271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4614 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4614  Class I peptide chain release factor  100 
 
 		 135 aa  272  1.0000000000000001e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6283  class I peptide chain release factor  53.85 
 
 		 133 aa  127  4.0000000000000003e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.426377 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0416  Class I peptide chain release factor  48.44 
 
 		 132 aa  105  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1587  protein chain release factor B-like protein  47.33 
 
 		 133 aa  104  5e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0332  class I peptide chain release factor  45.45 
 
 		 140 aa  95.5  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.451275  normal  0.841401 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01530  peptidyl-tRNA hydrolase  43.09 
 
 		 135 aa  94.4  5e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1191  Class I peptide chain release factor  45.04 
 
 		 136 aa  94  6e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0097  class I peptide chain release factor  43.85 
 
 		 140 aa  92.8  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0179  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  44 
 
 		 143 aa  92.8  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3071  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  39.84 
 
 		 140 aa  92  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1373  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  42.37 
 
 		 140 aa  90.1  8e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.150956 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2666  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  45.83 
 
 		 139 aa  89.4  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2311  class I peptide chain release factor  42.06 
 
 		 144 aa  88.6  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0245  class I peptide chain release factor  39.71 
 
 		 140 aa  88.2  4e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.84131  normal  0.608303 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1151  peptide chain release factor  41.8 
 
 		 145 aa  87.4  5e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0636  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  45.6 
 
 		 143 aa  87.8  5e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00765778  normal  0.516786 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1523  hypothetical protein  42.48 
 
 		 141 aa  86.3  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.331021  normal  0.193244 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2352  class I peptide chain release factor  41.09 
 
 		 138 aa  86.3  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2164  Class I peptide chain release factor  39.37 
 
 		 137 aa  85.5  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3102  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  41.94 
 
 		 144 aa  85.1  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.614248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2216  Class I peptide chain release factor  42.28 
 
 		 136 aa  85.1  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1970  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  42.52 
 
 		 137 aa  84.7  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0828493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1036  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  40.16 
 
 		 146 aa  84.7  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.501059  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1089  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  40.16 
 
 		 146 aa  84.7  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.900586  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3412  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  40.16 
 
 		 146 aa  84.7  4e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.44659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1494  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  42.28 
 
 		 137 aa  84  6e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.129787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3428  Class I peptide chain release factor  40.34 
 
 		 141 aa  84  6e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0512  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  40 
 
 		 137 aa  84  6e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3519  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  40 
 
 		 137 aa  84  6e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0512  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  40 
 
 		 137 aa  84  6e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0149  Class I peptide chain release factor  40.46 
 
 		 146 aa  83.6  9e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2102  Class I peptide chain release factor  38.64 
 
 		 141 aa  82.8  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3579  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  42.28 
 
 		 137 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.440076  normal  1 
 
 
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NC_010717  PXO_02765  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  41.13 
 
 		 143 aa  82.8  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.489905  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1366  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  41.67 
 
 		 141 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1981  Class I peptide chain release factor  40.48 
 
 		 136 aa  82.8  0.000000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000274722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0034  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  41.67 
 
 		 141 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1612  class I peptide chain release factor  38.64 
 
 		 141 aa  82.8  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.554845  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0128  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  42.28 
 
 		 139 aa  82.4  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008228  Patl_2836  class I peptide chain release factor  37.7 
 
 		 137 aa  82  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2086  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  40.77 
 
 		 133 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1309  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  41.8 
 
 		 137 aa  82  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.892435  normal  0.470671 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2737  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  42.98 
 
 		 169 aa  81.6  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009428  Rsph17025_0024  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  42.5 
 
 		 141 aa  82  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1818  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  41.46 
 
 		 137 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010322  PputGB1_4041  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  40.65 
 
 		 137 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.733627 
 
 
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NC_008347  Mmar10_1242  class I peptide chain release factor  39.69 
 
 		 139 aa  81.3  0.000000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00357715 
 
 
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NC_009832  Spro_3760  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  40.16 
 
 		 137 aa  80.9  0.000000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000181211  normal  0.0838449 
 
 
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NC_009512  Pput_2442  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  40.5 
 
 		 137 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0547672  normal  0.232418 
 
 
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NC_006348  BMA1767  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  40 
 
 		 134 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009080  BMA10247_0474  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  40 
 
 		 134 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.578239  n/a   
 
 
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NC_009074  BURPS668_1388  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  40 
 
 		 134 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1392  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  40 
 
 		 134 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.367103  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0678  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  40 
 
 		 134 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.283064  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1191  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  40 
 
 		 134 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.273593  n/a   
 
 
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NC_007520  Tcr_0875  class I peptide chain release factor  38.58 
 
 		 138 aa  79.7  0.00000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.174449  n/a   
 
 
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NC_008825  Mpe_A3557  hypothetical protein  36.44 
 
 		 136 aa  79.7  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2849  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  39.2 
 
 		 134 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.10078  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3713  Class I peptide chain release factor  37.4 
 
 		 140 aa  80.1  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.116579 
 
 
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NC_009921  Franean1_0828  class I peptide chain release factor  37.3 
 
 		 143 aa  79.7  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.084227  normal  0.577316 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3592  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  40.98 
 
 		 138 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008390  Bamb_1100  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  39.23 
 
 		 134 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010002  Daci_2493  class I peptide chain release factor  37.88 
 
 		 132 aa  79.3  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.201964  normal  0.890427 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1100  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  39.23 
 
 		 134 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.910918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4325  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  39.23 
 
 		 134 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0375174  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2946  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  40.65 
 
 		 137 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.661173  normal  0.230853 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0513  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.89 
 
 		 137 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_010508  Bcenmc03_1190  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.35 
 
 		 134 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.285712  normal  0.465318 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0960  Class I peptide chain release factor  39.02 
 
 		 145 aa  78.6  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1522  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  39.2 
 
 		 134 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.876893  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1684  Class I peptide chain release factor  38.52 
 
 		 138 aa  78.6  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.270418  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3229  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  40.65 
 
 		 137 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.168853  normal  0.123551 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0550  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.02 
 
 		 137 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3468  class I peptide chain release factor  35.66 
 
 		 138 aa  78.6  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0736  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.35 
 
 		 134 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.564723  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3362  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  37.98 
 
 		 136 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.143651 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1217  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.35 
 
 		 134 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.29015  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0730  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.21 
 
 		 140 aa  77.8  0.00000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.460757  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3233  class I peptide chain release factor  40.46 
 
 		 140 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.521154 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1147  Class I peptide chain release factor  38.02 
 
 		 142 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1725  class I peptide chain release factor  36.8 
 
 		 140 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0208717  n/a   
 
 
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NC_007614  Nmul_A2409  class I peptide chain release factor  35.88 
 
 		 140 aa  77.4  0.00000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0842293  n/a   
 
 
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NC_013947  Snas_6400  Class I peptide chain release factor  34.92 
 
 		 140 aa  77.4  0.00000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009831  Ssed_4087  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  40.16 
 
 		 142 aa  77  0.00000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010681  Bphyt_1617  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  39.17 
 
 		 134 aa  76.6  0.00000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.599417 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3201  hypothetical protein  38.4 
 
 		 137 aa  76.6  0.00000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009901  Spea_0535  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  37.3 
 
 		 140 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000252738  n/a   
 
 
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NC_007951  Bxe_A2835  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  39.17 
 
 		 134 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007954  Sden_3284  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.58 
 
 		 138 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009719  Plav_0634  class I peptide chain release factor  37.5 
 
 		 140 aa  75.5  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007802  Jann_0026  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  40 
 
 		 139 aa  75.5  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.900765 
 
 
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NC_012791  Vapar_1842  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  34.11 
 
 		 135 aa  75.9  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011060  Ppha_1045  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.33 
 
 		 137 aa  75.1  0.0000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.290835  n/a   
 
 
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NC_009665  Shew185_3853  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  36.22 
 
 		 143 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008709  Ping_0890  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  34.35 
 
 		 138 aa  75.1  0.0000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.245575  normal  1 
 
 
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NC_011138  MADE_03821  hypothetical protein  39.68 
 
 		 138 aa  74.7  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007908  Rfer_1386  class I peptide chain release factor  38.1 
 
 		 141 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.402498  n/a   
 
 
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NC_007925  RPC_1390  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  36.67 
 
 		 140 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.884369 
 
 
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NC_007948  Bpro_1858  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.52 
 
 		 135 aa  74.3  0.0000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.102554  normal  0.117146 
 
 
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NC_011663  Sbal223_3797  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  36.22 
 
 		 143 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0177584  normal  1 
 
 
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