244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0430 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_0430  class I peptide chain release factor  100 
 
 
141 aa  278  2e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1523  hypothetical protein  59.4 
 
 
141 aa  156  1e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.331021  normal  0.193244 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1725  class I peptide chain release factor  57.66 
 
 
140 aa  155  1e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0208717  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0332  class I peptide chain release factor  57.46 
 
 
140 aa  155  2e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.451275  normal  0.841401 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2541  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  58.33 
 
 
140 aa  153  7e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0634  class I peptide chain release factor  54.14 
 
 
140 aa  144  4.0000000000000006e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0097  class I peptide chain release factor  53.33 
 
 
140 aa  144  5e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0245  class I peptide chain release factor  55.3 
 
 
140 aa  142  1e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.84131  normal  0.608303 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4033  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  51.77 
 
 
139 aa  138  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.471406  normal  0.87398 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3167  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  53.33 
 
 
139 aa  137  7e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.519033  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2547  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  52.59 
 
 
139 aa  136  1e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.256849  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3557  Class I peptide chain release factor  59.85 
 
 
140 aa  135  1e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.450326  normal  0.411853 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3428  Class I peptide chain release factor  58.46 
 
 
141 aa  135  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4177  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  50.35 
 
 
139 aa  135  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.378927  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3102  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  53.03 
 
 
144 aa  134  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.614248  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3233  class I peptide chain release factor  59.09 
 
 
140 aa  134  4e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.521154 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3713  Class I peptide chain release factor  51.49 
 
 
140 aa  133  6.0000000000000005e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.116579 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4856  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  48.94 
 
 
139 aa  133  8e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2737  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  53.38 
 
 
169 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0179  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  50.75 
 
 
143 aa  132  1.9999999999999998e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3071  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  50.38 
 
 
140 aa  130  5e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4768  Class I peptide chain release factor  59.7 
 
 
141 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.561656  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3695  class I peptide chain release factor  49.63 
 
 
143 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.681232 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4258  class I peptide chain release factor  59.85 
 
 
141 aa  128  3e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1390  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  54.03 
 
 
140 aa  128  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.884369 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0012  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  44.85 
 
 
137 aa  126  8.000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02765  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  52.27 
 
 
143 aa  125  1.0000000000000001e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.489905  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1045  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  49.62 
 
 
137 aa  124  3e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.290835  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1709  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  51.13 
 
 
139 aa  124  5e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.44949 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2864  Class I peptide chain release factor  51.47 
 
 
137 aa  124  5e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.10878  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1644  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  52.71 
 
 
131 aa  123  8.000000000000001e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.841832  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0830  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  51.09 
 
 
157 aa  123  8.000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.367677  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000501  class I peptide chain release factor  44.85 
 
 
137 aa  122  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00818872  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0536  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  52.71 
 
 
131 aa  123  1e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00995879  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3501  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  56.62 
 
 
143 aa  121  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2088  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  53.96 
 
 
178 aa  120  5e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.273821  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2164  Class I peptide chain release factor  47.06 
 
 
137 aa  120  5e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3254  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  54.89 
 
 
144 aa  120  5e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2008  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  54.01 
 
 
178 aa  118  3e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0938485  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2126  Class I peptide chain release factor  48.87 
 
 
134 aa  118  3e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.44766  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05388  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  41.91 
 
 
137 aa  117  3.9999999999999996e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4041  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  44.85 
 
 
137 aa  115  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.733627 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2298  class I peptide chain release factor  48.46 
 
 
146 aa  116  9.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.956925 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1494  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  44.12 
 
 
137 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.129787  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0041  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  53.38 
 
 
144 aa  115  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1684  Class I peptide chain release factor  42.75 
 
 
138 aa  115  3e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.270418  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0026  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  48.51 
 
 
139 aa  114  3.9999999999999997e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3201  hypothetical protein  44.12 
 
 
137 aa  114  3.9999999999999997e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34690  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  45.11 
 
 
137 aa  114  5e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.370131  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4298  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  51.13 
 
 
147 aa  114  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2742  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  48 
 
 
134 aa  114  5e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0464887 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0867  class I peptide chain release factor  43.38 
 
 
137 aa  113  6.9999999999999995e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.485704  normal  0.838908 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2102  Class I peptide chain release factor  48.15 
 
 
141 aa  113  6.9999999999999995e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1612  class I peptide chain release factor  48.15 
 
 
141 aa  113  6.9999999999999995e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.554845  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2666  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  46.62 
 
 
139 aa  113  7.999999999999999e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1386  class I peptide chain release factor  48.84 
 
 
141 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.402498  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1858  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  46.21 
 
 
135 aa  113  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.102554  normal  0.117146 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2836  class I peptide chain release factor  41.91 
 
 
137 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0512  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  43.28 
 
 
137 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3519  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  43.28 
 
 
137 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0512  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  43.28 
 
 
137 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0024  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  49.62 
 
 
141 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2442  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  43.8 
 
 
137 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0547672  normal  0.232418 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2946  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  43.8 
 
 
137 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.661173  normal  0.230853 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0128  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  49.59 
 
 
139 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1981  Class I peptide chain release factor  44.36 
 
 
136 aa  112  2.0000000000000002e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000274722  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1377  class I peptide chain release factor  44.85 
 
 
138 aa  112  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000189898 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2919  class I peptide chain release factor  41.3 
 
 
137 aa  112  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0177067  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3229  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  44.12 
 
 
137 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.168853  normal  0.123551 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0173  class I peptide chain release factor  44.2 
 
 
137 aa  111  3e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.221041  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3971  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  49.62 
 
 
146 aa  110  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1495  class I peptide chain release factor  41.48 
 
 
137 aa  110  4.0000000000000004e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000011773 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3284  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  40.74 
 
 
138 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0636  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  45.39 
 
 
143 aa  110  8.000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00765778  normal  0.516786 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1842  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  43.94 
 
 
135 aa  110  8.000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0149  Class I peptide chain release factor  43.07 
 
 
146 aa  109  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3193  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  39.71 
 
 
137 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3579  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  41.18 
 
 
137 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.440076  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4087  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  40 
 
 
142 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1309  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  42.65 
 
 
137 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.892435  normal  0.470671 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0875  class I peptide chain release factor  40.58 
 
 
138 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.174449  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2216  Class I peptide chain release factor  42.86 
 
 
136 aa  109  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1373  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  44.12 
 
 
140 aa  109  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.150956 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3362  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  41.35 
 
 
136 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.143651 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1767  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  47.11 
 
 
134 aa  108  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0838  class I peptide chain release factor  42.65 
 
 
137 aa  108  3e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.329463 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03821  hypothetical protein  42.11 
 
 
138 aa  108  3e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1242  class I peptide chain release factor  44.36 
 
 
139 aa  108  3e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00357715 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1191  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  47.11 
 
 
134 aa  108  3e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.273593  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0678  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  47.11 
 
 
134 aa  108  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.283064  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1388  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  47.11 
 
 
134 aa  108  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1392  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  47.11 
 
 
134 aa  108  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.367103  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0474  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  47.11 
 
 
134 aa  108  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.578239  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0513  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  41.04 
 
 
137 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2849  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  46.28 
 
 
134 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.10078  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3592  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  40.74 
 
 
138 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2352  class I peptide chain release factor  43.94 
 
 
138 aa  107  4.0000000000000004e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3853  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  40.3 
 
 
143 aa  107  5e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0536  class I peptide chain release factor  45.31 
 
 
133 aa  107  6e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1366  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  46.62 
 
 
141 aa  107  6e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>