228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0357 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007577  PMT9312_0357  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  100 
 
 		 142 aa  283  5e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.197907  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03851  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  87.32 
 
 		 145 aa  251  3e-66  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.472509  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03841  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  86.62 
 
 		 142 aa  225  2e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.300299  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03851  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  62.04 
 
 		 138 aa  177  5.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.78098  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0556  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  52.86 
 
 		 140 aa  154  3e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.908284  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_13231  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  54.81 
 
 		 140 aa  154  5.0000000000000005e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.107731 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14431  aminoacyl-tRNA hydrolase  50.37 
 
 		 142 aa  139  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134449 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1977  hypothetical protein  44.12 
 
 		 147 aa  128  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29401  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  46.27 
 
 		 143 aa  126  8.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2589  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  40.3 
 
 		 143 aa  122  1e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.139809 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0828  class I peptide chain release factor  40.6 
 
 		 143 aa  117  6e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.084227  normal  0.577316 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3224  hypothetical protein  40.6 
 
 		 139 aa  116  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6400  Class I peptide chain release factor  38.69 
 
 		 140 aa  115  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2228  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.06 
 
 		 146 aa  107  6e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0140  Class I peptide chain release factor  38.97 
 
 		 133 aa  101  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6855  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.24 
 
 		 137 aa  99  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000218203  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37860  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  41.67 
 
 		 141 aa  98.2  4e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.259651 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0598  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  39.26 
 
 		 147 aa  97.4  6e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.104756  normal  0.0423062 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15800  hypothetical protein  34.72 
 
 		 151 aa  95.9  1e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.25035  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0960  Class I peptide chain release factor  33.59 
 
 		 145 aa  96.7  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6283  class I peptide chain release factor  40.65 
 
 		 133 aa  95.5  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.426377 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1970  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  39.55 
 
 		 137 aa  95.9  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0828493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3059  Class I peptide chain release factor  42.86 
 
 		 146 aa  95.5  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0504323  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1495  class I peptide chain release factor  40.15 
 
 		 137 aa  94  6e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000011773 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0024  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  41.91 
 
 		 141 aa  92  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2311  class I peptide chain release factor  39.26 
 
 		 144 aa  92.4  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2137  Class I peptide chain release factor  39.85 
 
 		 145 aa  92  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.157094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1587  protein chain release factor B-like protein  46.34 
 
 		 133 aa  92  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0636  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  40.44 
 
 		 143 aa  91.3  4e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00765778  normal  0.516786 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0582  Class I peptide chain release factor  36.84 
 
 		 143 aa  91.7  4e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28300  protein chain release factor B  38.13 
 
 		 146 aa  91.3  4e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0097  class I peptide chain release factor  38.81 
 
 		 140 aa  90.9  5e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3695  class I peptide chain release factor  34.81 
 
 		 143 aa  90.9  6e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.681232 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1366  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  40.44 
 
 		 141 aa  89.7  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1045  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  35.61 
 
 		 137 aa  89.7  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.290835  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0034  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  40.44 
 
 		 141 aa  89.7  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0149  Class I peptide chain release factor  37.14 
 
 		 146 aa  89  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3362  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  37.14 
 
 		 136 aa  89.4  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.143651 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1190  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  34.17 
 
 		 142 aa  87.4  5e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0102787  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0512  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  37.68 
 
 		 137 aa  87.8  5e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3519  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  37.68 
 
 		 137 aa  87.8  5e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0512  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  37.68 
 
 		 137 aa  87.8  5e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4087  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  36.81 
 
 		 142 aa  87.4  6e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22660  protein chain release factor B  35.38 
 
 		 146 aa  87  7e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3342  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.52 
 
 		 140 aa  87  8e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0513  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  36.96 
 
 		 137 aa  86.3  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14580  protein chain release factor B  35.94 
 
 		 149 aa  86.7  1e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.024949  normal  0.100234 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0026  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  39.85 
 
 		 139 aa  86.3  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0535  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  36.23 
 
 		 140 aa  86.7  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000252738  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3102  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.06 
 
 		 144 aa  86.3  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.614248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2836  class I peptide chain release factor  40.32 
 
 		 137 aa  85.9  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53030  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  35.82 
 
 		 137 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3193  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  37.41 
 
 		 137 aa  84.7  4e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1368  Class I peptide chain release factor  37.31 
 
 		 151 aa  84  7e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.422423  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1858  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  32.82 
 
 		 135 aa  84  7e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.102554  normal  0.117146 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4649  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  35.07 
 
 		 137 aa  83.6  8e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3592  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  34.27 
 
 		 138 aa  83.6  8e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0550  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  36.96 
 
 		 137 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0672  Class I peptide chain release factor  37.4 
 
 		 164 aa  82.8  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1139  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  40.71 
 
 		 135 aa  82.8  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.668699  hitchhiker  0.0000255513 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4856  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  32.58 
 
 		 139 aa  82  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3468  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  32.58 
 
 		 140 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.437856 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3284  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  34.27 
 
 		 138 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0196  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  32.58 
 
 		 140 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0194  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  32.58 
 
 		 140 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0185  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  32.58 
 
 		 140 aa  81.3  0.000000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00190  hypothetical protein  32.58 
 
 		 140 aa  80.5  0.000000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.40568  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00189  hypothetical protein  32.58 
 
 		 140 aa  80.5  0.000000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.420944  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0202  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  32.31 
 
 		 136 aa  80.5  0.000000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.869706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1249  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  41.11 
 
 		 129 aa  80.1  0.000000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.459871 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0730  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  31.34 
 
 		 140 aa  79.7  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.460757  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2164  Class I peptide chain release factor  33.33 
 
 		 137 aa  79.7  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29491  hypothetical protein  64.15 
 
 		 106 aa  79.7  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0203  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  31.82 
 
 		 140 aa  79.3  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2829  Class I peptide chain release factor  36.57 
 
 		 137 aa  79  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3468  class I peptide chain release factor  28.57 
 
 		 138 aa  79  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1191  Class I peptide chain release factor  39.71 
 
 		 136 aa  79.3  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1772  Class I peptide chain release factor  32.35 
 
 		 139 aa  78.6  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0992468  normal  0.67648 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2352  class I peptide chain release factor  34.56 
 
 		 138 aa  79  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3411  Class I peptide chain release factor  31.82 
 
 		 140 aa  78.2  0.00000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0332  class I peptide chain release factor  34.81 
 
 		 140 aa  77.8  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.451275  normal  0.841401 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2737  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  37.8 
 
 		 169 aa  78.2  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3760  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  31.34 
 
 		 137 aa  78.2  0.00000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000181211  normal  0.0838449 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1523  hypothetical protein  34.07 
 
 		 141 aa  77.4  0.00000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.331021  normal  0.193244 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3853  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  33.57 
 
 		 143 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1387  class I peptide chain release factor  38.03 
 
 		 150 aa  77.8  0.00000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.443355  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0875  class I peptide chain release factor  37.68 
 
 		 138 aa  77.4  0.00000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.174449  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2666  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.52 
 
 		 139 aa  77.4  0.00000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0179  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  36.09 
 
 		 143 aa  76.6  0.00000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1036  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  32.84 
 
 		 146 aa  76.6  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.501059  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1494  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  35.07 
 
 		 137 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.129787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1089  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  32.84 
 
 		 146 aa  76.6  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.900586  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2409  class I peptide chain release factor  34.13 
 
 		 140 aa  76.6  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0842293  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3412  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  32.84 
 
 		 146 aa  76.6  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.44659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0245  class I peptide chain release factor  36.84 
 
 		 140 aa  76.6  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.84131  normal  0.608303 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3071  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  36.5 
 
 		 140 aa  75.5  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1842  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  30.16 
 
 		 135 aa  75.5  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0634  class I peptide chain release factor  35.34 
 
 		 140 aa  75.9  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1373  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  35.56 
 
 		 140 aa  75.9  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.150956 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34690  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  30.6 
 
 		 137 aa  75.5  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.370131  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>