More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2918 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007973  Rmet_2918  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
232 aa  439  9.999999999999999e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2781  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  87.5 
 
 
232 aa  365  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.24732  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2866  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  73.28 
 
 
235 aa  270  1e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.370655  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2460  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  73.28 
 
 
235 aa  268  4e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.455343  normal  0.828531 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2631  transmembrane ABC transporter protein  72.84 
 
 
235 aa  264  8.999999999999999e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0364359  normal  0.493142 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0928  ABC-type transport system, permease subunit  49.54 
 
 
228 aa  211  1e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02263  hypothetical protein  43.29 
 
 
232 aa  196  4.0000000000000005e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003505  ABC-type tungstate transport system permease protein  43.72 
 
 
232 aa  191  6e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1131  ABC transporter, permease protein  44.16 
 
 
232 aa  189  2.9999999999999997e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0123  ABC transporter, permease protein  46.19 
 
 
235 aa  186  2e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.749352 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1203  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.33 
 
 
228 aa  186  3e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2397  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.41 
 
 
231 aa  185  4e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0233  ABC transporter, permease protein  45.16 
 
 
232 aa  184  7e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2224  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.44 
 
 
231 aa  182  4.0000000000000006e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.89872  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1040  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  53.97 
 
 
228 aa  181  8.000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000111264  hitchhiker  0.0000000335509 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2701  ABC transporter, permease protein  55.81 
 
 
228 aa  180  1e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2303  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.56 
 
 
231 aa  176  3e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.105994  normal  0.374369 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1777  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.47 
 
 
231 aa  175  6e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.753761  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3403  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.32 
 
 
229 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.669819  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2083  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.55 
 
 
235 aa  171  1e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0466  hypothetical protein  41.67 
 
 
235 aa  168  8e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.700584  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1893  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.05 
 
 
233 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0520  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.86 
 
 
228 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.40002  normal  0.449442 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1878  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.66 
 
 
231 aa  162  3e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0203  ABC transporter, permease protein  40.28 
 
 
230 aa  161  1e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2527  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.91 
 
 
232 aa  159  3e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00176301 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2781  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.73 
 
 
231 aa  159  4e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2056  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40 
 
 
238 aa  159  4e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.202188  normal  0.0740354 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1694  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.45 
 
 
232 aa  158  8e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.754071  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4095  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.59 
 
 
235 aa  158  9e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2968  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.1 
 
 
231 aa  157  2e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.946732  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3880  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.16 
 
 
235 aa  154  1e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0123  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46 
 
 
235 aa  154  2e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3918  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.12 
 
 
235 aa  153  2e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0186248  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2437  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.39 
 
 
230 aa  152  2.9999999999999998e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.829623  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0028  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.71 
 
 
230 aa  151  7e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000259316  normal  0.154621 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1541  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.02 
 
 
217 aa  150  1e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0915654  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0328  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.41 
 
 
234 aa  151  1e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00042229  normal  0.158089 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3076  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.65 
 
 
231 aa  150  2e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0752148  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3968  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.11 
 
 
235 aa  149  2e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1524  tungstate ABC transporter, permease protein, putative  36.41 
 
 
228 aa  150  2e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1891  putative tungstate ABC transporter, permease protein  36.41 
 
 
228 aa  149  3e-35  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1710  tungstate ABC transporter, permease protein, putative  36.41 
 
 
228 aa  149  3e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.506083  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3875  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.11 
 
 
235 aa  149  3e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4078  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.11 
 
 
235 aa  149  4e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2850  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.65 
 
 
246 aa  149  5e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.402937  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3453  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.89 
 
 
238 aa  149  5e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3684  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.51 
 
 
235 aa  148  6e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2630  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.81 
 
 
229 aa  148  6e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0086  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.37 
 
 
235 aa  148  8e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2285  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.59 
 
 
229 aa  146  3e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000107267  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0081  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.11 
 
 
235 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4263  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.11 
 
 
235 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4318  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.11 
 
 
235 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4458  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.11 
 
 
235 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5503  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.59 
 
 
241 aa  145  5e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1649  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.81 
 
 
231 aa  145  7.0000000000000006e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4720  ABC transporter, permease protein  45.51 
 
 
235 aa  144  9e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0068  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  39.45 
 
 
245 aa  143  3e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0463742  normal  0.217149 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2806  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.21 
 
 
234 aa  142  4e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1392  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.43 
 
 
231 aa  142  4e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0891  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.07 
 
 
232 aa  141  7e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.819313  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0825  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.96 
 
 
210 aa  140  9.999999999999999e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00592133  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2295  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.85 
 
 
238 aa  139  4.999999999999999e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3966  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.91 
 
 
238 aa  138  6e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2740  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.16 
 
 
232 aa  138  6e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.726638 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1681  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.11 
 
 
209 aa  137  2e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3543  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.71 
 
 
232 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0152138  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27150  ABC-type tungstate transport system, periplasmic component  33.78 
 
 
248 aa  135  6.0000000000000005e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.544705  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3942  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.47 
 
 
231 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6167  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.93 
 
 
230 aa  134  8e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.931122 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3765  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.38 
 
 
241 aa  133  3e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4039  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.94 
 
 
250 aa  132  3.9999999999999996e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.564931 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2476  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.31 
 
 
242 aa  132  5e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.8915  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3129  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.31 
 
 
245 aa  132  5e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.682243 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3625  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.31 
 
 
231 aa  129  3e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1813  putative permease component of ABC transporter  37.22 
 
 
238 aa  129  3e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00043828 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2270  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.53 
 
 
232 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0626  basic organic compound ABC-transporter  39.13 
 
 
228 aa  125  4.0000000000000003e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1387  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.72 
 
 
232 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0472  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.13 
 
 
234 aa  125  6e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.183215  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2869  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.57 
 
 
260 aa  123  2e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1722  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.23 
 
 
239 aa  118  9e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1588  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.7 
 
 
251 aa  115  5e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1758  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.53 
 
 
257 aa  113  3e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.175288 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1632  sulfate/tungstate ABC transporter permease  37.29 
 
 
225 aa  108  8.000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1509  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.97 
 
 
254 aa  106  4e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2223  putative permease component of ABC transporter  42.41 
 
 
252 aa  104  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1794  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.62 
 
 
218 aa  103  2e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0047  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.84 
 
 
214 aa  99  5e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2676  molybdate ABC transporter permease  35.38 
 
 
231 aa  96.7  3e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2478  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  34.31 
 
 
235 aa  90.1  3e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0055  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  32.41 
 
 
220 aa  87.8  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0089  molybdate ABC transporter permease protein  33.63 
 
 
228 aa  87.4  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0083  molybdate ABC transporter permease protein  33.63 
 
 
228 aa  87.4  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.822842  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0965  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.84 
 
 
214 aa  87.4  2e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00460897 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4559  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  32.79 
 
 
230 aa  85.9  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000269219  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3559  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  30.05 
 
 
278 aa  84  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6976  sulfate/thiosulfate ABC transporter membrane protein  30.43 
 
 
277 aa  83.6  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2330  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  32.06 
 
 
230 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.447526 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>