231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_14580 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_14580  protein chain release factor B  100 
 
 		 149 aa  281  3.0000000000000004e-75  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.024949  normal  0.100234 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22660  protein chain release factor B  68.97 
 
 		 146 aa  157  3e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15800  hypothetical protein  70.21 
 
 		 151 aa  156  7e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.25035  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3224  hypothetical protein  56.82 
 
 		 139 aa  133  7.000000000000001e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6400  Class I peptide chain release factor  57.25 
 
 		 140 aa  132  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1387  class I peptide chain release factor  58.9 
 
 		 150 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.443355  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0598  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  58.09 
 
 		 147 aa  124  5e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.104756  normal  0.0423062 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0960  Class I peptide chain release factor  55.73 
 
 		 145 aa  124  6e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0828  class I peptide chain release factor  55.73 
 
 		 143 aa  122  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.084227  normal  0.577316 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2589  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  51.91 
 
 		 143 aa  119  9.999999999999999e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.139809 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0979  Class I peptide chain release factor  71.92 
 
 		 149 aa  119  9.999999999999999e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000812989 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6855  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  55.2 
 
 		 137 aa  117  4.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000218203  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29401  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  46.58 
 
 		 143 aa  113  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1977  hypothetical protein  51.03 
 
 		 147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37860  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  59.29 
 
 		 141 aa  110  9e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.259651 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2228  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  46.83 
 
 		 146 aa  109  1.0000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2137  Class I peptide chain release factor  56.93 
 
 		 145 aa  109  1.0000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.157094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1190  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  52.89 
 
 		 142 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0102787  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1139  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  65.22 
 
 		 135 aa  108  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.668699  hitchhiker  0.0000255513 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0179  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  48.03 
 
 		 143 aa  107  8.000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0672  Class I peptide chain release factor  55.91 
 
 		 164 aa  106  9.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1249  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  62.22 
 
 		 129 aa  103  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.459871 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1523  hypothetical protein  50.41 
 
 		 141 aa  102  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.331021  normal  0.193244 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3102  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  44.06 
 
 		 144 aa  101  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.614248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0556  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  40.16 
 
 		 140 aa  99.4  1e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.908284  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3059  Class I peptide chain release factor  57.81 
 
 		 146 aa  99.8  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0504323  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2737  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  44.44 
 
 		 169 aa  99  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0357  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  35.94 
 
 		 142 aa  99  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.197907  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1366  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  49.62 
 
 		 141 aa  98.2  3e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0034  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  49.62 
 
 		 141 aa  98.2  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02765  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  44.88 
 
 		 143 aa  97.4  5e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.489905  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_13231  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  39.68 
 
 		 140 aa  97.4  5e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.107731 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0024  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  48.85 
 
 		 141 aa  96.7  9e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0582  Class I peptide chain release factor  49.64 
 
 		 143 aa  95.9  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14431  aminoacyl-tRNA hydrolase  40.6 
 
 		 142 aa  95.1  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134449 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1242  class I peptide chain release factor  41.67 
 
 		 139 aa  94.4  4e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00357715 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03851  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  35.16 
 
 		 145 aa  94.7  4e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.472509  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3428  Class I peptide chain release factor  47.11 
 
 		 141 aa  94  6e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0636  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  45.11 
 
 		 143 aa  92.8  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00765778  normal  0.516786 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28300  protein chain release factor B  53.85 
 
 		 146 aa  92.4  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4856  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  43.94 
 
 		 139 aa  92  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3233  class I peptide chain release factor  48.06 
 
 		 140 aa  90.9  5e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.521154 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2547  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  42.42 
 
 		 139 aa  90.5  7e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.256849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4033  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  44.53 
 
 		 139 aa  90.5  7e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.471406  normal  0.87398 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4177  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  43.48 
 
 		 139 aa  90.1  8e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.378927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3557  Class I peptide chain release factor  48.78 
 
 		 140 aa  90.1  8e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.450326  normal  0.411853 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3167  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  45.04 
 
 		 139 aa  90.1  9e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.519033  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0012  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  42.61 
 
 		 137 aa  89.4  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1390  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  46.67 
 
 		 140 aa  88.6  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.884369 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0149  Class I peptide chain release factor  44.78 
 
 		 146 aa  88.6  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03851  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  33.33 
 
 		 138 aa  87.8  5e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.78098  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1970  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  36.51 
 
 		 137 aa  87.4  6e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0828493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53030  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  41.27 
 
 		 137 aa  87  8e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0097  class I peptide chain release factor  47.24 
 
 		 140 aa  86.7  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0026  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  45.67 
 
 		 139 aa  86.3  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1309  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  42.06 
 
 		 137 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.892435  normal  0.470671 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2666  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  44.53 
 
 		 139 aa  86.3  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3468  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  40.62 
 
 		 140 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.437856 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3342  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  42.97 
 
 		 140 aa  85.5  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1494  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  41.27 
 
 		 137 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.129787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1036  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  43.33 
 
 		 146 aa  85.1  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.501059  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1089  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  43.33 
 
 		 146 aa  85.1  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.900586  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3412  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  43.33 
 
 		 146 aa  85.1  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.44659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2409  class I peptide chain release factor  37.69 
 
 		 140 aa  85.1  3e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0842293  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3071  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  43.85 
 
 		 140 aa  85.1  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0202  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  40.94 
 
 		 136 aa  84.7  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.869706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4649  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  40.48 
 
 		 137 aa  84.3  6e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2836  class I peptide chain release factor  40.87 
 
 		 137 aa  84  7e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0185  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  39.84 
 
 		 140 aa  83.6  9e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0196  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  39.84 
 
 		 140 aa  83.6  9e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0194  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  39.84 
 
 		 140 aa  83.6  9e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03841  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  35.78 
 
 		 142 aa  83.2  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.300299  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00190  hypothetical protein  39.84 
 
 		 140 aa  82.8  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.40568  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3411  Class I peptide chain release factor  39.06 
 
 		 140 aa  82.8  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2102  Class I peptide chain release factor  43.51 
 
 		 141 aa  82.4  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3579  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  41.27 
 
 		 137 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.440076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2426  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  55.26 
 
 		 138 aa  82.4  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00189  hypothetical protein  39.84 
 
 		 140 aa  82.8  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.420944  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2471  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  55.26 
 
 		 138 aa  82.4  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.496568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1612  class I peptide chain release factor  43.51 
 
 		 141 aa  82.4  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.554845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0430  class I peptide chain release factor  43.33 
 
 		 141 aa  82  0.000000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3695  class I peptide chain release factor  42.42 
 
 		 143 aa  82  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.681232 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0203  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  39.06 
 
 		 140 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34690  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  42.19 
 
 		 137 aa  82  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.370131  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1818  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  40.48 
 
 		 137 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3468  class I peptide chain release factor  39.06 
 
 		 138 aa  81.6  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3760  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  40.16 
 
 		 137 aa  81.3  0.000000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000181211  normal  0.0838449 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1373  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.28 
 
 		 140 aa  80.9  0.000000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.150956 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2742  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  41.18 
 
 		 134 aa  80.9  0.000000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0464887 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4768  Class I peptide chain release factor  48.12 
 
 		 141 aa  80.1  0.000000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.561656  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1725  class I peptide chain release factor  37.59 
 
 		 140 aa  80.1  0.000000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0208717  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0332  class I peptide chain release factor  39.68 
 
 		 140 aa  80.1  0.000000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.451275  normal  0.841401 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0245  class I peptide chain release factor  38.76 
 
 		 140 aa  80.1  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.84131  normal  0.608303 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3229  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  40.48 
 
 		 137 aa  79.3  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.168853  normal  0.123551 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2298  class I peptide chain release factor  41.54 
 
 		 146 aa  80.1  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.956925 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3557  hypothetical protein  45.22 
 
 		 136 aa  79.3  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1709  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  41.27 
 
 		 139 aa  80.1  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.44949 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2164  Class I peptide chain release factor  37.3 
 
 		 137 aa  79.3  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0730  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.58 
 
 		 140 aa  79.3  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.460757  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1842  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  43.36 
 
 		 135 aa  79  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>