More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0520 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_0520  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
228 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.40002  normal  0.449442 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1893  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.94 
 
 
233 aa  263  2e-69  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1878  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.07 
 
 
231 aa  251  6e-66  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2303  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.7 
 
 
231 aa  247  1e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.105994  normal  0.374369 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1203  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.98 
 
 
228 aa  236  3e-61  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0466  hypothetical protein  49.34 
 
 
235 aa  225  5.0000000000000005e-58  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.700584  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0928  ABC-type transport system, permease subunit  46.93 
 
 
228 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1040  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  46.05 
 
 
228 aa  191  7e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000111264  hitchhiker  0.0000000335509 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3403  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.79 
 
 
229 aa  191  1e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.669819  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0028  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.42 
 
 
230 aa  188  5e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000259316  normal  0.154621 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2397  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.98 
 
 
231 aa  188  7e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2701  ABC transporter, permease protein  47.49 
 
 
228 aa  186  2e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2527  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.67 
 
 
232 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00176301 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1694  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.11 
 
 
232 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.754071  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0328  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.91 
 
 
234 aa  182  5.0000000000000004e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00042229  normal  0.158089 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2224  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.79 
 
 
231 aa  178  8e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.89872  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1131  ABC transporter, permease protein  41.74 
 
 
232 aa  175  6e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0233  ABC transporter, permease protein  40.79 
 
 
232 aa  174  7e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27150  ABC-type tungstate transport system, periplasmic component  39.91 
 
 
248 aa  173  1.9999999999999998e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.544705  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2918  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.86 
 
 
232 aa  171  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2781  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  42.4 
 
 
232 aa  169  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.24732  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0891  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.98 
 
 
232 aa  169  3e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.819313  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1392  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.74 
 
 
231 aa  168  7e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1777  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.67 
 
 
231 aa  167  1e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.753761  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003505  ABC-type tungstate transport system permease protein  38.6 
 
 
232 aa  166  2.9999999999999998e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3543  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.23 
 
 
232 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0152138  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0123  ABC transporter, permease protein  38.46 
 
 
235 aa  164  9e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.749352 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3880  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.43 
 
 
235 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0068  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  38.6 
 
 
245 aa  164  1.0000000000000001e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0463742  normal  0.217149 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4095  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.59 
 
 
235 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3918  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.08 
 
 
235 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0186248  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02263  hypothetical protein  38.16 
 
 
232 aa  163  3e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2968  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.18 
 
 
231 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.946732  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3129  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.9 
 
 
245 aa  160  1e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.682243 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2476  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.82 
 
 
242 aa  159  3e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.8915  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3968  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.17 
 
 
235 aa  157  9e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2850  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.81 
 
 
246 aa  157  1e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.402937  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3076  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.81 
 
 
231 aa  157  1e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0752148  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1387  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.91 
 
 
232 aa  157  2e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3875  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.62 
 
 
235 aa  156  3e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3942  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.36 
 
 
231 aa  155  4e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0086  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.43 
 
 
235 aa  155  4e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2740  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.27 
 
 
232 aa  155  5.0000000000000005e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.726638 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2270  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.11 
 
 
232 aa  155  6e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2083  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.79 
 
 
235 aa  154  7e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4078  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.08 
 
 
235 aa  154  8e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1649  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.5 
 
 
231 aa  154  9e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4263  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.08 
 
 
235 aa  154  1e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4318  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.08 
 
 
235 aa  154  1e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4458  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.08 
 
 
235 aa  154  1e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0081  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.08 
 
 
235 aa  154  1e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1632  sulfate/tungstate ABC transporter permease  44.9 
 
 
225 aa  152  5e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0203  ABC transporter, permease protein  37.73 
 
 
230 aa  152  5e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4720  ABC transporter, permease protein  42.08 
 
 
235 aa  151  7e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3684  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.91 
 
 
235 aa  151  8e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3625  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.31 
 
 
231 aa  151  8.999999999999999e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3765  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.98 
 
 
241 aa  151  8.999999999999999e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4039  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  39.65 
 
 
250 aa  151  1e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.564931 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2295  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.93 
 
 
238 aa  150  1e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0626  basic organic compound ABC-transporter  40.67 
 
 
228 aa  150  2e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0123  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.52 
 
 
235 aa  149  4e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2781  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.95 
 
 
231 aa  149  4e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2056  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.89 
 
 
238 aa  148  6e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.202188  normal  0.0740354 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2437  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.76 
 
 
230 aa  148  7e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.829623  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1541  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.78 
 
 
217 aa  147  1.0000000000000001e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0915654  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3453  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.32 
 
 
238 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2806  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.62 
 
 
234 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0825  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.49 
 
 
210 aa  145  4.0000000000000006e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00592133  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2866  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.42 
 
 
235 aa  145  4.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.370655  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1681  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.1 
 
 
209 aa  145  5e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2460  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.42 
 
 
235 aa  144  9e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.455343  normal  0.828531 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5503  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.22 
 
 
241 aa  144  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2630  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.11 
 
 
229 aa  144  1e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3966  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.5 
 
 
238 aa  142  4e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6167  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.43 
 
 
230 aa  142  5e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.931122 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2631  transmembrane ABC transporter protein  41.43 
 
 
235 aa  141  7e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0364359  normal  0.493142 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2869  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.36 
 
 
260 aa  139  3e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1813  putative permease component of ABC transporter  40.91 
 
 
238 aa  139  3e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00043828 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1758  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40 
 
 
257 aa  137  1e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.175288 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1588  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.32 
 
 
251 aa  137  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1722  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.6 
 
 
239 aa  136  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2285  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.41 
 
 
229 aa  134  9.999999999999999e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000107267  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1524  tungstate ABC transporter, permease protein, putative  35.45 
 
 
228 aa  133  1.9999999999999998e-30  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1891  putative tungstate ABC transporter, permease protein  35.45 
 
 
228 aa  133  3e-30  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1710  tungstate ABC transporter, permease protein, putative  35.45 
 
 
228 aa  132  3.9999999999999996e-30  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.506083  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0472  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.18 
 
 
234 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.183215  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1794  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.87 
 
 
218 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1509  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38 
 
 
254 aa  119  3.9999999999999996e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0047  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.94 
 
 
214 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2223  putative permease component of ABC transporter  41.26 
 
 
252 aa  108  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0569  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.91 
 
 
139 aa  101  9e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0965  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.9 
 
 
214 aa  99.4  4e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00460897 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0644  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.62 
 
 
214 aa  89.7  4e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1160  molybdenum ABC transporter, permease protein  32.66 
 
 
222 aa  86.7  3e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0311194  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2478  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  29.76 
 
 
235 aa  82  0.000000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1555  molybdenum ABC transporter, permease protein  28.44 
 
 
241 aa  80.5  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1208  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  28.22 
 
 
221 aa  79.7  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1454  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  29.13 
 
 
221 aa  79.3  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0185  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  28.38 
 
 
224 aa  79  0.00000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0506  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  30.05 
 
 
292 aa  78.6  0.00000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.933061 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>