270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_2228 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_2228  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  100 
 
 		 146 aa  291  1e-78  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2589  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  63.38 
 
 		 143 aa  184  3e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.139809 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29401  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  51.43 
 
 		 143 aa  151  2.9999999999999998e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3224  hypothetical protein  50.75 
 
 		 139 aa  136  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14431  aminoacyl-tRNA hydrolase  47.14 
 
 		 142 aa  135  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134449 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_13231  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  46.76 
 
 		 140 aa  132  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.107731 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0556  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  46.04 
 
 		 140 aa  130  5e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.908284  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0828  class I peptide chain release factor  48.89 
 
 		 143 aa  124  6e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.084227  normal  0.577316 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03851  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  42.11 
 
 		 138 aa  117  6e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.78098  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6400  Class I peptide chain release factor  48.8 
 
 		 140 aa  116  9e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0960  Class I peptide chain release factor  50.81 
 
 		 145 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0598  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  46.04 
 
 		 147 aa  110  6e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.104756  normal  0.0423062 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0357  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.06 
 
 		 142 aa  107  6e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.197907  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03851  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.81 
 
 		 145 aa  105  2e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.472509  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1190  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  44.62 
 
 		 142 aa  104  4e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0102787  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3695  class I peptide chain release factor  43.61 
 
 		 143 aa  102  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.681232 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3102  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  47.52 
 
 		 144 aa  101  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.614248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1977  hypothetical protein  44.2 
 
 		 147 aa  101  3e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2311  class I peptide chain release factor  45.04 
 
 		 144 aa  100  6e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0245  class I peptide chain release factor  48.12 
 
 		 140 aa  100  9e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.84131  normal  0.608303 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1587  protein chain release factor B-like protein  45.53 
 
 		 133 aa  99.4  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1970  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  44.03 
 
 		 137 aa  99.4  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0828493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0636  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  46.62 
 
 		 143 aa  98.6  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00765778  normal  0.516786 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0149  Class I peptide chain release factor  46.04 
 
 		 146 aa  97.8  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0430  class I peptide chain release factor  42.22 
 
 		 141 aa  97.1  7e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3592  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  42.22 
 
 		 138 aa  94.7  4e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2137  Class I peptide chain release factor  48.48 
 
 		 145 aa  94.4  5e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.157094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28300  protein chain release factor B  48.53 
 
 		 146 aa  94.4  5e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03841  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.81 
 
 		 142 aa  93.6  7e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.300299  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53030  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  42.86 
 
 		 137 aa  93.6  7e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4649  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  42.86 
 
 		 137 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2541  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  44.12 
 
 		 140 aa  92.8  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0582  Class I peptide chain release factor  47.24 
 
 		 143 aa  92  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14580  protein chain release factor B  46.83 
 
 		 149 aa  92  2e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.024949  normal  0.100234 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3284  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  40 
 
 		 138 aa  91.3  4e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01530  peptidyl-tRNA hydrolase  41.8 
 
 		 135 aa  91.3  4e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1523  hypothetical protein  45.04 
 
 		 141 aa  90.9  5e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.331021  normal  0.193244 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1494  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  43.61 
 
 		 137 aa  90.5  6e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.129787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1366  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  43.08 
 
 		 141 aa  90.1  8e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0034  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  43.08 
 
 		 141 aa  90.1  9e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6283  class I peptide chain release factor  40.98 
 
 		 133 aa  90.1  9e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.426377 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0024  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  43.08 
 
 		 141 aa  89.7  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0332  class I peptide chain release factor  39.86 
 
 		 140 aa  89.7  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.451275  normal  0.841401 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3579  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  43.61 
 
 		 137 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.440076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0179  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  43.38 
 
 		 143 aa  89  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1818  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  42.86 
 
 		 137 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0097  class I peptide chain release factor  39.29 
 
 		 140 aa  88.6  3e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3713  Class I peptide chain release factor  42.97 
 
 		 140 aa  88.6  3e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.116579 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1309  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  42.11 
 
 		 137 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.892435  normal  0.470671 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3362  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  41.41 
 
 		 136 aa  87.4  6e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.143651 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3468  class I peptide chain release factor  41.8 
 
 		 138 aa  87.4  6e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2829  Class I peptide chain release factor  41.54 
 
 		 137 aa  87.4  6e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2126  Class I peptide chain release factor  42.75 
 
 		 134 aa  86.7  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.44766  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0535  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  40 
 
 		 140 aa  86.3  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000252738  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4325  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  42.19 
 
 		 134 aa  85.9  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0375174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2666  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  45.04 
 
 		 139 aa  86.7  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1368  Class I peptide chain release factor  39.58 
 
 		 151 aa  86.3  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.422423  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2737  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  45.67 
 
 		 169 aa  85.9  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22660  protein chain release factor B  43.31 
 
 		 146 aa  85.1  3e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0026  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  41.54 
 
 		 139 aa  85.1  3e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1190  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  41.41 
 
 		 134 aa  84.3  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.285712  normal  0.465318 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0736  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  41.41 
 
 		 134 aa  84.3  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.564723  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1217  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  41.41 
 
 		 134 aa  84.3  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.29015  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2547  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  41.79 
 
 		 139 aa  84.3  5e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.256849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0672  Class I peptide chain release factor  43.2 
 
 		 164 aa  84.3  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2086  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  41.41 
 
 		 133 aa  84.3  5e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4856  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  41.43 
 
 		 139 aa  84  6e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2216  Class I peptide chain release factor  41.54 
 
 		 136 aa  84  6e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0512  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  40.15 
 
 		 137 aa  84  6e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3519  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  40.15 
 
 		 137 aa  84  6e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0512  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  40.15 
 
 		 137 aa  84  6e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3167  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  43.65 
 
 		 139 aa  84  7e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.519033  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3557  hypothetical protein  45.22 
 
 		 136 aa  84  7e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1100  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  41.41 
 
 		 134 aa  83.6  8e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2919  class I peptide chain release factor  44.14 
 
 		 137 aa  83.6  8e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0177067  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2409  class I peptide chain release factor  40 
 
 		 140 aa  83.6  9e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0842293  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2836  class I peptide chain release factor  38.06 
 
 		 137 aa  83.6  9e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3428  Class I peptide chain release factor  44.83 
 
 		 141 aa  82.8  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1100  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  41.41 
 
 		 134 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.910918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4177  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  40 
 
 		 139 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.378927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0012  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  36.57 
 
 		 137 aa  83.2  0.000000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4087  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  37.78 
 
 		 142 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2102  Class I peptide chain release factor  43.55 
 
 		 141 aa  82  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0875  class I peptide chain release factor  40.71 
 
 		 138 aa  82.8  0.000000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.174449  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2164  Class I peptide chain release factor  41.04 
 
 		 137 aa  82.4  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3201  hypothetical protein  38.35 
 
 		 137 aa  82  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4033  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  40.71 
 
 		 139 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.471406  normal  0.87398 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1151  peptide chain release factor  42.62 
 
 		 145 aa  82.4  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02765  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  43.51 
 
 		 143 aa  82  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.489905  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1612  class I peptide chain release factor  43.55 
 
 		 141 aa  82  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.554845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3797  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.52 
 
 		 143 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0177584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1725  class I peptide chain release factor  41.61 
 
 		 140 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0208717  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1495  class I peptide chain release factor  39.26 
 
 		 137 aa  81.6  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000011773 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0471  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.52 
 
 		 143 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00322425  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3347  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.52 
 
 		 143 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6855  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  41.98 
 
 		 137 aa  81.3  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000218203  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2442  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  41.35 
 
 		 137 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0547672  normal  0.232418 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0513  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  39.39 
 
 		 137 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2493  class I peptide chain release factor  42.62 
 
 		 132 aa  80.5  0.000000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.201964  normal  0.890427 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3059  Class I peptide chain release factor  46.67 
 
 		 146 aa  80.5  0.000000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0504323  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>