279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_01530 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



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Plasmid unclonability p-value
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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_01530  peptidyl-tRNA hydrolase  100 
 
 		 135 aa  271  3e-72  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009441  Fjoh_1587  protein chain release factor B-like protein  45.04 
 
 		 133 aa  108  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008554  Sfum_2311  class I peptide chain release factor  42.52 
 
 		 144 aa  105  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010338  Caul_3071  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  43.31 
 
 		 140 aa  101  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6283  class I peptide chain release factor  42.22 
 
 		 133 aa  101  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.426377 
 
 
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NC_010581  Bind_0245  class I peptide chain release factor  44.96 
 
 		 140 aa  97.4  5e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.84131  normal  0.608303 
 
 
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NC_013037  Dfer_4614  Class I peptide chain release factor  43.09 
 
 		 135 aa  94.4  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3695  class I peptide chain release factor  37.7 
 
 		 143 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.681232 
 
 
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NC_007513  Syncc9902_2228  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  41.8 
 
 		 146 aa  91.3  4e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0430  class I peptide chain release factor  39.67 
 
 		 141 aa  90.9  5e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009976  P9211_14431  aminoacyl-tRNA hydrolase  41.54 
 
 		 142 aa  88.6  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134449 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0149  Class I peptide chain release factor  35.38 
 
 		 146 aa  88.2  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1523  hypothetical protein  37.61 
 
 		 141 aa  88.2  4e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.331021  normal  0.193244 
 
 
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NC_008255  CHU_1151  peptide chain release factor  39.37 
 
 		 145 aa  87.4  6e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007951  Bxe_A2835  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  37.7 
 
 		 134 aa  85.5  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009832  Spro_3760  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  40.48 
 
 		 137 aa  85.1  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000181211  normal  0.0838449 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1617  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  36.89 
 
 		 134 aa  84.7  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.599417 
 
 
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NC_007643  Rru_A0097  class I peptide chain release factor  37.21 
 
 		 140 aa  84  6e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009720  Xaut_0332  class I peptide chain release factor  35.94 
 
 		 140 aa  84  7e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.451275  normal  0.841401 
 
 
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CP001637  EcDH1_3411  Class I peptide chain release factor  37.9 
 
 		 140 aa  83.6  8e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013422  Hneap_0215  Class I peptide chain release factor  37.6 
 
 		 132 aa  83.6  9e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007778  RPB_4177  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  36.22 
 
 		 139 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.378927  normal  1 
 
 
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NC_009708  YpsIP31758_1036  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  37.9 
 
 		 146 aa  82.8  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.501059  n/a   
 
 
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NC_007958  RPD_4033  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  35.43 
 
 		 139 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.471406  normal  0.87398 
 
 
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NC_010159  YpAngola_A3412  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  37.9 
 
 		 146 aa  82.8  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.44659  normal  1 
 
 
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NC_010465  YPK_1089  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  37.9 
 
 		 146 aa  82.8  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.900586  n/a   
 
 
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NC_011205  SeD_A0262  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  37.9 
 
 		 140 aa  82  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.232254  normal  0.925704 
 
 
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NC_011149  SeAg_B0281  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  37.9 
 
 		 140 aa  82  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010498  EcSMS35_0203  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  37.1 
 
 		 140 aa  82  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011083  SeHA_C0278  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  37.9 
 
 		 140 aa  82  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.292576  normal  0.437885 
 
 
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NC_011094  SeSA_A0267  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  37.9 
 
 		 140 aa  82  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.122717 
 
 
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NC_011080  SNSL254_A0262  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  37.9 
 
 		 140 aa  82  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.430585  normal  1 
 
 
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NC_011365  Gdia_2541  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  35 
 
 		 140 aa  82.4  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011666  Msil_3713  Class I peptide chain release factor  38.71 
 
 		 140 aa  82.4  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.116579 
 
 
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NC_010803  Clim_2164  Class I peptide chain release factor  40.16 
 
 		 137 aa  81.6  0.000000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010468  EcolC_3468  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  37.1 
 
 		 140 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.437856 
 
 
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NC_011004  Rpal_4856  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  36.22 
 
 		 139 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008541  Arth_1977  hypothetical protein  35.48 
 
 		 147 aa  81.6  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009801  EcE24377A_0196  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  37.1 
 
 		 140 aa  81.6  0.000000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010658  SbBS512_E0185  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  37.1 
 
 		 140 aa  81.6  0.000000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007333  Tfu_1190  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.14 
 
 		 142 aa  81.3  0.000000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0102787  n/a   
 
 
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NC_011060  Ppha_1045  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  40.31 
 
 		 137 aa  81.3  0.000000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.290835  n/a   
 
 
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NC_009800  EcHS_A0194  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  37.1 
 
 		 140 aa  81.6  0.000000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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CP001509  ECD_00190  hypothetical protein  37.1 
 
 		 140 aa  80.9  0.000000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.40568  n/a   
 
 
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NC_012892  B21_00189  hypothetical protein  37.1 
 
 		 140 aa  80.9  0.000000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.420944  n/a   
 
 
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NC_009436  Ent638_0730  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  37.9 
 
 		 140 aa  80.9  0.000000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.460757  normal  1 
 
 
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NC_008463  PA14_53030  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  37.1 
 
 		 137 aa  80.1  0.000000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009656  PSPA7_4649  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  37.1 
 
 		 137 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007005  Psyr_3579  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  40.65 
 
 		 137 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.440076  normal  1 
 
 
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NC_011353  ECH74115_0202  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  36.67 
 
 		 136 aa  79.3  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.869706  normal  1 
 
 
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NC_010717  PXO_02765  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.4 
 
 		 143 aa  79.7  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.489905  n/a   
 
 
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NC_010725  Mpop_3428  Class I peptide chain release factor  36.52 
 
 		 141 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013457  VEA_000501  class I peptide chain release factor  39.84 
 
 		 137 aa  79.7  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00818872  n/a   
 
 
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NC_008347  Mmar10_1242  class I peptide chain release factor  37.21 
 
 		 139 aa  79.7  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00357715 
 
 
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NC_007514  Cag_1326  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  45.53 
 
 		 137 aa  79  0.00000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.000000000000388083  n/a   
 
 
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NC_007520  Tcr_0875  class I peptide chain release factor  38.58 
 
 		 138 aa  79  0.00000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.174449  n/a   
 
 
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NC_010506  Swoo_0550  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.02 
 
 		 137 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007925  RPC_1390  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  36.36 
 
 		 140 aa  79  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.884369 
 
 
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NC_008639  Cpha266_2352  class I peptide chain release factor  43.09 
 
 		 138 aa  79.3  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_004578  PSPTO_1818  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  39.84 
 
 		 137 aa  78.2  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007964  Nham_3167  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  36.36 
 
 		 139 aa  78.6  0.00000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.519033  n/a   
 
 
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NC_013947  Snas_6400  Class I peptide chain release factor  39.82 
 
 		 140 aa  78.2  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008820  P9303_29401  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  35.94 
 
 		 143 aa  78.2  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_009524  PsycPRwf_1377  class I peptide chain release factor  39.37 
 
 		 138 aa  78.2  0.00000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000189898 
 
 
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NC_007947  Mfla_2072  class I peptide chain release factor  35.61 
 
 		 138 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0774225  normal  0.971682 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1191  Class I peptide chain release factor  34.88 
 
 		 136 aa  78.2  0.00000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009665  Shew185_3853  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.58 
 
 		 143 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0179  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  37.5 
 
 		 143 aa  77.8  0.00000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05388  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  37.9 
 
 		 137 aa  77.8  0.00000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_014248  Aazo_2829  Class I peptide chain release factor  41.6 
 
 		 137 aa  77.8  0.00000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1970  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  37.4 
 
 		 137 aa  77.4  0.00000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0828493  normal  1 
 
 
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NC_009052  Sbal_0471  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.58 
 
 		 143 aa  77.4  0.00000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00322425  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3797  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.58 
 
 		 143 aa  77.4  0.00000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0177584  normal  1 
 
 
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NC_009511  Swit_1373  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  35.77 
 
 		 140 aa  77  0.00000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.150956 
 
 
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NC_008228  Patl_2836  class I peptide chain release factor  34.68 
 
 		 137 aa  77  0.00000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3592  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  37.8 
 
 		 138 aa  77  0.00000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2589  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  36.43 
 
 		 143 aa  77  0.00000000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.139809 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2547  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  33.6 
 
 		 139 aa  76.6  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.256849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1494  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  40.32 
 
 		 137 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.129787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2409  class I peptide chain release factor  38.52 
 
 		 140 aa  76.3  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0842293  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3201  hypothetical protein  36.8 
 
 		 137 aa  76.3  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009439  Pmen_1309  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.28 
 
 		 137 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.892435  normal  0.470671 
 
 
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NC_002947  PP_2946  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  37.7 
 
 		 137 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.661173  normal  0.230853 
 
 
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NC_002977  MCA0128  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  36.29 
 
 		 139 aa  75.9  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010322  PputGB1_4041  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.71 
 
 		 137 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.733627 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3979  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.58 
 
 		 143 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009831  Ssed_4087  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  36.22 
 
 		 142 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010551  BamMC406_1100  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  35.77 
 
 		 134 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.910918  normal  1 
 
 
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NC_007577  PMT9312_0357  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  37.01 
 
 		 142 aa  75.9  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.197907  n/a   
 
 
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NC_009438  Sputcn32_3347  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  37.8 
 
 		 143 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008390  Bamb_1100  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  35.77 
 
 		 134 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009719  Plav_0634  class I peptide chain release factor  34.38 
 
 		 140 aa  75.9  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011313  VSAL_II0012  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  35.94 
 
 		 137 aa  75.5  0.0000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012560  Avin_34690  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  34.11 
 
 		 137 aa  75.1  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.370131  n/a   
 
 
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NC_008781  Pnap_2742  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  37.4 
 
 		 134 aa  75.1  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0464887 
 
 
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NC_013739  Cwoe_0140  Class I peptide chain release factor  33.59 
 
 		 133 aa  74.7  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009092  Shew_3362  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  36.89 
 
 		 136 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.143651 
 
 
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NC_013223  Dret_1147  Class I peptide chain release factor  37.17 
 
 		 142 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013132  Cpin_0416  Class I peptide chain release factor  35.45 
 
 		 132 aa  74.7  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013889  TK90_1772  Class I peptide chain release factor  34.96 
 
 		 139 aa  74.7  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0992468  normal  0.67648 
 
 
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