253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0582 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_0582  Class I peptide chain release factor  100 
 
 
143 aa  280  5.000000000000001e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6400  Class I peptide chain release factor  60.29 
 
 
140 aa  155  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3224  hypothetical protein  60.29 
 
 
139 aa  152  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0828  class I peptide chain release factor  56.12 
 
 
143 aa  140  5e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.084227  normal  0.577316 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0960  Class I peptide chain release factor  59.69 
 
 
145 aa  139  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1190  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  55.73 
 
 
142 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0102787  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0598  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  59.38 
 
 
147 aa  125  3e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.104756  normal  0.0423062 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37860  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  60 
 
 
141 aa  120  5e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.259651 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1139  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  66.3 
 
 
135 aa  119  9.999999999999999e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.668699  hitchhiker  0.0000255513 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02765  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  51.43 
 
 
143 aa  118  3.9999999999999996e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.489905  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2589  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  48.15 
 
 
143 aa  115  1.9999999999999998e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.139809 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1249  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  65.77 
 
 
129 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.459871 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29401  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  45.93 
 
 
143 aa  114  3e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0672  Class I peptide chain release factor  57.25 
 
 
164 aa  114  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_13231  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  41.3 
 
 
140 aa  113  7.999999999999999e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.107731 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3102  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  47.14 
 
 
144 aa  113  8.999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.614248  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1523  hypothetical protein  50.37 
 
 
141 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.331021  normal  0.193244 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0179  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  49.29 
 
 
143 aa  112  1.0000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2137  Class I peptide chain release factor  54.48 
 
 
145 aa  110  5e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.157094  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1977  hypothetical protein  50.76 
 
 
147 aa  110  5e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0556  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  40.58 
 
 
140 aa  109  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.908284  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3284  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  40.29 
 
 
138 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3592  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  39.57 
 
 
138 aa  106  9.000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0535  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  41.18 
 
 
140 aa  106  1e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000252738  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2228  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  47.24 
 
 
146 aa  105  2e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6855  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  50 
 
 
137 aa  105  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000218203  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1373  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  46.1 
 
 
140 aa  104  4e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.150956 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0512  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  40.58 
 
 
137 aa  104  4e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3519  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  40.58 
 
 
137 aa  104  4e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0512  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  40.58 
 
 
137 aa  104  4e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4087  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.13 
 
 
142 aa  103  6e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0513  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  41.35 
 
 
137 aa  103  8e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0430  class I peptide chain release factor  49.63 
 
 
141 aa  103  8e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0357  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  36.84 
 
 
142 aa  102  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.197907  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0097  class I peptide chain release factor  47.73 
 
 
140 aa  102  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03851  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  36.84 
 
 
145 aa  103  1e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.472509  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0202  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  46.15 
 
 
136 aa  100  6e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.869706  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3760  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  46.92 
 
 
137 aa  100  7e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000181211  normal  0.0838449 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3713  Class I peptide chain release factor  48.84 
 
 
140 aa  100  7e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.116579 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1495  class I peptide chain release factor  42.34 
 
 
137 aa  100  8e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000011773 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0332  class I peptide chain release factor  48 
 
 
140 aa  100  8e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.451275  normal  0.841401 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3071  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  50.41 
 
 
140 aa  99.8  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0471  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.62 
 
 
143 aa  99.8  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00322425  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3797  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.62 
 
 
143 aa  99.8  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0177584  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3468  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  46.09 
 
 
140 aa  99.4  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.437856 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3411  Class I peptide chain release factor  46.77 
 
 
140 aa  99.4  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3853  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.62 
 
 
143 aa  99  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0203  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  46.77 
 
 
140 aa  99  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2737  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  46.83 
 
 
169 aa  99  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0550  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.24 
 
 
137 aa  99  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3362  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  40.15 
 
 
136 aa  99  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.143651 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3193  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  41.54 
 
 
137 aa  99  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3347  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.62 
 
 
143 aa  99  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1036  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  45.11 
 
 
146 aa  98.2  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.501059  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1494  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  44.53 
 
 
137 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.129787  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1089  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  45.11 
 
 
146 aa  98.2  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.900586  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0636  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  48.09 
 
 
143 aa  98.6  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00765778  normal  0.516786 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03851  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  36.92 
 
 
138 aa  98.6  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.78098  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3412  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  45.11 
 
 
146 aa  98.2  3e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.44659  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00190  hypothetical protein  45.97 
 
 
140 aa  97.8  5e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.40568  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00189  hypothetical protein  45.97 
 
 
140 aa  97.8  5e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.420944  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0185  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  45.97 
 
 
140 aa  97.8  5e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0196  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  45.97 
 
 
140 aa  97.8  5e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0194  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  45.97 
 
 
140 aa  97.8  5e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1147  Class I peptide chain release factor  49.18 
 
 
142 aa  97.1  8e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0730  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  45.04 
 
 
140 aa  96.7  9e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.460757  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2541  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  43.97 
 
 
140 aa  96.7  9e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3979  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  37.93 
 
 
143 aa  96.3  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0026  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  44.44 
 
 
139 aa  96.7  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4041  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  43.85 
 
 
137 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.733627 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0245  class I peptide chain release factor  43.8 
 
 
140 aa  95.9  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.84131  normal  0.608303 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4649  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  43.75 
 
 
137 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1725  class I peptide chain release factor  45.74 
 
 
140 aa  95.1  3e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0208717  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22660  protein chain release factor B  50.96 
 
 
146 aa  95.1  3e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1045  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  41.35 
 
 
137 aa  95.1  3e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.290835  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1368  Class I peptide chain release factor  41.79 
 
 
151 aa  94.7  4e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.422423  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0281  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  43.08 
 
 
140 aa  94  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0262  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  43.08 
 
 
140 aa  94  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.232254  normal  0.925704 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0278  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  43.08 
 
 
140 aa  94  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.292576  normal  0.437885 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0262  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  43.08 
 
 
140 aa  94  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.430585  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0267  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  43.08 
 
 
140 aa  94  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.122717 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0634  class I peptide chain release factor  45.99 
 
 
140 aa  94  6e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4768  Class I peptide chain release factor  53.79 
 
 
141 aa  94  7e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.561656  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3695  class I peptide chain release factor  42.86 
 
 
143 aa  93.6  8e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.681232 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1970  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  40.6 
 
 
137 aa  93.6  9e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0828493  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0875  class I peptide chain release factor  40.62 
 
 
138 aa  93.6  9e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.174449  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3229  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  43.75 
 
 
137 aa  93.6  9e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.168853  normal  0.123551 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53030  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  42.97 
 
 
137 aa  93.6  9e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2946  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  43.08 
 
 
137 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.661173  normal  0.230853 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3059  Class I peptide chain release factor  53.03 
 
 
146 aa  92.8  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0504323  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2442  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  43.08 
 
 
137 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0547672  normal  0.232418 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4258  class I peptide chain release factor  53.79 
 
 
141 aa  92  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2666  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  44.27 
 
 
139 aa  92  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3428  Class I peptide chain release factor  52.99 
 
 
141 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0024  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  47.33 
 
 
141 aa  92  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1772  Class I peptide chain release factor  46.09 
 
 
139 aa  91.3  4e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0992468  normal  0.67648 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15800  hypothetical protein  46.83 
 
 
151 aa  91.3  5e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.25035  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3201  hypothetical protein  39.13 
 
 
137 aa  90.9  6e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03841  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.35 
 
 
142 aa  90.5  6e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.300299  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000501  class I peptide chain release factor  42.11 
 
 
137 aa  90.5  6e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00818872  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>