224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3342 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



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Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009952  Dshi_3342  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  100 
 
 
140 aa  275  1e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2666  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  75.71 
 
 
139 aa  207  3e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0636  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  71.43 
 
 
143 aa  207  3e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00765778  normal  0.516786 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0024  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  71.01 
 
 
141 aa  197  6e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1366  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  70 
 
 
141 aa  196  7.999999999999999e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0034  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  70 
 
 
141 aa  196  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0026  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  70.8 
 
 
139 aa  191  2e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0332  class I peptide chain release factor  60.45 
 
 
140 aa  150  5.9999999999999996e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.451275  normal  0.841401 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1523  hypothetical protein  55.64 
 
 
141 aa  144  5e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.331021  normal  0.193244 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4856  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  53.96 
 
 
139 aa  135  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1725  class I peptide chain release factor  51.43 
 
 
140 aa  131  1.9999999999999998e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0208717  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3071  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  53.33 
 
 
140 aa  132  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4768  Class I peptide chain release factor  57.89 
 
 
141 aa  131  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.561656  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2547  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  52.59 
 
 
139 aa  130  5e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.256849  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1390  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  55.56 
 
 
140 aa  130  5e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.884369 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3167  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  54.48 
 
 
139 aa  130  6e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.519033  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4258  class I peptide chain release factor  56.39 
 
 
141 aa  128  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1373  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  49.28 
 
 
140 aa  128  3e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.150956 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4177  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  51.08 
 
 
139 aa  127  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.378927  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0097  class I peptide chain release factor  53.85 
 
 
140 aa  127  6e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4033  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  52.52 
 
 
139 aa  127  6e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.471406  normal  0.87398 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1242  class I peptide chain release factor  53.03 
 
 
139 aa  126  9.000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00357715 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1494  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  52.21 
 
 
137 aa  125  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.129787  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0634  class I peptide chain release factor  48.12 
 
 
140 aa  125  1.0000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02765  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  50.39 
 
 
143 aa  124  4.0000000000000003e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.489905  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2541  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  49.61 
 
 
140 aa  123  7e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0179  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  55.91 
 
 
143 aa  123  7e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3428  Class I peptide chain release factor  57.02 
 
 
141 aa  122  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1309  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  52.94 
 
 
137 aa  121  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.892435  normal  0.470671 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3579  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  52.21 
 
 
137 aa  120  7e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.440076  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3695  class I peptide chain release factor  50.35 
 
 
143 aa  120  7e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.681232 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0173  class I peptide chain release factor  51.45 
 
 
137 aa  120  8e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.221041  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000501  class I peptide chain release factor  47.06 
 
 
137 aa  120  8e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00818872  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3557  Class I peptide chain release factor  52.55 
 
 
140 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.450326  normal  0.411853 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0875  class I peptide chain release factor  49.64 
 
 
138 aa  119  9.999999999999999e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.174449  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4649  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  52.21 
 
 
137 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53030  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  52.21 
 
 
137 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2946  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  51.82 
 
 
137 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.661173  normal  0.230853 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4041  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  51.47 
 
 
137 aa  118  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.733627 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3233  class I peptide chain release factor  52.55 
 
 
140 aa  118  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.521154 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4298  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  54.07 
 
 
147 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0245  class I peptide chain release factor  50 
 
 
140 aa  119  1.9999999999999998e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.84131  normal  0.608303 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1709  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  52.24 
 
 
139 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.44949 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1818  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  51.47 
 
 
137 aa  118  3e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2919  class I peptide chain release factor  47.45 
 
 
137 aa  118  3e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0177067  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3102  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  50.39 
 
 
144 aa  117  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.614248  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2442  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  50.36 
 
 
137 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0547672  normal  0.232418 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3201  hypothetical protein  48.55 
 
 
137 aa  117  4.9999999999999996e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05388  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  45.59 
 
 
137 aa  117  4.9999999999999996e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0890  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  47.48 
 
 
138 aa  116  7.999999999999999e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.245575  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1970  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  47.1 
 
 
137 aa  116  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0828493  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1684  Class I peptide chain release factor  50 
 
 
138 aa  116  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.270418  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0041  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  52.59 
 
 
144 aa  116  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0430  class I peptide chain release factor  45.99 
 
 
141 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3229  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  51.47 
 
 
137 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.168853  normal  0.123551 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3971  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  53.33 
 
 
146 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3713  Class I peptide chain release factor  50.79 
 
 
140 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.116579 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0830  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  50.36 
 
 
157 aa  114  3.9999999999999997e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.367677  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1858  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  51.16 
 
 
135 aa  114  5e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.102554  normal  0.117146 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3468  class I peptide chain release factor  49.28 
 
 
138 aa  114  6.9999999999999995e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1495  class I peptide chain release factor  48.87 
 
 
137 aa  113  6.9999999999999995e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000011773 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0012  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  47.06 
 
 
137 aa  113  7.999999999999999e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0919  class I peptide chain release factor  53.66 
 
 
136 aa  113  1.0000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1772  Class I peptide chain release factor  51.09 
 
 
139 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0992468  normal  0.67648 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3254  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  49.63 
 
 
144 aa  111  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2829  Class I peptide chain release factor  44.2 
 
 
137 aa  111  3e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2737  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  48.8 
 
 
169 aa  111  3e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4087  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  43.61 
 
 
142 aa  111  3e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3411  Class I peptide chain release factor  43.88 
 
 
140 aa  110  6e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2088  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  49.64 
 
 
178 aa  109  1.0000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.273821  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34690  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  49.26 
 
 
137 aa  109  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.370131  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0203  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  43.88 
 
 
140 aa  109  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00190  hypothetical protein  43.88 
 
 
140 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.40568  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3412  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  44.2 
 
 
146 aa  108  2.0000000000000002e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.44659  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1089  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  44.2 
 
 
146 aa  108  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.900586  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1036  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  44.2 
 
 
146 aa  108  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.501059  n/a   
 
 
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NC_012892  B21_00189  hypothetical protein  43.88 
 
 
140 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.420944  n/a   
 
 
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NC_009800  EcHS_A0194  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  43.17 
 
 
140 aa  108  3e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0185  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  43.17 
 
 
140 aa  108  3e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009801  EcE24377A_0196  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  43.17 
 
 
140 aa  108  3e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2008  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  48.91 
 
 
178 aa  107  4.0000000000000004e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0938485  n/a   
 
 
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NC_007614  Nmul_A2409  class I peptide chain release factor  45.38 
 
 
140 aa  107  4.0000000000000004e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0842293  n/a   
 
 
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NC_007969  Pcryo_0867  class I peptide chain release factor  45.59 
 
 
137 aa  107  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.485704  normal  0.838908 
 
 
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NC_010831  Cphamn1_2216  Class I peptide chain release factor  44.44 
 
 
136 aa  107  5e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_009832  Spro_3760  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  44.85 
 
 
137 aa  107  6e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000181211  normal  0.0838449 
 
 
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NC_011205  SeD_A0262  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  44.12 
 
 
140 aa  107  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.232254  normal  0.925704 
 
 
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NC_011080  SNSL254_A0262  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  44.12 
 
 
140 aa  107  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.430585  normal 
 
 
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NC_011083  SeHA_C0278  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  44.12 
 
 
140 aa  107  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.292576  normal  0.437885 
 
 
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NC_011094  SeSA_A0267  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  44.12 
 
 
140 aa  107  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.122717 
 
 
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NC_011149  SeAg_B0281  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  44.12 
 
 
140 aa  107  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_007204  Psyc_0838  class I peptide chain release factor  46.32 
 
 
137 aa  107  8.000000000000001e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.329463 
 
 
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NC_008825  Mpe_A3557  hypothetical protein  50.42 
 
 
136 aa  106  8.000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_009524  PsycPRwf_1377  class I peptide chain release factor  44.85 
 
 
138 aa  106  9.000000000000001e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000189898 
 
 
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NC_010468  EcolC_3468  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  42.45 
 
 
140 aa  105  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.437856 
 
 
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NC_008345  Sfri_3592  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  42.11 
 
 
138 aa  106  1e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_011060  Ppha_1045  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  43.38 
 
 
137 aa  106  1e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.290835  n/a   
 
 
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NC_003910  CPS_4400  peptidyl-tRNA hydrolase domain-containing protein  45.99 
 
 
137 aa  105  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.485154  n/a   
 
 
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NC_007651  BTH_I2849  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  50.41 
 
 
134 aa  105  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.10078  n/a   
 
 
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NC_008700  Sama_3193  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  41.18 
 
 
137 aa  105  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_009901  Spea_0535  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  39.85 
 
 
140 aa  105  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000252738  n/a   
 
 
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