More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_3473 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009675  Anae109_3473  class I peptide chain release factor  100 
 
 		 122 aa  234  3e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.316087  normal  0.0864622 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3493  Class I peptide chain release factor  79.34 
 
 		 128 aa  189  8e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.587503  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3409  class I peptide chain release factor  79.34 
 
 		 123 aa  188  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.065669  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3558  Class I peptide chain release factor  80.99 
 
 		 123 aa  167  4e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2532  putative peptide chain release factor  54.12 
 
 		 138 aa  92.8  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0971  peptidyl-tRNA hydrolase domain-containing protein  47 
 
 		 107 aa  82  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1621  class I peptide chain release factor  52.53 
 
 		 107 aa  80.9  0.000000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000216647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2540  class I peptide chain release factor  43.4 
 
 		 108 aa  80.5  0.000000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.342103  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2179  Class I peptide chain release factor  47.78 
 
 		 105 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2037  Class I peptide chain release factor  48.28 
 
 		 105 aa  78.2  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00166929  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3508  Class I peptide chain release factor  49.38 
 
 		 107 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0202  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.52 
 
 		 136 aa  74.3  0.0000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.869706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2784  peptide chain release factor 2  59.32 
 
 		 292 aa  73.2  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6855  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  39.86 
 
 		 137 aa  72.4  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000218203  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3411  Class I peptide chain release factor  38.17 
 
 		 140 aa  71.2  0.000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0194  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.17 
 
 		 140 aa  71.2  0.000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3548  class I peptide chain release factor  48.15 
 
 		 109 aa  71.2  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00527639  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0185  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.17 
 
 		 140 aa  71.2  0.000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3468  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.17 
 
 		 140 aa  71.6  0.000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.437856 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0196  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.17 
 
 		 140 aa  71.2  0.000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1190  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  39.17 
 
 		 134 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.285712  normal  0.465318 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4649  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  40.77 
 
 		 137 aa  70.9  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0736  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  39.17 
 
 		 134 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.564723  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1217  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  39.17 
 
 		 134 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.29015  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00190  hypothetical protein  38.17 
 
 		 140 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.40568  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00189  hypothetical protein  38.17 
 
 		 140 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.420944  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0203  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.17 
 
 		 140 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0332  class I peptide chain release factor  42.15 
 
 		 140 aa  70.1  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.451275  normal  0.841401 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1100  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.33 
 
 		 134 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.910918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53030  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  40 
 
 		 137 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1205  peptide chain release factor 1  39.64 
 
 		 356 aa  68.6  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.326603  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5165  peptide chain release factor 2  55.93 
 
 		 361 aa  68.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.847657 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1071  peptide chain release factor 1  61.54 
 
 		 355 aa  68.2  0.00000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.471814  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1100  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  37.5 
 
 		 134 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1889  peptide chain release factor 1  50 
 
 		 362 aa  68.2  0.00000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.640153  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1395  peptide chain release factor 1  50.72 
 
 		 358 aa  67.8  0.00000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0149  Class I peptide chain release factor  37.04 
 
 		 146 aa  67.8  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2428  peptide chain release factor 2  49.23 
 
 		 362 aa  67.4  0.00000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0864  peptide chain release factor 2  48.44 
 
 		 366 aa  67  0.00000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0550001  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0404  peptide chain release factor 2  54.24 
 
 		 304 aa  67  0.00000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.660682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2138  peptide chain release factor 2  49.23 
 
 		 364 aa  67  0.00000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01981  peptide chain release factor 2  45.57 
 
 		 356 aa  66.2  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.823612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1970  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  33.88 
 
 		 137 aa  66.6  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0828493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1762  peptide chain release factor 2  57.69 
 
 		 364 aa  66.2  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000512072  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1086  peptide chain release factor 1  48.39 
 
 		 365 aa  66.6  0.0000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0182  peptide chain release factor 2  44.87 
 
 		 354 aa  66.2  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0097  class I peptide chain release factor  37.7 
 
 		 140 aa  66.2  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3970  peptide chain release factor 2  50 
 
 		 366 aa  66.2  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000632573  unclonable  0.000000000161468 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4856  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  39.67 
 
 		 139 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19240  peptide chain release factor 1  42.34 
 
 		 378 aa  66.2  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.256465  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02001  peptide chain release factor 2  44.87 
 
 		 354 aa  66.2  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0094  peptide chain release factor 1  43.16 
 
 		 356 aa  66.6  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.494548  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0778  peptide chain release factor 2  45.83 
 
 		 331 aa  66.6  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0795  peptide chain release factor 2  45.21 
 
 		 369 aa  66.2  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4087  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  35.54 
 
 		 142 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0942  peptide chain release factor 2  52.63 
 
 		 374 aa  65.9  0.0000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0440008  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4325  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.33 
 
 		 134 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0375174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1767  peptide chain release factor 2  58.18 
 
 		 337 aa  65.9  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0816  Class I peptide chain release factor  50 
 
 		 203 aa  66.2  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0599  peptide chain release factor 1  43.53 
 
 		 360 aa  65.9  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1495  class I peptide chain release factor  33.33 
 
 		 137 aa  65.9  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000011773 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4148  peptide chain release factor 1  43.9 
 
 		 363 aa  65.5  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0478  peptide chain release factor 2  49.15 
 
 		 330 aa  65.9  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000728254  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6400  Class I peptide chain release factor  38.19 
 
 		 140 aa  65.9  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01981  peptide chain release factor 2  44.87 
 
 		 354 aa  66.2  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0513147  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02561  peptide chain release factor 2  45.45 
 
 		 313 aa  65.5  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.686331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29401  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  36.36 
 
 		 143 aa  66.2  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1548  peptide chain release factor 2  45.45 
 
 		 313 aa  65.1  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.475132  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0119  peptide chain release factor 1  47.95 
 
 		 357 aa  65.1  0.0000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08070  peptide chain release factor 1  53.45 
 
 		 369 aa  65.5  0.0000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3720  peptide chain release factor 1  40.54 
 
 		 357 aa  65.5  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.565362 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0421  peptide chain release factor 2  53.85 
 
 		 371 aa  64.7  0.0000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4033  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  37.59 
 
 		 139 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.471406  normal  0.87398 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2086  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  37.5 
 
 		 133 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08900  peptide chain release factor 1  59.18 
 
 		 357 aa  64.7  0.0000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000087001  normal  0.899711 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4041  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.58 
 
 		 137 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.733627 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0365  peptide chain release factor 2  51.85 
 
 		 357 aa  64.7  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3224  hypothetical protein  39.39 
 
 		 139 aa  64.3  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18340  peptide chain release factor 1  54.24 
 
 		 357 aa  64.3  0.0000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.143544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1466  peptide chain release factor 1  50 
 
 		 342 aa  64.3  0.0000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4026  peptide chain release factor 1  43.68 
 
 		 362 aa  63.9  0.0000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000605474 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2671  peptide chain release factor 1  50.85 
 
 		 358 aa  64.3  0.0000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0288332 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0414  peptide chain release factor 1  43.84 
 
 		 358 aa  63.9  0.0000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000401474  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14260  peptide chain release factor 1  57.14 
 
 		 352 aa  63.9  0.0000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.210236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0980  peptide chain release factor 1  53.57 
 
 		 360 aa  64.3  0.0000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000572262  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1751  peptide chain release factor 1  46.67 
 
 		 357 aa  63.9  0.0000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102915  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1784  peptide chain release factor 1  50.98 
 
 		 356 aa  63.9  0.0000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3644  peptide chain release factor 1  42.53 
 
 		 362 aa  63.9  0.0000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.99323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0279  peptide chain release factor 1  48.33 
 
 		 347 aa  63.5  0.0000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.156801  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07580  peptide chain release factor 2  43.06 
 
 		 373 aa  63.9  0.0000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.932102  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1891  peptide chain release factor 1  57.14 
 
 		 352 aa  63.5  0.0000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.871693  hitchhiker  0.000000000024235 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1494  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.33 
 
 		 137 aa  63.9  0.0000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.129787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2442  peptide chain release factor 2  46.75 
 
 		 356 aa  63.9  0.0000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0366  peptide chain release factor 2  36.96 
 
 		 332 aa  63.5  0.0000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05470  peptide chain release factor 2  59.26 
 
 		 364 aa  63.5  0.0000000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0282  hypothetical protein  49.15 
 
 		 357 aa  63.5  0.0000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.394775 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0278  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  36.97 
 
 		 140 aa  63.5  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.292576  normal  0.437885 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0267  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  36.97 
 
 		 140 aa  63.5  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.122717 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1652  peptide chain release factor 1  51.72 
 
 		 364 aa  63.5  0.0000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.534857  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17111  peptide chain release factor 1  56 
 
 		 364 aa  63.5  0.0000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.241326  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>