More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2437 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_2437  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
230 aa  435  1e-121  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.829623  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5503  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  83.04 
 
 
241 aa  340  1e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2740  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  65.02 
 
 
232 aa  255  4e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.726638 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3765  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.87 
 
 
241 aa  251  5.000000000000001e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2806  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.56 
 
 
234 aa  244  6e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2968  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.48 
 
 
231 aa  230  1e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.946732  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0626  basic organic compound ABC-transporter  57.21 
 
 
228 aa  227  1e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2850  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.98 
 
 
246 aa  216  2e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.402937  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3076  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.98 
 
 
231 aa  216  2e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0752148  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6167  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.29 
 
 
230 aa  215  5e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.931122 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3942  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.37 
 
 
231 aa  212  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1392  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.67 
 
 
231 aa  211  1e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2476  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.41 
 
 
242 aa  209  3e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.8915  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3129  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.41 
 
 
245 aa  209  3e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.682243 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2869  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.6 
 
 
260 aa  202  3e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1588  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.64 
 
 
251 aa  201  7e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1813  putative permease component of ABC transporter  60.53 
 
 
238 aa  199  1.9999999999999998e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00043828 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3625  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.3 
 
 
231 aa  195  5.000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1758  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.92 
 
 
257 aa  179  2.9999999999999997e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.175288 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27150  ABC-type tungstate transport system, periplasmic component  39.58 
 
 
248 aa  169  4e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.544705  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2397  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.81 
 
 
231 aa  168  6e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0028  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.66 
 
 
230 aa  165  5e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000259316  normal  0.154621 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2285  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.76 
 
 
229 aa  163  3e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000107267  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0928  ABC-type transport system, permease subunit  48.58 
 
 
228 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0068  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  45.1 
 
 
245 aa  161  7e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0463742  normal  0.217149 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1509  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.87 
 
 
254 aa  161  1e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2527  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.65 
 
 
232 aa  159  2e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00176301 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1878  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.72 
 
 
231 aa  159  3e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2223  putative permease component of ABC transporter  58.82 
 
 
252 aa  158  7e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1203  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.73 
 
 
228 aa  156  2e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2701  ABC transporter, permease protein  48.58 
 
 
228 aa  156  3e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1694  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.71 
 
 
232 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.754071  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3403  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.95 
 
 
229 aa  154  8e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.669819  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0466  hypothetical protein  38.57 
 
 
235 aa  154  1e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.700584  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0203  ABC transporter, permease protein  35.94 
 
 
230 aa  154  1e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0328  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.95 
 
 
234 aa  152  2.9999999999999998e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00042229  normal  0.158089 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1777  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.76 
 
 
231 aa  150  1e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.753761  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2781  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  44.86 
 
 
232 aa  150  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.24732  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3543  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.23 
 
 
232 aa  150  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0152138  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2918  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.93 
 
 
232 aa  149  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1040  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  46.23 
 
 
228 aa  149  4e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000111264  hitchhiker  0.0000000335509 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1541  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.52 
 
 
217 aa  149  4e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0915654  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0520  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.95 
 
 
228 aa  148  8e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.40002  normal  0.449442 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0233  ABC transporter, permease protein  39.73 
 
 
232 aa  148  9e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0891  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.18 
 
 
232 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.819313  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1722  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.63 
 
 
239 aa  145  5e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2224  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.54 
 
 
231 aa  145  7.0000000000000006e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.89872  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1131  ABC transporter, permease protein  39.15 
 
 
232 aa  142  3e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2631  transmembrane ABC transporter protein  47.34 
 
 
235 aa  142  5e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0364359  normal  0.493142 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2303  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.97 
 
 
231 aa  142  5e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.105994  normal  0.374369 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1891  putative tungstate ABC transporter, permease protein  35.94 
 
 
228 aa  142  6e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1893  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.46 
 
 
233 aa  141  7e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1524  tungstate ABC transporter, permease protein, putative  35.94 
 
 
228 aa  141  8e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1710  tungstate ABC transporter, permease protein, putative  35.94 
 
 
228 aa  141  9e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.506083  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2866  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.8 
 
 
235 aa  140  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.370655  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2270  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.19 
 
 
232 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003505  ABC-type tungstate transport system permease protein  37.26 
 
 
232 aa  139  3.9999999999999997e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02263  hypothetical protein  36.79 
 
 
232 aa  139  4.999999999999999e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1387  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.86 
 
 
232 aa  138  7.999999999999999e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2630  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.81 
 
 
229 aa  137  1e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2460  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.31 
 
 
235 aa  137  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.455343  normal  0.828531 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2083  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.79 
 
 
235 aa  137  1e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2056  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.58 
 
 
238 aa  137  1e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.202188  normal  0.0740354 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1632  sulfate/tungstate ABC transporter permease  45.95 
 
 
225 aa  137  1e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2781  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.86 
 
 
231 aa  137  1e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4039  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  43.9 
 
 
250 aa  137  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.564931 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0123  ABC transporter, permease protein  40.09 
 
 
235 aa  136  2e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.749352 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2295  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.65 
 
 
238 aa  135  4e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1681  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.31 
 
 
209 aa  134  8e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3453  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.58 
 
 
238 aa  133  3e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1649  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.44 
 
 
231 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3966  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.38 
 
 
238 aa  126  3e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1794  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.88 
 
 
218 aa  124  1e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0825  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.51 
 
 
210 aa  122  4e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00592133  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4095  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.98 
 
 
235 aa  122  5e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3918  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.97 
 
 
235 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0186248  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3880  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.47 
 
 
235 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0569  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.57 
 
 
139 aa  118  7.999999999999999e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4720  ABC transporter, permease protein  38.82 
 
 
235 aa  111  9e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3968  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.65 
 
 
235 aa  108  6e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3875  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.65 
 
 
235 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3684  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.6 
 
 
235 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0123  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.43 
 
 
235 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0086  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.43 
 
 
235 aa  107  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4078  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.65 
 
 
235 aa  108  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4318  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.24 
 
 
235 aa  105  5e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4458  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.24 
 
 
235 aa  105  5e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0081  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.24 
 
 
235 aa  105  5e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4263  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.24 
 
 
235 aa  105  5e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0472  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.3 
 
 
234 aa  101  1e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.183215  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0047  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.63 
 
 
214 aa  90.1  2e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0965  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.27 
 
 
214 aa  74.7  0.000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00460897 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0650  NifC-like ABC-type porter  29.22 
 
 
270 aa  74.7  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0108436  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1578  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  31.9 
 
 
223 aa  74.3  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2960  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  27.52 
 
 
295 aa  72.4  0.000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2227  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  32.86 
 
 
227 aa  71.6  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.262345  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2343  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  27.05 
 
 
221 aa  69.7  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.367672  normal  0.691187 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1736  NifC-like ABC-type porter  30.39 
 
 
270 aa  69.7  0.00000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0568  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60 
 
 
60 aa  68.2  0.00000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0327  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  30.5 
 
 
273 aa  67.8  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0249986  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>