265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1387 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1387  class I peptide chain release factor  100 
 
 		 150 aa  289  9e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.443355  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22660  protein chain release factor B  60.33 
 
 		 146 aa  132  9.999999999999999e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6400  Class I peptide chain release factor  59.06 
 
 		 140 aa  132  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3224  hypothetical protein  58.52 
 
 		 139 aa  131  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15800  hypothetical protein  63.12 
 
 		 151 aa  129  1.0000000000000001e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.25035  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0828  class I peptide chain release factor  52.78 
 
 		 143 aa  121  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.084227  normal  0.577316 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37860  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  58.41 
 
 		 141 aa  112  2.0000000000000002e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.259651 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0598  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  56.92 
 
 		 147 aa  110  6e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.104756  normal  0.0423062 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0960  Class I peptide chain release factor  52.27 
 
 		 145 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29401  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  46.03 
 
 		 143 aa  107  6e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2589  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  49.59 
 
 		 143 aa  105  1e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.139809 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6855  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  51.22 
 
 		 137 aa  104  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000218203  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2137  Class I peptide chain release factor  56.72 
 
 		 145 aa  105  3e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.157094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14580  protein chain release factor B  58.9 
 
 		 149 aa  103  1e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.024949  normal  0.100234 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0636  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  50 
 
 		 143 aa  102  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00765778  normal  0.516786 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1977  hypothetical protein  52.11 
 
 		 147 aa  102  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14431  aminoacyl-tRNA hydrolase  47.15 
 
 		 142 aa  101  4e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134449 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_13231  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  41.73 
 
 		 140 aa  100  9e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.107731 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2228  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  44.09 
 
 		 146 aa  99.4  2e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1190  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  48.78 
 
 		 142 aa  97.8  5e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0102787  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0357  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.03 
 
 		 142 aa  97.4  5e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.197907  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3695  class I peptide chain release factor  44.7 
 
 		 143 aa  97.1  7e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.681232 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0556  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  40.94 
 
 		 140 aa  96.7  1e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.908284  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03851  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  36.62 
 
 		 138 aa  96.7  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.78098  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28300  protein chain release factor B  56.49 
 
 		 146 aa  95.1  3e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0672  Class I peptide chain release factor  56.15 
 
 		 164 aa  94.4  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1366  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  48.12 
 
 		 141 aa  94.4  5e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0024  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  48.12 
 
 		 141 aa  94  6e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0034  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  48.12 
 
 		 141 aa  94  6e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3102  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  45.89 
 
 		 144 aa  92.8  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.614248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1249  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  58.56 
 
 		 129 aa  93.2  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.459871 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1139  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  59.29 
 
 		 135 aa  93.2  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.668699  hitchhiker  0.0000255513 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3342  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  46.97 
 
 		 140 aa  92.4  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03851  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  36.11 
 
 		 145 aa  92.4  2e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.472509  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0979  Class I peptide chain release factor  61.32 
 
 		 149 aa  92  3e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000812989 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2737  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  45.32 
 
 		 169 aa  91.3  4e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0582  Class I peptide chain release factor  48.87 
 
 		 143 aa  90.9  5e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2666  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  46.62 
 
 		 139 aa  89.4  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0149  Class I peptide chain release factor  43.48 
 
 		 146 aa  89  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0179  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  45.86 
 
 		 143 aa  89  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3059  Class I peptide chain release factor  61.11 
 
 		 146 aa  88.2  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0504323  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0140  Class I peptide chain release factor  47.24 
 
 		 133 aa  87.8  5e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3071  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  39.42 
 
 		 140 aa  87  7e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0026  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  43.94 
 
 		 139 aa  86.7  9e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1373  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  43.18 
 
 		 140 aa  86.3  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.150956 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2547  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  45.74 
 
 		 139 aa  85.9  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.256849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4856  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  41.79 
 
 		 139 aa  84.3  5e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03841  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  37.1 
 
 		 142 aa  84  6e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.300299  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1523  hypothetical protein  44.96 
 
 		 141 aa  83.6  9e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.331021  normal  0.193244 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3167  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  44.09 
 
 		 139 aa  82.8  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.519033  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2742  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  39.85 
 
 		 134 aa  83.2  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0464887 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0332  class I peptide chain release factor  43.75 
 
 		 140 aa  82  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.451275  normal  0.841401 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1368  Class I peptide chain release factor  38.58 
 
 		 151 aa  82.4  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.422423  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1242  class I peptide chain release factor  40.16 
 
 		 139 aa  82  0.000000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00357715 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1970  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  35.71 
 
 		 137 aa  81.3  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0828493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02765  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  44.62 
 
 		 143 aa  81.6  0.000000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.489905  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2311  class I peptide chain release factor  41.09 
 
 		 144 aa  80.9  0.000000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3428  Class I peptide chain release factor  47.86 
 
 		 141 aa  80.9  0.000000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1858  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  41.18 
 
 		 135 aa  80.9  0.000000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.102554  normal  0.117146 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1390  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  42.97 
 
 		 140 aa  78.6  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.884369 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1772  Class I peptide chain release factor  42.97 
 
 		 139 aa  78.6  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0992468  normal  0.67648 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1147  Class I peptide chain release factor  43.85 
 
 		 142 aa  79  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1842  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  45.38 
 
 		 135 aa  78.2  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2298  class I peptide chain release factor  41.04 
 
 		 146 aa  78.6  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.956925 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53030  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  40.15 
 
 		 137 aa  77.8  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3557  Class I peptide chain release factor  44.36 
 
 		 140 aa  77  0.00000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.450326  normal  0.411853 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4033  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.52 
 
 		 139 aa  77  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.471406  normal  0.87398 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3411  Class I peptide chain release factor  37.88 
 
 		 140 aa  76.6  0.00000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1377  class I peptide chain release factor  37.61 
 
 		 138 aa  76.3  0.0000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000189898 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1709  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  39.71 
 
 		 139 aa  76.6  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.44949 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0875  class I peptide chain release factor  38.93 
 
 		 138 aa  75.9  0.0000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.174449  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0203  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  37.88 
 
 		 140 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00190  hypothetical protein  37.88 
 
 		 140 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.40568  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00189  hypothetical protein  37.88 
 
 		 140 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.420944  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3233  class I peptide chain release factor  45.04 
 
 		 140 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.521154 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2126  Class I peptide chain release factor  43.7 
 
 		 134 aa  75.1  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.44766  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2493  class I peptide chain release factor  44.63 
 
 		 132 aa  75.1  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.201964  normal  0.890427 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0867  class I peptide chain release factor  36.75 
 
 		 137 aa  75.1  0.0000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.485704  normal  0.838908 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2102  Class I peptide chain release factor  43.97 
 
 		 141 aa  75.1  0.0000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34690  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  40.77 
 
 		 137 aa  75.1  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.370131  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1612  class I peptide chain release factor  43.97 
 
 		 141 aa  75.1  0.0000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.554845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0215  Class I peptide chain release factor  42.74 
 
 		 132 aa  74.7  0.0000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0196  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  37.12 
 
 		 140 aa  74.3  0.0000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1494  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.28 
 
 		 137 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.129787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4649  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  39.53 
 
 		 137 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0194  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  37.12 
 
 		 140 aa  74.3  0.0000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4177  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  37.04 
 
 		 139 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.378927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1309  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  40.68 
 
 		 137 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.892435  normal  0.470671 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0185  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  37.12 
 
 		 140 aa  74.3  0.0000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0430  class I peptide chain release factor  40.94 
 
 		 141 aa  74.3  0.0000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3201  hypothetical protein  33.09 
 
 		 137 aa  73.9  0.0000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3468  class I peptide chain release factor  39.39 
 
 		 138 aa  73.9  0.0000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4258  class I peptide chain release factor  47.66 
 
 		 141 aa  73.9  0.0000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3592  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  34.35 
 
 		 138 aa  73.9  0.0000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1089  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  35.51 
 
 		 146 aa  73.6  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.900586  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3557  hypothetical protein  44.54 
 
 		 136 aa  73.2  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0245  class I peptide chain release factor  37.01 
 
 		 140 aa  72.8  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.84131  normal  0.608303 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3760  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  34.81 
 
 		 137 aa  73.2  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000181211  normal  0.0838449 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3412  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  35.51 
 
 		 146 aa  73.6  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.44659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4768  Class I peptide chain release factor  43.66 
 
 		 141 aa  72.8  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.561656  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>