More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_2083 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_2083  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
235 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02263  hypothetical protein  56.82 
 
 
232 aa  244  9e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1131  ABC transporter, permease protein  57.73 
 
 
232 aa  242  3.9999999999999997e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003505  ABC-type tungstate transport system permease protein  55.45 
 
 
232 aa  238  5.999999999999999e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0123  ABC transporter, permease protein  55.2 
 
 
235 aa  232  4.0000000000000004e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.749352 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3918  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.42 
 
 
235 aa  223  2e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0186248  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4095  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.94 
 
 
235 aa  219  1.9999999999999999e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3880  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.25 
 
 
235 aa  219  3e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4078  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.72 
 
 
235 aa  208  5e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3684  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.39 
 
 
235 aa  207  8e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3875  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.25 
 
 
235 aa  207  1e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3968  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.25 
 
 
235 aa  207  1e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4720  ABC transporter, permease protein  54.25 
 
 
235 aa  203  2e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4263  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.25 
 
 
235 aa  202  3e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4458  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.25 
 
 
235 aa  202  3e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4318  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.25 
 
 
235 aa  202  3e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0081  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.25 
 
 
235 aa  202  3e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0086  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.58 
 
 
235 aa  202  4e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0928  ABC-type transport system, permease subunit  50.44 
 
 
228 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0123  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.4 
 
 
235 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2781  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  51.6 
 
 
232 aa  190  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.24732  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2397  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.95 
 
 
231 aa  187  1e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2918  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.82 
 
 
232 aa  186  4e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2303  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.04 
 
 
231 aa  182  3e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.105994  normal  0.374369 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0466  hypothetical protein  42.86 
 
 
235 aa  179  4e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.700584  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3403  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.78 
 
 
229 aa  178  8e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.669819  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2701  ABC transporter, permease protein  48.68 
 
 
228 aa  175  6e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2224  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.35 
 
 
231 aa  169  3e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.89872  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1203  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.29 
 
 
228 aa  168  6e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2460  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.76 
 
 
235 aa  167  1e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.455343  normal  0.828531 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2866  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.76 
 
 
235 aa  167  2e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.370655  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2631  transmembrane ABC transporter protein  54.19 
 
 
235 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0364359  normal  0.493142 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1777  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.16 
 
 
231 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.753761  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1893  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.41 
 
 
233 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0520  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.54 
 
 
228 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.40002  normal  0.449442 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0328  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.19 
 
 
234 aa  162  3e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00042229  normal  0.158089 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1040  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  46.49 
 
 
228 aa  160  1e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000111264  hitchhiker  0.0000000335509 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0233  ABC transporter, permease protein  42.47 
 
 
232 aa  160  2e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0203  ABC transporter, permease protein  38.81 
 
 
230 aa  159  3e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2968  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.24 
 
 
231 aa  158  8e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.946732  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2527  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.35 
 
 
232 aa  156  2e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00176301 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0068  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  40.64 
 
 
245 aa  157  2e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0463742  normal  0.217149 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3765  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.05 
 
 
241 aa  156  3e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1878  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.55 
 
 
231 aa  155  4e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2056  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.63 
 
 
238 aa  155  5.0000000000000005e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.202188  normal  0.0740354 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1891  putative tungstate ABC transporter, permease protein  39.73 
 
 
228 aa  155  5.0000000000000005e-37  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1524  tungstate ABC transporter, permease protein, putative  40.18 
 
 
228 aa  155  7e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1710  tungstate ABC transporter, permease protein, putative  39.73 
 
 
228 aa  154  8e-37  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.506083  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1694  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.91 
 
 
232 aa  154  8e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.754071  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3453  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.15 
 
 
238 aa  153  2e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3129  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.79 
 
 
245 aa  153  2e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.682243 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2476  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.5 
 
 
242 aa  152  2.9999999999999998e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.8915  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3076  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.84 
 
 
231 aa  152  5e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0752148  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5503  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.79 
 
 
241 aa  150  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0028  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.15 
 
 
230 aa  150  2e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000259316  normal  0.154621 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2850  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.86 
 
 
246 aa  149  5e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.402937  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3543  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.71 
 
 
232 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0152138  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2740  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.21 
 
 
232 aa  147  2.0000000000000003e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.726638 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3966  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.17 
 
 
238 aa  146  3e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27150  ABC-type tungstate transport system, periplasmic component  36.99 
 
 
248 aa  145  4.0000000000000006e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.544705  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1392  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.25 
 
 
231 aa  145  5e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6167  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.56 
 
 
230 aa  145  6e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.931122 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1813  putative permease component of ABC transporter  43.91 
 
 
238 aa  144  1e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00043828 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2437  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.03 
 
 
230 aa  144  1e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.829623  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0626  basic organic compound ABC-transporter  41.47 
 
 
228 aa  143  2e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2295  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.93 
 
 
238 aa  144  2e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2806  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.05 
 
 
234 aa  144  2e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3942  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.33 
 
 
231 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2285  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.43 
 
 
229 aa  140  1.9999999999999998e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000107267  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2869  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.18 
 
 
260 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2270  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.27 
 
 
232 aa  139  3e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2630  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.42 
 
 
229 aa  139  3e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1649  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.28 
 
 
231 aa  138  7e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2781  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.93 
 
 
231 aa  138  7.999999999999999e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0891  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.18 
 
 
232 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.819313  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4039  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  40.97 
 
 
250 aa  135  6.0000000000000005e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.564931 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1632  sulfate/tungstate ABC transporter permease  44.94 
 
 
225 aa  134  9.999999999999999e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3625  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.93 
 
 
231 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1722  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.24 
 
 
239 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1758  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42 
 
 
257 aa  132  5e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.175288 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1387  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.78 
 
 
232 aa  131  9e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1681  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.42 
 
 
209 aa  130  1.0000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1588  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.23 
 
 
251 aa  129  5.0000000000000004e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1541  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.74 
 
 
217 aa  128  8.000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0915654  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0825  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.25 
 
 
210 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00592133  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0472  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.42 
 
 
234 aa  118  7.999999999999999e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.183215  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1794  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.03 
 
 
218 aa  116  3e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1509  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41 
 
 
254 aa  115  7.999999999999999e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2223  putative permease component of ABC transporter  40.8 
 
 
252 aa  95.1  9e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0047  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.41 
 
 
214 aa  90.9  2e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2108  ABC molybdenum transport system, permease subunit  33.97 
 
 
229 aa  86.7  3e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1974  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  31.8 
 
 
227 aa  85.1  8e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0644  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.04 
 
 
214 aa  85.1  9e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3322  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  29.77 
 
 
227 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1012  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  31.41 
 
 
275 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.934353  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4253  molybdate ABC transporter permease protein  31.75 
 
 
227 aa  82.8  0.000000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.167638  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0650  NifC-like ABC-type porter  29.1 
 
 
270 aa  82  0.000000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0108436  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0089  molybdate ABC transporter permease protein  31.75 
 
 
228 aa  82  0.000000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2330  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  31.48 
 
 
230 aa  82  0.000000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.447526 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0083  molybdate ABC transporter permease protein  31.75 
 
 
228 aa  82  0.000000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.822842  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>