More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1395 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1395  peptide chain release factor 1  100 
 
 		 358 aa  724    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0279  peptide chain release factor 1  67.36 
 
 		 347 aa  459  9.999999999999999e-129  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.156801  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0836  peptide chain release factor 1  54.23 
 
 		 356 aa  377  1e-103  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0805  peptide chain release factor 1  58.99 
 
 		 367 aa  374  1e-102  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0675137  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1420  peptide chain release factor 1  58.36 
 
 		 342 aa  369  1e-101  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1466  peptide chain release factor 1  58.05 
 
 		 342 aa  369  1e-101  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0821  peptide chain release factor 1  54.46 
 
 		 357 aa  365  1e-100  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.16719  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0255  peptide chain release factor 1  54.49 
 
 		 359 aa  366  1e-100  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.018292  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2872  peptide chain release factor 1 (bRF-1)  54.88 
 
 		 357 aa  367  1e-100  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000416881  hitchhiker  0.000000000305481 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2397  peptide chain release factor 1  52.91 
 
 		 356 aa  363  2e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.456174 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0980  peptide chain release factor 1  58.26 
 
 		 356 aa  363  2e-99  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000659041  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1071  peptide chain release factor 1  57.59 
 
 		 355 aa  359  5e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.471814  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0094  peptide chain release factor 1  53.28 
 
 		 356 aa  358  7e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.494548  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2466  peptide chain release factor 1  54.66 
 
 		 360 aa  357  2.9999999999999997e-97  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000799175  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2176  peptide chain release factor 1  54.66 
 
 		 360 aa  357  2.9999999999999997e-97  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000328118  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3170  peptide chain release factor 1  52.05 
 
 		 356 aa  353  2.9999999999999997e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000384415  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0064  peptide chain release factor 1  53.44 
 
 		 355 aa  349  4e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000729315  hitchhiker  0.00306425 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3201  peptide chain release factor 1  52.88 
 
 		 360 aa  348  6e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1654  peptide chain release factor 1  52.31 
 
 		 355 aa  347  2e-94  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0196  peptide chain release factor 1  51.61 
 
 		 357 aa  345  6e-94  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.284546  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2154  peptide chain release factor 1  51.84 
 
 		 355 aa  345  7e-94  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000509235  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17970  peptide chain release factor 1  59.21 
 
 		 358 aa  345  8e-94  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000477535  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0063  peptide chain release factor 1  64.96 
 
 		 355 aa  345  8.999999999999999e-94  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.00000000318273  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3603  peptide chain release factor 1  52.08 
 
 		 360 aa  344  2e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3614  peptide chain release factor 1  52.08 
 
 		 360 aa  344  2e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.528922  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3590  peptide chain release factor 1  52.08 
 
 		 360 aa  344  2e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.637465  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0436  peptide chain release factor 1  50.75 
 
 		 360 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3597  peptide chain release factor 1  50.45 
 
 		 360 aa  343  4e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2930  peptide chain release factor 1  51.76 
 
 		 360 aa  342  5e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3522  peptide chain release factor 1  50.15 
 
 		 360 aa  342  5e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.217548  normal  0.148888 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2083  peptide chain release factor 1  50.6 
 
 		 356 aa  342  5.999999999999999e-93  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00000000963425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0676  peptide chain release factor 1  51.76 
 
 		 360 aa  342  7e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0504  peptide chain release factor 1  51.76 
 
 		 360 aa  342  7e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0972  peptide chain release factor 1  51.76 
 
 		 360 aa  342  7e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0793395  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2595  peptide chain release factor 1  50.76 
 
 		 360 aa  342  7e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.324585  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0482  peptide chain release factor 1  50.76 
 
 		 360 aa  342  7e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.464905 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0510  peptide chain release factor 1  50.76 
 
 		 360 aa  342  7e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.206813  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1943  peptide chain release factor 1  51.76 
 
 		 360 aa  342  7e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.640725  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1424  peptide chain release factor 1  53.77 
 
 		 360 aa  341  1e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.997988  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0340  peptide chain release factor 1  52.58 
 
 		 361 aa  341  1e-92  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0440  peptide chain release factor 1  56.68 
 
 		 360 aa  340  2e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.518401 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0414  peptide chain release factor 1  56.68 
 
 		 360 aa  340  2e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.592527  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0380  peptide chain release factor 1  52.9 
 
 		 355 aa  339  2.9999999999999998e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.362441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1806  peptide chain release factor 1  52.44 
 
 		 354 aa  339  5e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0496443  normal  0.210435 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2721  peptide chain release factor 1  49.85 
 
 		 360 aa  338  5.9999999999999996e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2798  peptide chain release factor 1  50.47 
 
 		 360 aa  338  7e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3146  peptide chain release factor 1  50.16 
 
 		 360 aa  337  9.999999999999999e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0205917 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1733  peptide chain release factor 1  51.75 
 
 		 351 aa  337  1.9999999999999998e-91  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.520333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2493  peptide chain release factor 1  52.1 
 
 		 360 aa  337  2.9999999999999997e-91  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2299  peptide chain release factor 1  51.44 
 
 		 356 aa  336  2.9999999999999997e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1051  peptide chain release factor 1  52.32 
 
 		 360 aa  336  5e-91  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0598725  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4833  peptide chain release factor 1  50.31 
 
 		 355 aa  335  5e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000263816  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2474  peptide chain release factor 1  52.48 
 
 		 360 aa  336  5e-91  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2901  peptide chain release factor 1  49.38 
 
 		 360 aa  335  9e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1280  peptide chain release factor 1  48.28 
 
 		 366 aa  335  1e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0451  peptide chain release factor 1  49.11 
 
 		 357 aa  333  2e-90  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2593  peptide chain release factor 1  50.75 
 
 		 360 aa  333  2e-90  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000361971  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2888  peptide chain release factor 1  55.96 
 
 		 360 aa  334  2e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.362694 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0980  peptide chain release factor 1  61.48 
 
 		 360 aa  334  2e-90  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000572262  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2999  peptide chain release factor 1  49.4 
 
 		 359 aa  333  2e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.381466  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5456  peptide chain release factor 1  51.08 
 
 		 355 aa  333  3e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000128855  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5178  peptide chain release factor 1  51.08 
 
 		 358 aa  333  3e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000138678  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5013  peptide chain release factor 1  51.08 
 
 		 358 aa  333  3e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000402063  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5029  peptide chain release factor 1  51.08 
 
 		 358 aa  333  3e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000328302  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5507  peptide chain release factor 1  51.08 
 
 		 358 aa  333  3e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000104378  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5572  peptide chain release factor 1  51.08 
 
 		 355 aa  333  3e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000100734  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2641  peptide chain release factor 1  48.91 
 
 		 358 aa  333  3e-90  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1205  peptide chain release factor 1  51.75 
 
 		 356 aa  333  3e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.326603  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5421  peptide chain release factor 1  51.08 
 
 		 358 aa  333  3e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8659e-61 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2397  peptide chain release factor 1  52.08 
 
 		 355 aa  333  3e-90  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000706535  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2489  peptide chain release factor 1  53.8 
 
 		 361 aa  332  4e-90  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5500  peptide chain release factor 1  49.56 
 
 		 358 aa  332  4e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000210571  unclonable  8.0628e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5452  peptide chain release factor 1  51.08 
 
 		 358 aa  333  4e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000502201  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3850  peptide chain release factor 1  51.39 
 
 		 355 aa  332  6e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000369919  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0083  peptide chain release factor 1  52.72 
 
 		 357 aa  332  6e-90  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3044  peptide chain release factor 1  50.32 
 
 		 360 aa  332  9e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2449  peptide chain release factor 1  54.75 
 
 		 359 aa  332  9e-90  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0615  peptide chain release factor 1  52.29 
 
 		 358 aa  331  1e-89  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2714  peptide chain release factor 1  48.94 
 
 		 355 aa  330  2e-89  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.64557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1036  peptide chain release factor 1  51.76 
 
 		 357 aa  331  2e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.125967  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4104  peptide chain release factor 1  48.18 
 
 		 357 aa  330  2e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1029  peptide chain release factor 1  50.64 
 
 		 355 aa  330  3e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0336853  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4456  peptide chain release factor 1  50.8 
 
 		 360 aa  330  3e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2692  peptide chain release factor 1  49.84 
 
 		 356 aa  330  3e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000179951  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0324  peptide chain release factor 1  48.58 
 
 		 356 aa  329  3e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.119961 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1800  peptide chain release factor 1  50.15 
 
 		 377 aa  329  4e-89  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.380877  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0949  peptide chain release factor 1  51.12 
 
 		 360 aa  329  4e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0010  peptide chain release factor 1  49.54 
 
 		 357 aa  329  4e-89  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.116962  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1869  peptide chain release factor 1  50.15 
 
 		 359 aa  329  5.0000000000000004e-89  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1444  peptide chain release factor 1  49.7 
 
 		 357 aa  329  5.0000000000000004e-89  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0761  peptide chain release factor 1  50.48 
 
 		 360 aa  328  7e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.169079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5127  peptide chain release factor 1  48.97 
 
 		 355 aa  328  7e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000488952  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4213  peptide chain release factor 1  50.65 
 
 		 372 aa  328  8e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.42192  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0733  peptide chain release factor 1  50.16 
 
 		 360 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2029  peptide chain release factor 1  48.36 
 
 		 358 aa  328  1.0000000000000001e-88  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2360  peptide chain release factor 1  50.64 
 
 		 363 aa  328  1.0000000000000001e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1725  peptide chain release factor 1  48.94 
 
 		 358 aa  327  2.0000000000000001e-88  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00127994  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2154  peptide chain release factor 1  50 
 
 		 358 aa  327  2.0000000000000001e-88  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.659693  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2192  peptide chain release factor 1  50 
 
 		 358 aa  327  2.0000000000000001e-88  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.267751  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0774  peptide chain release factor 1  50.16 
 
 		 360 aa  326  3e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>