More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1131 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1131  ABC transporter, permease protein  100 
 
 
232 aa  457  9.999999999999999e-129  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02263  hypothetical protein  79.31 
 
 
232 aa  388  1e-107  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003505  ABC-type tungstate transport system permease protein  78.02 
 
 
232 aa  380  1e-104  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0123  ABC transporter, permease protein  60.71 
 
 
235 aa  262  4e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.749352 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3880  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63.13 
 
 
235 aa  254  5e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3918  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.82 
 
 
235 aa  248  8e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0186248  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4095  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.27 
 
 
235 aa  246  1e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0081  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.75 
 
 
235 aa  231  5e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4458  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.75 
 
 
235 aa  231  5e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4263  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.75 
 
 
235 aa  231  5e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4318  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.75 
 
 
235 aa  231  5e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0086  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.71 
 
 
235 aa  231  7.000000000000001e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3968  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.37 
 
 
235 aa  226  3e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3875  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.37 
 
 
235 aa  225  5.0000000000000005e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4720  ABC transporter, permease protein  60.63 
 
 
235 aa  224  6e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4078  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.37 
 
 
235 aa  224  8e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3684  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.82 
 
 
235 aa  222  4e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0123  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.37 
 
 
235 aa  221  8e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2083  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.73 
 
 
235 aa  202  4e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0928  ABC-type transport system, permease subunit  44.89 
 
 
228 aa  180  1e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2303  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.95 
 
 
231 aa  180  1e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.105994  normal  0.374369 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2781  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  45.89 
 
 
232 aa  177  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.24732  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2918  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.16 
 
 
232 aa  175  6e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0233  ABC transporter, permease protein  43.05 
 
 
232 aa  172  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3403  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.36 
 
 
229 aa  171  1e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.669819  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2224  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.5 
 
 
231 aa  169  3e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.89872  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2397  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.53 
 
 
231 aa  168  7e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2460  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.48 
 
 
235 aa  167  9e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.455343  normal  0.828531 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2866  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.48 
 
 
235 aa  167  1e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.370655  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0466  hypothetical protein  40.76 
 
 
235 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.700584  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1777  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.01 
 
 
231 aa  162  6e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.753761  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0520  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.93 
 
 
228 aa  160  1e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.40002  normal  0.449442 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1203  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.99 
 
 
228 aa  159  4e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2701  ABC transporter, permease protein  43.42 
 
 
228 aa  157  1e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1893  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.22 
 
 
233 aa  157  2e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1878  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.53 
 
 
231 aa  157  2e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2631  transmembrane ABC transporter protein  46.75 
 
 
235 aa  156  3e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0364359  normal  0.493142 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1040  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  43.86 
 
 
228 aa  154  1e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000111264  hitchhiker  0.0000000335509 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1891  putative tungstate ABC transporter, permease protein  38.25 
 
 
228 aa  153  2e-36  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0203  ABC transporter, permease protein  36.87 
 
 
230 aa  153  2.9999999999999998e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1710  tungstate ABC transporter, permease protein, putative  38.25 
 
 
228 aa  152  4e-36  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.506083  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2968  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.37 
 
 
231 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.946732  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1524  tungstate ABC transporter, permease protein, putative  37.79 
 
 
228 aa  151  1e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3129  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.81 
 
 
245 aa  150  1e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.682243 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2476  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.81 
 
 
242 aa  150  2e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.8915  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0068  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  37.61 
 
 
245 aa  148  6e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0463742  normal  0.217149 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0028  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.84 
 
 
230 aa  148  6e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000259316  normal  0.154621 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1392  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.55 
 
 
231 aa  144  1e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0328  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.99 
 
 
234 aa  142  5e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00042229  normal  0.158089 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2527  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.22 
 
 
232 aa  142  5e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00176301 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2630  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40 
 
 
229 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2781  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.43 
 
 
231 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3076  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.54 
 
 
231 aa  139  3e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0752148  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2850  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.19 
 
 
246 aa  138  6e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.402937  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1694  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.32 
 
 
232 aa  138  8.999999999999999e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.754071  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2740  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.21 
 
 
232 aa  137  1e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.726638 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5503  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.62 
 
 
241 aa  136  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2869  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.78 
 
 
260 aa  137  2e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3765  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.2 
 
 
241 aa  137  2e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6167  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.69 
 
 
230 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.931122 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2437  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.58 
 
 
230 aa  135  5e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.829623  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2056  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.94 
 
 
238 aa  133  1.9999999999999998e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.202188  normal  0.0740354 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1649  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.89 
 
 
231 aa  132  5e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0626  basic organic compound ABC-transporter  39.82 
 
 
228 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2285  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.97 
 
 
229 aa  130  2.0000000000000002e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000107267  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2806  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.09 
 
 
234 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3625  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.18 
 
 
231 aa  129  3e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3543  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.32 
 
 
232 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0152138  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2270  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.71 
 
 
232 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1588  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.81 
 
 
251 aa  127  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0891  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.27 
 
 
232 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.819313  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2295  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.5 
 
 
238 aa  126  4.0000000000000003e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3966  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.76 
 
 
238 aa  124  1e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3942  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.19 
 
 
231 aa  123  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1758  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.84 
 
 
257 aa  119  3.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.175288 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0825  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.87 
 
 
210 aa  118  6e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00592133  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3453  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.1 
 
 
238 aa  118  7e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4039  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  39.9 
 
 
250 aa  118  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.564931 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1681  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.5 
 
 
209 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1387  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.62 
 
 
232 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1541  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.97 
 
 
217 aa  117  1.9999999999999998e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0915654  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1722  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.44 
 
 
239 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0472  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.16 
 
 
234 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.183215  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27150  ABC-type tungstate transport system, periplasmic component  32.23 
 
 
248 aa  110  2.0000000000000002e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.544705  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1813  putative permease component of ABC transporter  38.42 
 
 
238 aa  109  4.0000000000000004e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00043828 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1632  sulfate/tungstate ABC transporter permease  38.67 
 
 
225 aa  107  1e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1509  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.66 
 
 
254 aa  103  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1794  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.02 
 
 
218 aa  92.8  4e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2223  putative permease component of ABC transporter  39.69 
 
 
252 aa  90.5  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2676  molybdate ABC transporter permease  30.77 
 
 
231 aa  89  5e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1270  molybdate ABC transporter permease protein  30.88 
 
 
229 aa  89  6e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1974  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  32.72 
 
 
227 aa  88.6  7e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3064  molybdate ABC transporter permease protein  31.03 
 
 
228 aa  86.7  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2558  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  31.19 
 
 
293 aa  85.1  7e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.000169531  normal  0.108126 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2881  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  32.49 
 
 
229 aa  85.5  7e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.471307  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2108  ABC molybdenum transport system, permease subunit  34.76 
 
 
229 aa  85.1  8e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3322  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  32.88 
 
 
227 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1178  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  32.79 
 
 
229 aa  83.2  0.000000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2821  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  31.82 
 
 
262 aa  82.8  0.000000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000164471  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1552  molybdate ABC transporter inner membrane protein  30.15 
 
 
222 aa  82.8  0.000000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.044111  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>