224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_03851 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008816  A9601_03851  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  100 
 
 		 145 aa  286  8e-77  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.472509  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0357  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  87.32 
 
 		 142 aa  251  3e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.197907  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03841  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  83.8 
 
 		 142 aa  219  9.999999999999999e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.300299  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03851  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  58.39 
 
 		 138 aa  167  3e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.78098  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0556  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  51.43 
 
 		 140 aa  147  5e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.908284  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_13231  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  53.33 
 
 		 140 aa  146  8e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.107731 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14431  aminoacyl-tRNA hydrolase  49.63 
 
 		 142 aa  137  7e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134449 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29401  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  45.52 
 
 		 143 aa  124  4.0000000000000003e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1977  hypothetical protein  40.44 
 
 		 147 aa  122  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2589  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  41.04 
 
 		 143 aa  121  3e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.139809 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0828  class I peptide chain release factor  36.84 
 
 		 143 aa  108  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.084227  normal  0.577316 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6400  Class I peptide chain release factor  35.77 
 
 		 140 aa  108  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2228  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.81 
 
 		 146 aa  105  2e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3224  hypothetical protein  36.84 
 
 		 139 aa  104  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0960  Class I peptide chain release factor  32.03 
 
 		 145 aa  96.3  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0598  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  39.26 
 
 		 147 aa  95.9  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.104756  normal  0.0423062 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0582  Class I peptide chain release factor  36.84 
 
 		 143 aa  92  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0140  Class I peptide chain release factor  35.29 
 
 		 133 aa  91.7  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1495  class I peptide chain release factor  38.64 
 
 		 137 aa  91.7  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000011773 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37860  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  39.5 
 
 		 141 aa  91.3  4e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.259651 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15800  hypothetical protein  34.03 
 
 		 151 aa  91.3  4e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.25035  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3059  Class I peptide chain release factor  41.04 
 
 		 146 aa  90.5  8e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0504323  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1045  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  35.61 
 
 		 137 aa  90.1  8e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.290835  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1970  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  37.31 
 
 		 137 aa  90.1  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0828493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3102  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.81 
 
 		 144 aa  88.6  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.614248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1587  protein chain release factor B-like protein  44.35 
 
 		 133 aa  89.4  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0513  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  35.34 
 
 		 137 aa  88.2  4e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4087  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  35.51 
 
 		 142 aa  87.8  4e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0512  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  36.09 
 
 		 137 aa  87.8  4e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3519  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  36.09 
 
 		 137 aa  87.8  4e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0512  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  36.09 
 
 		 137 aa  87.8  4e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2137  Class I peptide chain release factor  37.59 
 
 		 145 aa  87.4  5e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.157094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3362  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  35.71 
 
 		 136 aa  87.4  6e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.143651 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0097  class I peptide chain release factor  37.31 
 
 		 140 aa  87  7e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6855  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  34.56 
 
 		 137 aa  87  8e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000218203  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3592  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  36.11 
 
 		 138 aa  87  8e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3695  class I peptide chain release factor  34.07 
 
 		 143 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.681232 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1190  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  33.06 
 
 		 142 aa  86.3  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0102787  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6283  class I peptide chain release factor  37.4 
 
 		 133 aa  85.9  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.426377 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2311  class I peptide chain release factor  36.3 
 
 		 144 aa  85.5  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2836  class I peptide chain release factor  38.06 
 
 		 137 aa  84.7  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0535  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  35.51 
 
 		 140 aa  85.1  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000252738  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3284  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  35.25 
 
 		 138 aa  83.6  8e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0550  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  36.09 
 
 		 137 aa  83.6  9e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28300  protein chain release factor B  35.97 
 
 		 146 aa  83.2  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2737  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.58 
 
 		 169 aa  82.4  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22660  protein chain release factor B  33.85 
 
 		 146 aa  82.4  0.000000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14580  protein chain release factor B  35.16 
 
 		 149 aa  82.4  0.000000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.024949  normal  0.100234 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53030  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  34.33 
 
 		 137 aa  81.6  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0026  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  37.12 
 
 		 139 aa  81.3  0.000000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4649  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  33.58 
 
 		 137 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0149  Class I peptide chain release factor  35.04 
 
 		 146 aa  80.5  0.000000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0024  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  37.78 
 
 		 141 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1366  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  39.02 
 
 		 141 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0636  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  36.84 
 
 		 143 aa  79.7  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00765778  normal  0.516786 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0034  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  39.02 
 
 		 141 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3760  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  31.34 
 
 		 137 aa  79  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000181211  normal  0.0838449 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1139  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  39.56 
 
 		 135 aa  78.2  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.668699  hitchhiker  0.0000255513 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3342  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  36.3 
 
 		 140 aa  78.2  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0179  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  36.09 
 
 		 143 aa  78.6  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29491  hypothetical protein  62.96 
 
 		 106 aa  78.6  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4856  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  31.82 
 
 		 139 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0875  class I peptide chain release factor  36.57 
 
 		 138 aa  77.8  0.00000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.174449  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3347  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  33.57 
 
 		 143 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3797  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  33.57 
 
 		 143 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0177584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3193  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  34.53 
 
 		 137 aa  77.4  0.00000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0471  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  33.57 
 
 		 143 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00322425  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0672  Class I peptide chain release factor  41.86 
 
 		 164 aa  77.8  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1249  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  40.23 
 
 		 129 aa  77.4  0.00000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.459871 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34690  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  30.6 
 
 		 137 aa  77.4  0.00000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.370131  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02765  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  35.34 
 
 		 143 aa  77  0.00000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.489905  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0634  class I peptide chain release factor  34.59 
 
 		 140 aa  76.6  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3713  Class I peptide chain release factor  33.59 
 
 		 140 aa  76.6  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.116579 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2352  class I peptide chain release factor  32.82 
 
 		 138 aa  76.6  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1036  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  32.09 
 
 		 146 aa  75.9  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.501059  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1089  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  32.09 
 
 		 146 aa  75.9  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.900586  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2102  Class I peptide chain release factor  29.92 
 
 		 141 aa  75.5  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3412  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  32.09 
 
 		 146 aa  75.9  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.44659  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1842  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  30.16 
 
 		 135 aa  75.5  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3853  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  32.87 
 
 		 143 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2742  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  32.03 
 
 		 134 aa  75.9  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0464887 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1612  class I peptide chain release factor  29.92 
 
 		 141 aa  75.5  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.554845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2493  class I peptide chain release factor  29.6 
 
 		 132 aa  75.5  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.201964  normal  0.890427 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2216  Class I peptide chain release factor  34.09 
 
 		 136 aa  75.5  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3979  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  32.87 
 
 		 143 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1373  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  34.07 
 
 		 140 aa  74.7  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.150956 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0730  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  29.85 
 
 		 140 aa  74.7  0.0000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.460757  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3468  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  30.3 
 
 		 140 aa  73.9  0.0000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.437856 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2829  Class I peptide chain release factor  35.07 
 
 		 137 aa  73.9  0.0000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2409  class I peptide chain release factor  33.33 
 
 		 140 aa  73.9  0.0000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0842293  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3071  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  36.5 
 
 		 140 aa  73.9  0.0000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2864  Class I peptide chain release factor  34.85 
 
 		 137 aa  73.6  0.0000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.10878  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0196  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  30.3 
 
 		 140 aa  73.6  0.0000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0194  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  30.3 
 
 		 140 aa  73.6  0.0000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0185  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  30.3 
 
 		 140 aa  73.6  0.0000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1368  Class I peptide chain release factor  33.58 
 
 		 151 aa  73.6  0.0000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.422423  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1494  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  34.33 
 
 		 137 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.129787  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00189  hypothetical protein  30.3 
 
 		 140 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.420944  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1326  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.81 
 
 		 137 aa  73.6  0.000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.000000000000388083  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1858  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  29.77 
 
 		 135 aa  73.2  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.102554  normal  0.117146 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>