More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0626 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009952  Dshi_0626  basic organic compound ABC-transporter  100 
 
 
228 aa  435  1e-121  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3765  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  68.3 
 
 
241 aa  271  8.000000000000001e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2968  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.07 
 
 
231 aa  234  8e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.946732  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2740  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.05 
 
 
232 aa  232  3e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.726638 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5503  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.4 
 
 
241 aa  229  3e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2437  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.21 
 
 
230 aa  229  4e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.829623  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3076  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.61 
 
 
231 aa  226  3e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0752148  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2850  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.61 
 
 
246 aa  224  1e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.402937  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3942  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.41 
 
 
231 aa  215  4e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2806  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.68 
 
 
234 aa  212  2.9999999999999995e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6167  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.79 
 
 
230 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.931122 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1392  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.21 
 
 
231 aa  203  2e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3625  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.69 
 
 
231 aa  200  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2869  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.78 
 
 
260 aa  189  4e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27150  ABC-type tungstate transport system, periplasmic component  42.4 
 
 
248 aa  183  2.0000000000000003e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.544705  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2476  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.64 
 
 
242 aa  181  7e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.8915  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3129  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.64 
 
 
245 aa  181  7e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.682243 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1813  putative permease component of ABC transporter  54.45 
 
 
238 aa  179  4e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00043828 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0028  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.6 
 
 
230 aa  172  3.9999999999999995e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000259316  normal  0.154621 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0328  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.27 
 
 
234 aa  171  1e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00042229  normal  0.158089 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1893  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.24 
 
 
233 aa  171  1e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1588  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.98 
 
 
251 aa  170  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0466  hypothetical protein  43.81 
 
 
235 aa  170  2e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.700584  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1758  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.26 
 
 
257 aa  169  3e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.175288 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1203  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.45 
 
 
228 aa  169  3e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0928  ABC-type transport system, permease subunit  44.34 
 
 
228 aa  169  5e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1878  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.29 
 
 
231 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1387  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.67 
 
 
232 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3403  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.57 
 
 
229 aa  160  2e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.669819  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0068  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  41.98 
 
 
245 aa  160  2e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0463742  normal  0.217149 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2397  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.04 
 
 
231 aa  159  3e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2303  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.05 
 
 
231 aa  157  1e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.105994  normal  0.374369 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1541  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.23 
 
 
217 aa  155  3e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0915654  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2527  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.55 
 
 
232 aa  155  6e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00176301 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2285  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.94 
 
 
229 aa  154  9e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000107267  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1509  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.26 
 
 
254 aa  152  4e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1694  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.55 
 
 
232 aa  150  1e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.754071  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0203  ABC transporter, permease protein  34.09 
 
 
230 aa  150  2e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1777  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.62 
 
 
231 aa  149  3e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.753761  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0233  ABC transporter, permease protein  39.46 
 
 
232 aa  149  3e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0520  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.14 
 
 
228 aa  149  3e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.40002  normal  0.449442 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1632  sulfate/tungstate ABC transporter permease  45.16 
 
 
225 aa  149  3e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3543  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.47 
 
 
232 aa  147  9e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0152138  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2224  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.09 
 
 
231 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.89872  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2223  putative permease component of ABC transporter  58.67 
 
 
252 aa  145  5e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2056  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.06 
 
 
238 aa  144  9e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.202188  normal  0.0740354 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1891  putative tungstate ABC transporter, permease protein  32.58 
 
 
228 aa  144  1e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1524  tungstate ABC transporter, permease protein, putative  32.58 
 
 
228 aa  144  1e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1710  tungstate ABC transporter, permease protein, putative  32.58 
 
 
228 aa  143  2e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.506083  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1131  ABC transporter, permease protein  39.82 
 
 
232 aa  142  3e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2701  ABC transporter, permease protein  43.4 
 
 
228 aa  142  6e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1649  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.95 
 
 
231 aa  139  3e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1040  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  41.98 
 
 
228 aa  139  3e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000111264  hitchhiker  0.0000000335509 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2083  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.67 
 
 
235 aa  139  3.9999999999999997e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2295  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.76 
 
 
238 aa  138  7.999999999999999e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1722  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.3 
 
 
239 aa  137  1e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02263  hypothetical protein  36.82 
 
 
232 aa  136  3.0000000000000003e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2270  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.34 
 
 
232 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003505  ABC-type tungstate transport system permease protein  35.91 
 
 
232 aa  133  1.9999999999999998e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0891  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.55 
 
 
232 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.819313  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3453  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.52 
 
 
238 aa  131  7.999999999999999e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0123  ABC transporter, permease protein  37.17 
 
 
235 aa  131  7.999999999999999e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.749352 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3966  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.13 
 
 
238 aa  131  1.0000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2781  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.4 
 
 
231 aa  128  9.000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4039  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  41.95 
 
 
250 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.564931 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2630  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.8 
 
 
229 aa  125  4.0000000000000003e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2781  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  38.57 
 
 
232 aa  124  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.24732  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0825  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.6 
 
 
210 aa  124  1e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00592133  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2918  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.03 
 
 
232 aa  124  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1681  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.68 
 
 
209 aa  123  3e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2631  transmembrane ABC transporter protein  46.84 
 
 
235 aa  123  3e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0364359  normal  0.493142 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1794  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.26 
 
 
218 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2866  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.71 
 
 
235 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.370655  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4095  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.57 
 
 
235 aa  116  3e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2460  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.21 
 
 
235 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.455343  normal  0.828531 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3918  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.24 
 
 
235 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0186248  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3880  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.72 
 
 
235 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0086  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.68 
 
 
235 aa  108  5e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0569  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.98 
 
 
139 aa  108  6e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3684  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.41 
 
 
235 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0472  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.67 
 
 
234 aa  108  8.000000000000001e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.183215  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0123  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.49 
 
 
235 aa  107  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4720  ABC transporter, permease protein  36.11 
 
 
235 aa  100  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3875  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.65 
 
 
235 aa  100  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3968  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.65 
 
 
235 aa  100  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4078  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.65 
 
 
235 aa  99.8  3e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4458  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.48 
 
 
235 aa  95.9  5e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4263  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.48 
 
 
235 aa  95.9  5e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0081  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.48 
 
 
235 aa  95.9  5e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4318  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.48 
 
 
235 aa  95.9  5e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0047  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.57 
 
 
214 aa  84  0.000000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1208  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  28 
 
 
221 aa  74.3  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1454  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  27.5 
 
 
221 aa  73.6  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0414  molybdate ABC transporter permease  31.1 
 
 
228 aa  69.7  0.00000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0568  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  65.45 
 
 
60 aa  69.7  0.00000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4019  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  29.03 
 
 
275 aa  70.1  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.392742  normal  0.191669 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0747  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  29.48 
 
 
221 aa  68.6  0.00000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.831399  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2207  NifC-like ABC-type porter  30.69 
 
 
272 aa  67.8  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0257  NifC-like ABC-type porter  26.29 
 
 
270 aa  68.2  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0377  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  29.24 
 
 
221 aa  65.9  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>