218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3059 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



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PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_3059  Class I peptide chain release factor  100 
 
 
146 aa  282  1.0000000000000001e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0504323  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3224  hypothetical protein  62.41 
 
 
139 aa  153  8e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6400  Class I peptide chain release factor  60.29 
 
 
140 aa  152  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0598  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  63.04 
 
 
147 aa  143  7.0000000000000006e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.104756  normal  0.0423062 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0828  class I peptide chain release factor  60 
 
 
143 aa  139  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.084227  normal  0.577316 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2589  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  52.59 
 
 
143 aa  134  4e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.139809 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0960  Class I peptide chain release factor  54.29 
 
 
145 aa  129  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1977  hypothetical protein  55 
 
 
147 aa  126  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0357  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  42.86 
 
 
142 aa  125  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.197907  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2137  Class I peptide chain release factor  63.91 
 
 
145 aa  123  1e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.157094  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0556  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  45.93 
 
 
140 aa  122  2e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.908284  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6855  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  58.96 
 
 
137 aa  122  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000218203  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28300  protein chain release factor B  60.74 
 
 
146 aa  121  3e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29401  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  47.41 
 
 
143 aa  120  5e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03851  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  40.74 
 
 
145 aa  120  8e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.472509  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2228  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  46.67 
 
 
146 aa  119  1.9999999999999998e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_13231  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  44.44 
 
 
140 aa  119  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.107731 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1249  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  65.77 
 
 
129 aa  117  4.9999999999999996e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.459871 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1139  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  66.07 
 
 
135 aa  114  5e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.668699  hitchhiker  0.0000255513 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37860  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  62.79 
 
 
141 aa  113  6.9999999999999995e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.259651 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14431  aminoacyl-tRNA hydrolase  44.36 
 
 
142 aa  112  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00134449 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03851  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  39.55 
 
 
138 aa  112  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.78098  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0672  Class I peptide chain release factor  57.36 
 
 
164 aa  110  6e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1190  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  52.94 
 
 
142 aa  110  9e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0102787  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03841  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  43.28 
 
 
142 aa  110  9e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.300299  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0582  Class I peptide chain release factor  53.03 
 
 
143 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14580  protein chain release factor B  61.9 
 
 
149 aa  108  3e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.024949  normal  0.100234 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22660  protein chain release factor B  54.33 
 
 
146 aa  106  1e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15800  hypothetical protein  59.06 
 
 
151 aa  103  8e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.25035  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1387  class I peptide chain release factor  61.11 
 
 
150 aa  102  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.443355  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3102  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  44 
 
 
144 aa  99.8  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.614248  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2426  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  60.31 
 
 
138 aa  96.7  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2471  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  60.31 
 
 
138 aa  96.7  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.496568  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0149  Class I peptide chain release factor  42.14 
 
 
146 aa  91.7  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1368  Class I peptide chain release factor  37.41 
 
 
151 aa  90.5  7e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.422423  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3695  class I peptide chain release factor  43.38 
 
 
143 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.681232 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0026  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  42.75 
 
 
139 aa  87.8  5e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0636  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  44.85 
 
 
143 aa  87  8e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00765778  normal  0.516786 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0179  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  41.61 
 
 
143 aa  86.7  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2737  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  41.91 
 
 
169 aa  85.5  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0024  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  44.85 
 
 
141 aa  85.1  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1366  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  44.85 
 
 
141 aa  84.3  5e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0034  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  44.85 
 
 
141 aa  84.3  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02765  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  39.57 
 
 
143 aa  83.2  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.489905  n/a   
 
 
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NC_009720  Xaut_0332  class I peptide chain release factor  40 
 
 
140 aa  83.2  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.451275  normal  0.841401 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2666  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  43.28 
 
 
139 aa  82  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1523  hypothetical protein  43.18 
 
 
141 aa  81.6  0.000000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.331021  normal  0.193244 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4856  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  41.84 
 
 
139 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1725  class I peptide chain release factor  38.81 
 
 
140 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0208717  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1373  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  37.59 
 
 
140 aa  80.9  0.000000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.150956 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0430  class I peptide chain release factor  41.8 
 
 
141 aa  80.9  0.000000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0097  class I peptide chain release factor  40.74 
 
 
140 aa  80.9  0.000000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1242  class I peptide chain release factor  41.04 
 
 
139 aa  79.7  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00357715 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2311  class I peptide chain release factor  36.64 
 
 
144 aa  79.7  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1970  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  33.33 
 
 
137 aa  78.2  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0828493  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3342  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  41.35 
 
 
140 aa  77  0.00000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2864  Class I peptide chain release factor  45.24 
 
 
137 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.10878  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2216  Class I peptide chain release factor  34.53 
 
 
136 aa  76.6  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_014151  Cfla_0979  Class I peptide chain release factor  55.91 
 
 
149 aa  75.9  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000812989 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4768  Class I peptide chain release factor  45.26 
 
 
141 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.561656  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0535  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  33.33 
 
 
140 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000252738  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4177  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  37.41 
 
 
139 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.378927  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1981  Class I peptide chain release factor  35.97 
 
 
136 aa  75.1  0.0000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000274722  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3428  Class I peptide chain release factor  46.15 
 
 
141 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0245  class I peptide chain release factor  35.34 
 
 
140 aa  74.3  0.0000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.84131  normal  0.608303 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4033  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.13 
 
 
139 aa  73.9  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.471406  normal  0.87398 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53030  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  36.43 
 
 
137 aa  73.9  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0512  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  34.33 
 
 
137 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3519  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  34.33 
 
 
137 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0512  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  34.33 
 
 
137 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4087  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  32.85 
 
 
142 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0634  class I peptide chain release factor  36.57 
 
 
140 aa  72.8  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2164  Class I peptide chain release factor  35.04 
 
 
137 aa  73.2  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4258  class I peptide chain release factor  46.27 
 
 
141 aa  72.8  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2547  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  36.43 
 
 
139 aa  72  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.256849  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2836  class I peptide chain release factor  39.67 
 
 
137 aa  72.8  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3473  class I peptide chain release factor  46.22 
 
 
122 aa  72  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.316087  normal  0.0864622 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3167  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  39.26 
 
 
139 aa  71.6  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.519033  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1494  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  34.53 
 
 
137 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.129787  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0041  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  40.85 
 
 
144 aa  71.2  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4649  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  35.71 
 
 
137 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0012  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  33.58 
 
 
137 aa  70.5  0.000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2493  class I peptide chain release factor  41.67 
 
 
132 aa  69.7  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.201964  normal  0.890427 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1495  class I peptide chain release factor  35.51 
 
 
137 aa  70.1  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000011773 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2409  class I peptide chain release factor  32.03 
 
 
140 aa  69.7  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0842293  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1390  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  40.34 
 
 
140 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.884369 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34690  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  35.71 
 
 
137 aa  70.1  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.370131  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3971  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  39.86 
 
 
146 aa  69.3  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0550  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  31.39 
 
 
137 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4614  Class I peptide chain release factor  34.88 
 
 
135 aa  68.9  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1147  Class I peptide chain release factor  37.41 
 
 
142 aa  68.9  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3592  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  32.12 
 
 
138 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_011365  Gdia_2541  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  37.5 
 
 
140 aa  68.9  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_011149  SeAg_B0281  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  35.92 
 
 
140 aa  68.2  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_011757  Mchl_3557  Class I peptide chain release factor  42.54 
 
 
140 aa  68.2  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.450326  normal  0.411853 
 
 
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NC_012850  Rleg_4298  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  39.55 
 
 
147 aa  68.2  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_011205  SeD_A0262  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  35.92 
 
 
140 aa  68.2  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.232254  normal  0.925704 
 
 
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NC_010172  Mext_3233  class I peptide chain release factor  42.54 
 
 
140 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.521154 
 
 
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NC_011080  SNSL254_A0262  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  35.92 
 
 
140 aa  68.2  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.430585  normal 
 
 
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NC_011083  SeHA_C0278  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  35.92 
 
 
140 aa  68.2  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.292576  normal  0.437885 
 
 
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