More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0928 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_0928  ABC-type transport system, permease subunit  100 
 
 
228 aa  436  1e-121  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1040  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  64.91 
 
 
228 aa  259  3e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000111264  hitchhiker  0.0000000335509 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2701  ABC transporter, permease protein  64.47 
 
 
228 aa  247  1e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2397  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.51 
 
 
231 aa  234  6e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3403  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.12 
 
 
229 aa  223  3e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.669819  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2224  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.05 
 
 
231 aa  200  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.89872  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0233  ABC transporter, permease protein  45.18 
 
 
232 aa  199  3.9999999999999996e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2918  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.31 
 
 
232 aa  194  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0466  hypothetical protein  46.85 
 
 
235 aa  192  3e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.700584  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2781  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  50 
 
 
232 aa  192  4e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.24732  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1777  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.61 
 
 
231 aa  191  1e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.753761  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02263  hypothetical protein  45.78 
 
 
232 aa  188  8e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003505  ABC-type tungstate transport system permease protein  44.89 
 
 
232 aa  186  2e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1203  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.02 
 
 
228 aa  186  3e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0123  ABC transporter, permease protein  43.3 
 
 
235 aa  186  3e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.749352 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2303  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.92 
 
 
231 aa  184  7e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.105994  normal  0.374369 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0203  ABC transporter, permease protein  43.18 
 
 
230 aa  184  1.0000000000000001e-45  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0028  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.86 
 
 
230 aa  183  2.0000000000000003e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000259316  normal  0.154621 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1131  ABC transporter, permease protein  44.89 
 
 
232 aa  180  1e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1878  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.44 
 
 
231 aa  176  2e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2631  transmembrane ABC transporter protein  49.56 
 
 
235 aa  176  3e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0364359  normal  0.493142 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0520  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.93 
 
 
228 aa  175  4e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.40002  normal  0.449442 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1893  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.84 
 
 
233 aa  175  4e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2083  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.5 
 
 
235 aa  175  5e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1891  putative tungstate ABC transporter, permease protein  40.53 
 
 
228 aa  173  1.9999999999999998e-42  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1524  tungstate ABC transporter, permease protein, putative  40.53 
 
 
228 aa  173  1.9999999999999998e-42  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2527  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.79 
 
 
232 aa  172  2.9999999999999996e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00176301 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1710  tungstate ABC transporter, permease protein, putative  40.53 
 
 
228 aa  172  2.9999999999999996e-42  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.506083  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2850  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.33 
 
 
246 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.402937  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3076  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.27 
 
 
231 aa  171  6.999999999999999e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0752148  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0068  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  42.54 
 
 
245 aa  171  1e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0463742  normal  0.217149 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1694  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.35 
 
 
232 aa  170  2e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.754071  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2866  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.78 
 
 
235 aa  169  3e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.370655  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2968  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.15 
 
 
231 aa  169  4e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.946732  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0328  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.47 
 
 
234 aa  169  4e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00042229  normal  0.158089 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27150  ABC-type tungstate transport system, periplasmic component  42.67 
 
 
248 aa  169  5e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.544705  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1392  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.38 
 
 
231 aa  167  1e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2460  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.29 
 
 
235 aa  166  4e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.455343  normal  0.828531 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1387  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.74 
 
 
232 aa  165  5e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4095  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.59 
 
 
235 aa  165  5.9999999999999996e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1649  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.98 
 
 
231 aa  165  5.9999999999999996e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2740  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.67 
 
 
232 aa  162  3e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.726638 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6167  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.56 
 
 
230 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.931122 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2781  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.34 
 
 
231 aa  162  5.0000000000000005e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3543  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.23 
 
 
232 aa  160  1e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0152138  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3765  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.15 
 
 
241 aa  160  1e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3942  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43 
 
 
231 aa  160  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2630  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.42 
 
 
229 aa  160  2e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3918  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.1 
 
 
235 aa  158  8e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0186248  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0086  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.22 
 
 
235 aa  157  1e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1541  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.67 
 
 
217 aa  157  2e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0915654  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2806  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.08 
 
 
234 aa  156  2e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2270  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.86 
 
 
232 aa  156  2e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3684  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.1 
 
 
235 aa  157  2e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0123  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.55 
 
 
235 aa  155  3e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2056  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.87 
 
 
238 aa  156  3e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.202188  normal  0.0740354 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3880  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.88 
 
 
235 aa  155  4e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1632  sulfate/tungstate ABC transporter permease  45.88 
 
 
225 aa  155  6e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3625  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.56 
 
 
231 aa  154  8e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0626  basic organic compound ABC-transporter  44.34 
 
 
228 aa  154  2e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1813  putative permease component of ABC transporter  44.69 
 
 
238 aa  153  2.9999999999999998e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00043828 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0891  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.67 
 
 
232 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.819313  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3453  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.21 
 
 
238 aa  152  4e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2437  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.48 
 
 
230 aa  152  5e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.829623  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5503  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.5 
 
 
241 aa  150  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1722  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.29 
 
 
239 aa  149  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3129  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.28 
 
 
245 aa  150  2e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.682243 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3968  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.78 
 
 
235 aa  149  3e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2476  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.9 
 
 
242 aa  149  5e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.8915  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4318  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.78 
 
 
235 aa  149  5e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4263  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.78 
 
 
235 aa  149  5e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4458  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.78 
 
 
235 aa  149  5e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0081  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.78 
 
 
235 aa  149  5e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4720  ABC transporter, permease protein  42.25 
 
 
235 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4039  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  41.59 
 
 
250 aa  147  1.0000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.564931 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3875  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.25 
 
 
235 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4078  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.25 
 
 
235 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1681  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.51 
 
 
209 aa  144  1e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3966  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.96 
 
 
238 aa  141  8e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2869  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.39 
 
 
260 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2295  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.29 
 
 
238 aa  140  9.999999999999999e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2285  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.72 
 
 
229 aa  140  1.9999999999999998e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000107267  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0825  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.3 
 
 
210 aa  135  8e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00592133  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1758  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.5 
 
 
257 aa  134  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.175288 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0472  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.33 
 
 
234 aa  124  1e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.183215  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1509  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45 
 
 
254 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1588  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.2 
 
 
251 aa  119  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2223  putative permease component of ABC transporter  47.57 
 
 
252 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1794  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40 
 
 
218 aa  109  3e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0047  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.51 
 
 
214 aa  97.1  2e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2558  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  32.73 
 
 
293 aa  86.7  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.000169531  normal  0.108126 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1527  NifC-like ABC-type porter  28.85 
 
 
266 aa  83.2  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00122012 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0569  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.73 
 
 
139 aa  82.8  0.000000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0891  NifC-like ABC-type porter  29.95 
 
 
273 aa  82  0.000000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.966064  normal  0.181406 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0965  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.04 
 
 
214 aa  82  0.000000000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00460897 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0385  NifC-like ABC-type porter  28.37 
 
 
266 aa  82  0.000000000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0644  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.66 
 
 
214 aa  81.3  0.00000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1618  NifC-like ABC-type porter  27.05 
 
 
266 aa  80.1  0.00000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.156172  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1445  NifC-like ABC-type porter  28.37 
 
 
266 aa  80.1  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.452382  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4991  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  29.95 
 
 
615 aa  79  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>