 
 
 		 139 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0430  class I peptide chain release factor  51.47 
 
 		 141 aa  124  5e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3071  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  52.31 
 
 		 140 aa  121  4e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3695  class I peptide chain release factor  51.47 
 
 		 143 aa  120  5e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.681232 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2547  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  52.71 
 
 		 139 aa  119  9.999999999999999e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.256849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3428  Class I peptide chain release factor  54.81 
 
 		 141 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4033  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  51.97 
 
 		 139 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.471406  normal  0.87398 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0097  class I peptide chain release factor  50 
 
 		 140 aa  117  6e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3167  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  52.63 
 
 		 139 aa  117  7.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.519033  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0332  class I peptide chain release factor  51.13 
 
 		 140 aa  115  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.451275  normal  0.841401 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4177  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  51.18 
 
 		 139 aa  114  3e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.378927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1390  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  53.17 
 
 		 140 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.884369 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1858  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  48.84 
 
 		 135 aa  113  6.9999999999999995e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.102554  normal  0.117146 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3557  Class I peptide chain release factor  55.56 
 
 		 140 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.450326  normal  0.411853 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1970  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  44.44 
 
 		 137 aa  111  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0828493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3233  class I peptide chain release factor  54.81 
 
 		 140 aa  110  7.000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.521154 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0634  class I peptide chain release factor  46.92 
 
 		 140 aa  109  1.0000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0245  class I peptide chain release factor  43.8 
 
 		 140 aa  109  1.0000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.84131  normal  0.608303 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2836  class I peptide chain release factor  45.59 
 
 		 137 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1392  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  50 
 
 		 134 aa  108  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.367103  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1767  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  50 
 
 		 134 aa  108  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0474  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  50 
 
 		 134 aa  108  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.578239  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1191  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  50 
 
 		 134 aa  108  3e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.273593  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1388  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  50 
 
 		 134 aa  108  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0678  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  50 
 
 		 134 aa  108  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.283064  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1842  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  46.32 
 
 		 135 aa  107  4.0000000000000004e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1522  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  49.23 
 
 		 134 aa  107  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.876893  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2849  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  50 
 
 		 134 aa  107  6e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.10078  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4041  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  50.39 
 
 		 137 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.733627 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1494  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  49.61 
 
 		 137 aa  106  8.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.129787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1495  class I peptide chain release factor  48.15 
 
 		 137 aa  106  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000011773 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1709  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  51.97 
 
 		 139 aa  105  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.44949 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2946  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  48.53 
 
 		 137 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.661173  normal  0.230853 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1366  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  51.18 
 
 		 141 aa  105  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2835  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  49.63 
 
 		 134 aa  105  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0034  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  51.18 
 
 		 141 aa  105  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0890  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  44.44 
 
 		 138 aa  105  2e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.245575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3229  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  49.61 
 
 		 137 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.168853  normal  0.123551 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1617  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  48.89 
 
 		 134 aa  104  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.599417 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1147  Class I peptide chain release factor  45.45 
 
 		 142 aa  104  4e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2742  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  48.39 
 
 		 134 aa  104  4e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0464887 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1242  class I peptide chain release factor  45.86 
 
 		 139 aa  104  5e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00357715 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2442  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  48.84 
 
 		 137 aa  104  5e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0547672  normal  0.232418 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4768  Class I peptide chain release factor  54.55 
 
 		 141 aa  103  7e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.561656  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0024  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  51.18 
 
 		 141 aa  103  9e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1523  hypothetical protein  46.83 
 
 		 141 aa  103  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.331021  normal  0.193244 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53030  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  48.84 
 
 		 137 aa  102  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2216  Class I peptide chain release factor  41.73 
 
 		 136 aa  102  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4258  class I peptide chain release factor  54.62 
 
 		 141 aa  102  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0875  class I peptide chain release factor  45.59 
 
 		 138 aa  102  2e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.174449  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3579  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  47.29 
 
 		 137 aa  101  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.440076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4649  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  48.06 
 
 		 137 aa  101  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0636  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  46.38 
 
 		 143 aa  101  3e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00765778  normal  0.516786 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1386  class I peptide chain release factor  47.29 
 
 		 141 aa  101  4e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.402498  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0730  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  47.62 
 
 		 140 aa  100  6e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.460757  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2737  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  51.67 
 
 		 169 aa  100  9e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2666  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  44.62 
 
 		 139 aa  100  9e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1818  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  46.51 
 
 		 137 aa  99.4  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1725  class I peptide chain release factor  45.52 
 
 		 140 aa  99.8  1e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0208717  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2298  class I peptide chain release factor  45.04 
 
 		 146 aa  99.8  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.956925 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2164  Class I peptide chain release factor  40.6 
 
 		 137 aa  99.4  2e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3201  hypothetical protein  43.8 
 
 		 137 aa  99.4  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1309  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  48.84 
 
 		 137 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.892435  normal  0.470671 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1373  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  42.22 
 
 		 140 aa  98.2  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.150956 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3411  Class I peptide chain release factor  44.7 
 
 		 140 aa  97.8  4e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2541  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  46.51 
 
 		 140 aa  97.8  4e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0838  class I peptide chain release factor  40.91 
 
 		 137 aa  97.8  4e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.329463 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1045  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  45.38 
 
 		 137 aa  97.8  4e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.290835  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05388  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  46.97 
 
 		 137 aa  97.8  5e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1684  Class I peptide chain release factor  43.94 
 
 		 138 aa  97.1  7e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.270418  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0203  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  44.7 
 
 		 140 aa  97.1  7e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2126  Class I peptide chain release factor  45.93 
 
 		 134 aa  97.1  7e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.44766  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2102  Class I peptide chain release factor  48.41 
 
 		 141 aa  97.1  7e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1612  class I peptide chain release factor  48.41 
 
 		 141 aa  97.1  7e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.554845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3557  hypothetical protein  51.26 
 
 		 136 aa  97.1  7e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00190  hypothetical protein  45.45 
 
 		 140 aa  97.1  8e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.40568  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3102  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  50 
 
 		 144 aa  97.1  8e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.614248  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00189  hypothetical protein  45.45 
 
 		 140 aa  97.1  8e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.420944  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3468  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  44.7 
 
 		 140 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.437856 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0194  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  44.7 
 
 		 140 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0185  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  44.7 
 
 		 140 aa  96.3  1e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1981  Class I peptide chain release factor  41.35 
 
 		 136 aa  96.3  1e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000274722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0202  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  44.7 
 
 		 136 aa  96.7  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.869706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1100  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  44.7 
 
 		 134 aa  95.9  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0012  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  42.65 
 
 		 137 aa  96.3  1e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0196  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  44.7 
 
 		 140 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0262  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  43.85 
 
 		 140 aa  95.5  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.430585  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34690  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  47.24 
 
 		 137 aa  95.5  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.370131  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0278  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  43.85 
 
 		 140 aa  95.5  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.292576  normal  0.437885 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0267  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  43.85 
 
 		 140 aa  95.5  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.122717 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3713  Class I peptide chain release factor  43.61 
 
 		 140 aa  95.9  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.116579 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3760  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  46.83 
 
 		 137 aa  95.5  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000181211  normal  0.0838449 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0179  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  47.73 
 
 		 143 aa  95.5  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0281  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  43.85 
 
 		 140 aa  95.5  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0262  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  43.85 
 
 		 140 aa  95.5  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.232254  normal  0.925704 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1190  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  44.88 
 
 		 134 aa  94.7  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.285712  normal  0.465318 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2086  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  45.67 
 
 		 133 aa  95.1  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0736  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  44.88 
 
 		 134 aa  94.7  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.564723  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1217  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  44.88 
 
 		 134 aa  94.7  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.29015  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>