87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_29491 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_29491  hypothetical protein  100 
 
 		 106 aa  215  1e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2589  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  68.42 
 
 		 143 aa  86.7  1e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.139809 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29401  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  67.92 
 
 		 143 aa  85.5  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14431  aminoacyl-tRNA hydrolase  67.92 
 
 		 142 aa  82.8  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134449 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03841  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  66.04 
 
 		 142 aa  81.3  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.300299  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0357  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  64.15 
 
 		 142 aa  79.7  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.197907  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03851  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  62.96 
 
 		 145 aa  78.6  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.472509  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3224  hypothetical protein  72 
 
 		 139 aa  76.3  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0672  Class I peptide chain release factor  80.49 
 
 		 164 aa  73.6  0.0000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0598  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  73.91 
 
 		 147 aa  73.2  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.104756  normal  0.0423062 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03851  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  54.55 
 
 		 138 aa  72.8  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.78098  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_13231  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  51.72 
 
 		 140 aa  71.6  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.107731 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1139  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  76.74 
 
 		 135 aa  70.9  0.000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.668699  hitchhiker  0.0000255513 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6400  Class I peptide chain release factor  60.38 
 
 		 140 aa  70.9  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2137  Class I peptide chain release factor  60 
 
 		 145 aa  70.5  0.000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.157094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0556  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  50 
 
 		 140 aa  68.2  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.908284  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1977  hypothetical protein  58.18 
 
 		 147 aa  67.4  0.00000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1387  class I peptide chain release factor  54.05 
 
 		 150 aa  66.6  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.443355  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1249  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  83.78 
 
 		 129 aa  66.6  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.459871 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14580  protein chain release factor B  62 
 
 		 149 aa  66.2  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.024949  normal  0.100234 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28300  protein chain release factor B  66.67 
 
 		 146 aa  65.9  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3059  Class I peptide chain release factor  73.17 
 
 		 146 aa  65.5  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0504323  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37860  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  63.27 
 
 		 141 aa  62.4  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.259651 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0828  class I peptide chain release factor  75.68 
 
 		 143 aa  62  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.084227  normal  0.577316 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0979  Class I peptide chain release factor  60.87 
 
 		 149 aa  61.6  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000812989 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2228  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  51.79 
 
 		 146 aa  61.6  0.000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6855  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  65.12 
 
 		 137 aa  61.2  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000218203  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15800  hypothetical protein  65.22 
 
 		 151 aa  60.8  0.000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.25035  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22660  protein chain release factor B  63.04 
 
 		 146 aa  59.7  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0140  Class I peptide chain release factor  53.85 
 
 		 133 aa  59.3  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2471  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  74.36 
 
 		 138 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.496568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2426  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  74.36 
 
 		 138 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0960  Class I peptide chain release factor  63.16 
 
 		 145 aa  57  0.00000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0582  Class I peptide chain release factor  61.9 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1242  class I peptide chain release factor  54.35 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00357715 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1190  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  51.06 
 
 		 142 aa  51.2  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0102787  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1373  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  51.11 
 
 		 140 aa  51.6  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.150956 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2311  class I peptide chain release factor  52 
 
 		 144 aa  50.1  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0512  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.46 
 
 		 137 aa  49.7  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3519  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.46 
 
 		 137 aa  49.7  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0512  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.46 
 
 		 137 aa  49.7  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0513  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  40.43 
 
 		 137 aa  50.1  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3592  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.3 
 
 		 138 aa  49.3  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3193  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  40.43 
 
 		 137 aa  48.9  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0202  hypothetical protein  38.2 
 
 		 143 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3362  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  40.43 
 
 		 136 aa  47.8  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.143651 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2737  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  52.17 
 
 		 169 aa  47.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3102  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  52.17 
 
 		 144 aa  47.4  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.614248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3853  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  34.62 
 
 		 143 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1725  class I peptide chain release factor  45.9 
 
 		 140 aa  47.4  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0208717  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0471  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  36.17 
 
 		 143 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00322425  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3797  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  36.17 
 
 		 143 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0177584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3979  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  36.17 
 
 		 143 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3347  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  36.17 
 
 		 143 aa  46.2  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0535  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  36.54 
 
 		 140 aa  45.8  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000252738  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1368  Class I peptide chain release factor  47.5 
 
 		 151 aa  45.8  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.422423  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0245  class I peptide chain release factor  51.11 
 
 		 140 aa  45.4  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.84131  normal  0.608303 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1147  Class I peptide chain release factor  46.81 
 
 		 142 aa  45.1  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0097  class I peptide chain release factor  46.67 
 
 		 140 aa  45.1  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3284  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  36.17 
 
 		 138 aa  44.7  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4087  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  34.04 
 
 		 142 aa  44.7  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02765  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  52 
 
 		 143 aa  44.3  0.0006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.489905  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6283  class I peptide chain release factor  46.15 
 
 		 133 aa  43.9  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.426377 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0636  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  44 
 
 		 143 aa  43.5  0.0009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00765778  normal  0.516786 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0179  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  48.89 
 
 		 143 aa  43.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0550  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  34.04 
 
 		 137 aa  43.5  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3501  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  44.68 
 
 		 143 aa  42.4  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0034  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  46 
 
 		 141 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1405  peptide chain release factor 2  66.67 
 
 		 368 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.577289  normal  0.45049 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1366  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  46 
 
 		 141 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0024  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  46 
 
 		 141 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4856  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  46.51 
 
 		 139 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0332  class I peptide chain release factor  46.67 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.451275  normal  0.841401 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0149  Class I peptide chain release factor  44.9 
 
 		 146 aa  42  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0246  release factors family protein  51.43 
 
 		 134 aa  42  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3498  peptide chain release factor 1  61.29 
 
 		 383 aa  41.6  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.235925  normal  0.417099 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1045  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  35.85 
 
 		 137 aa  41.2  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.290835  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1587  protein chain release factor B-like protein  54.05 
 
 		 133 aa  41.2  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0416  Class I peptide chain release factor  45.24 
 
 		 132 aa  40.8  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1523  hypothetical protein  42.22 
 
 		 141 aa  40.8  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.331021  normal  0.193244 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1732  peptide chain release factor 2  63.33 
 
 		 369 aa  40.8  0.006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0981  peptide chain release factor 2  60 
 
 		 373 aa  40.4  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.454282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3254  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  44.44 
 
 		 144 aa  40.4  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1981  Class I peptide chain release factor  32.05 
 
 		 136 aa  40.4  0.008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000274722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0944  peptide chain release factor 2  66.67 
 
 		 367 aa  40  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1970  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  36.17 
 
 		 137 aa  40  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0828493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0536  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  40 
 
 		 131 aa  40  0.01  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00995879  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>