220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6283 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_6283  class I peptide chain release factor  100 
 
 		 133 aa  265  2e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.426377 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4614  Class I peptide chain release factor  53.85 
 
 		 135 aa  127  3e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1587  protein chain release factor B-like protein  47.37 
 
 		 133 aa  126  1.0000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0149  Class I peptide chain release factor  47.62 
 
 		 146 aa  111  4.0000000000000004e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0416  Class I peptide chain release factor  50.91 
 
 		 132 aa  106  8.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1151  peptide chain release factor  43.2 
 
 		 145 aa  105  3e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0430  class I peptide chain release factor  43.09 
 
 		 141 aa  102  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01530  peptidyl-tRNA hydrolase  42.22 
 
 		 135 aa  101  4e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0357  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  40.65 
 
 		 142 aa  95.5  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.197907  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0097  class I peptide chain release factor  42.15 
 
 		 140 aa  95.9  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0634  class I peptide chain release factor  42.5 
 
 		 140 aa  94.7  4e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1373  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  42.28 
 
 		 140 aa  93.6  8e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.150956 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3071  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  42.5 
 
 		 140 aa  92.8  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0512  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  39.67 
 
 		 137 aa  93.2  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3519  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  39.67 
 
 		 137 aa  93.2  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0512  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  39.67 
 
 		 137 aa  93.2  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0179  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  41.6 
 
 		 143 aa  91.7  3e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1191  Class I peptide chain release factor  39.67 
 
 		 136 aa  90.9  5e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2228  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  40.98 
 
 		 146 aa  90.1  9e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2164  Class I peptide chain release factor  38.71 
 
 		 137 aa  89.7  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0128  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  40.65 
 
 		 139 aa  89.4  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2666  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  39.52 
 
 		 139 aa  88.6  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2311  class I peptide chain release factor  38.52 
 
 		 144 aa  89.4  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3362  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  39.34 
 
 		 136 aa  88.6  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.143651 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3102  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  40.83 
 
 		 144 aa  87.8  4e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.614248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0245  class I peptide chain release factor  40.83 
 
 		 140 aa  88.2  4e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.84131  normal  0.608303 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3193  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  39.2 
 
 		 137 aa  87.4  6e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2742  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  41.6 
 
 		 134 aa  87.4  6e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0464887 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0513  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  37.19 
 
 		 137 aa  86.7  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02765  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  39.2 
 
 		 143 aa  86.3  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.489905  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1858  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  37.9 
 
 		 135 aa  85.9  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.102554  normal  0.117146 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03851  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  37.4 
 
 		 145 aa  85.9  2e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.472509  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4400  peptidyl-tRNA hydrolase domain-containing protein  40.65 
 
 		 137 aa  85.1  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.485154  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0012  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  40.8 
 
 		 137 aa  85.1  3e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4087  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.1 
 
 		 142 aa  84.7  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2547  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  36.07 
 
 		 139 aa  84.3  4e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.256849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1390  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.02 
 
 		 140 aa  84.3  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.884369 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2836  class I peptide chain release factor  40 
 
 		 137 aa  84.3  5e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0550  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  36.8 
 
 		 137 aa  84  6e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0838  class I peptide chain release factor  41.27 
 
 		 137 aa  84  7e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.329463 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3167  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  36 
 
 		 139 aa  84  7e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.519033  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2589  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  36.07 
 
 		 143 aa  83.2  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.139809 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2541  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  40.83 
 
 		 140 aa  83.2  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3797  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  37.3 
 
 		 143 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0177584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2864  Class I peptide chain release factor  35.48 
 
 		 137 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.10878  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3853  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  37.3 
 
 		 143 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3695  class I peptide chain release factor  36.29 
 
 		 143 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.681232 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0471  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  37.3 
 
 		 143 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00322425  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4177  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  36.67 
 
 		 139 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.378927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3284  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.1 
 
 		 138 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3428  Class I peptide chain release factor  39.13 
 
 		 141 aa  82  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1147  Class I peptide chain release factor  37.1 
 
 		 142 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1377  class I peptide chain release factor  40 
 
 		 138 aa  81.3  0.000000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000189898 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1981  Class I peptide chain release factor  36.29 
 
 		 136 aa  81.3  0.000000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000274722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3347  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  37.3 
 
 		 143 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0535  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  36.89 
 
 		 140 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000252738  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1190  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.17 
 
 		 134 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.285712  normal  0.465318 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2409  class I peptide chain release factor  36.07 
 
 		 140 aa  80.9  0.000000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0842293  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0867  class I peptide chain release factor  38.89 
 
 		 137 aa  81.3  0.000000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.485704  normal  0.838908 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0736  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.17 
 
 		 134 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.564723  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1217  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.17 
 
 		 134 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.29015  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03841  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  39.02 
 
 		 142 aa  80.9  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.300299  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4033  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  36.67 
 
 		 139 aa  80.9  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.471406  normal  0.87398 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3592  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  37.3 
 
 		 138 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3979  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  36.51 
 
 		 143 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3224  hypothetical protein  36.29 
 
 		 139 aa  80.1  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2849  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  37.4 
 
 		 134 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.10078  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3468  class I peptide chain release factor  35.71 
 
 		 138 aa  79.7  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1100  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  36.64 
 
 		 134 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2086  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  36.64 
 
 		 133 aa  79.3  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4325  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  37.4 
 
 		 134 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0375174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1495  class I peptide chain release factor  39.02 
 
 		 137 aa  79.3  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000011773 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1100  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  36.64 
 
 		 134 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.910918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1386  class I peptide chain release factor  37.1 
 
 		 141 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.402498  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03851  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  35.77 
 
 		 138 aa  79  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.78098  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2737  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  39.82 
 
 		 169 aa  78.6  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1644  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  43.55 
 
 		 131 aa  78.6  0.00000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.841832  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1242  class I peptide chain release factor  35.25 
 
 		 139 aa  78.2  0.00000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00357715 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1684  Class I peptide chain release factor  38.4 
 
 		 138 aa  78.6  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.270418  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1523  hypothetical protein  35 
 
 		 141 aa  77.8  0.00000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.331021  normal  0.193244 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1970  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  37.1 
 
 		 137 aa  77.8  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0828493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000501  class I peptide chain release factor  39.37 
 
 		 137 aa  77.8  0.00000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00818872  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3713  Class I peptide chain release factor  37.9 
 
 		 140 aa  78.2  0.00000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.116579 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1368  Class I peptide chain release factor  33.88 
 
 		 151 aa  77.8  0.00000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.422423  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0215  Class I peptide chain release factor  36.59 
 
 		 132 aa  77.8  0.00000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6400  Class I peptide chain release factor  36 
 
 		 140 aa  77.4  0.00000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1767  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  37.4 
 
 		 134 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1191  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  37.4 
 
 		 134 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.273593  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0678  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  37.4 
 
 		 134 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.283064  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1388  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  37.4 
 
 		 134 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1392  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  37.4 
 
 		 134 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.367103  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0474  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  37.4 
 
 		 134 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.578239  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2835  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  35.94 
 
 		 134 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2352  class I peptide chain release factor  35.2 
 
 		 138 aa  77.4  0.00000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2493  class I peptide chain release factor  36.07 
 
 		 132 aa  77  0.00000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.201964  normal  0.890427 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3201  hypothetical protein  39.84 
 
 		 137 aa  77  0.00000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1842  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  34.15 
 
 		 135 aa  76.6  0.00000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0536  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  42.74 
 
 		 131 aa  76.6  0.00000000000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00995879  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2102  Class I peptide chain release factor  35.43 
 
 		 141 aa  77  0.00000000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1612  class I peptide chain release factor  35.43 
 
 		 141 aa  77  0.00000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.554845  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>