More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_0449 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009634  Mevan_0449  NOL1/NOP2/sun family RNA methylase  100 
 
 
265 aa  531  1e-150  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.23472  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1541  RNA methylase  81.75 
 
 
275 aa  449  1e-125  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.719796  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0458  ribosomal RNA methyltransferase NOP2  82.51 
 
 
277 aa  430  1e-120  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0378  NOL1/NOP2/sun family RNA methylase  83.27 
 
 
265 aa  432  1e-120  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0306061 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1457  NOL1/NOP2/sun family RNA methylase  61.69 
 
 
335 aa  308  5e-83  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1228  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  41.52 
 
 
339 aa  192  7e-48  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08073  nucleolar RNA methyltransferase (Nop2), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G01760)  40.86 
 
 
788 aa  184  1.0000000000000001e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.322316  normal  0.90309 
 
 
-
 
NC_006684  CNB02220  nucleolus protein, putative  38.77 
 
 
695 aa  178  9e-44  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0735574  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_91345  nucleolar RNA methyltransferase  38.65 
 
 
625 aa  177  2e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.179856 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0007  ribosomal RNA methyltransferase NOP2  39.78 
 
 
336 aa  174  9.999999999999999e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.138281 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25394  predicted protein  42.41 
 
 
528 aa  167  1e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_2054  predicted protein  37.37 
 
 
485 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02352  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  36.03 
 
 
501 aa  155  9e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1591  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  39.74 
 
 
454 aa  154  1e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.558771  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1437  sun protein  35.74 
 
 
430 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003425  ribosomal RNA small subunit methyltransferase F  34.93 
 
 
478 aa  150  1e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.837447  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2113  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  35.06 
 
 
503 aa  150  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000343432 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1110  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  34.93 
 
 
503 aa  149  5e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.153136  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3612  sun protein  32.6 
 
 
464 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3160  NOL1/NOP2/sun family RNA methylase  38.3 
 
 
456 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2580  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  34.62 
 
 
454 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1807  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  36.1 
 
 
481 aa  145  5e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0366277  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2568  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  35.74 
 
 
479 aa  145  9e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.401694  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01806  predicted methyltransferase  36.1 
 
 
479 aa  144  1e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.88495  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01794  hypothetical protein  36.1 
 
 
479 aa  144  1e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1352  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  35.74 
 
 
481 aa  144  1e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.312061  normal  0.0948873 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2064  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  36.1 
 
 
481 aa  144  1e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.2344  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2103  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  36.1 
 
 
481 aa  144  1e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0235271  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1583  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  36.86 
 
 
486 aa  144  2e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.855297  normal  0.597939 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1538  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  35.53 
 
 
473 aa  144  2e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.317347  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1926  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  35.74 
 
 
481 aa  143  4e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.79578  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1797  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  35.74 
 
 
481 aa  143  4e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.396046  normal  0.0585336 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1108  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  42.2 
 
 
301 aa  142  4e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000188231  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0901  Fmu (Sun) domain-containing protein  37.28 
 
 
455 aa  142  6e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1281  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  35.02 
 
 
479 aa  141  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0638049  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2644  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  35.06 
 
 
478 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0597695 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2051  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  34.66 
 
 
513 aa  140  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.390449  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0341  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  33.46 
 
 
302 aa  139  3e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1665  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  35.36 
 
 
509 aa  140  3e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1219  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  32.37 
 
 
455 aa  139  3e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1465  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  34.66 
 
 
479 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.331125  normal  0.160256 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3218  Fmu (Sun) domain-containing protein  33.33 
 
 
470 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2609  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  34.2 
 
 
474 aa  139  6e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2224  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  34.43 
 
 
481 aa  139  6e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.508935 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1752  sun protein  32.84 
 
 
444 aa  138  1e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.731166  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0066  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase:Nop2p  32.46 
 
 
446 aa  137  1e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1993  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  34.3 
 
 
513 aa  137  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.956035 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0193  sun protein  35.19 
 
 
448 aa  137  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000593735  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1989  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  34.3 
 
 
513 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00458134 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1986  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  33.33 
 
 
478 aa  137  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0149307 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1840  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  32.23 
 
 
482 aa  137  2e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1740  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  34.57 
 
 
510 aa  137  2e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1104  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  36.36 
 
 
458 aa  137  2e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0692  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  38.58 
 
 
470 aa  137  2e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.010029  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1707  sun protein  34.83 
 
 
453 aa  137  2e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1770  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  33.83 
 
 
510 aa  136  4e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.475142  normal  0.596617 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3373  Sun protein  32.96 
 
 
448 aa  135  5e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1591  sun protein  33.33 
 
 
452 aa  135  5e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0666  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  32.12 
 
 
302 aa  135  7.000000000000001e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.728996  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2568  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  33.69 
 
 
505 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.378579  normal  0.101279 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2172  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  35.04 
 
 
471 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000128077  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2455  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  33.33 
 
 
505 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2033  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  32.97 
 
 
302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2448  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  33.33 
 
 
505 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2405  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  33.94 
 
 
480 aa  134  1.9999999999999998e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1306  RNA methylase NOL1/NOP2/sun family  30.37 
 
 
457 aa  133  3e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.085217 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0209  rRNA methyltransferase RsmB (sun protein), putative  35.63 
 
 
428 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1267  Fmu (Sun) domain protein  31.06 
 
 
460 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2039  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  32.84 
 
 
467 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.137623  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1485  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  31.39 
 
 
314 aa  132  3.9999999999999996e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1954  sun protein  32.22 
 
 
444 aa  132  6e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0979  NOL1/NOP2/sun family RNA methylase  32.86 
 
 
460 aa  132  6e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2695  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  29.64 
 
 
325 aa  132  6e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2079  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  31.52 
 
 
481 aa  132  6e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1896  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  33.33 
 
 
505 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.167738 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2311  sun protein  32.71 
 
 
452 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.362668  hitchhiker  0.000826968 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1994  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  33.33 
 
 
442 aa  131  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1712  sun protein  33.33 
 
 
442 aa  131  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.212482  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2210  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  33.21 
 
 
505 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2046  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  33.33 
 
 
505 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.362171  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1005  rRNA methyltransferase, putative  37.97 
 
 
436 aa  130  2.0000000000000002e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00439767  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0993  NOL1/NOP2/sun family protein  33.96 
 
 
436 aa  130  3e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000219997  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0664  NOL1/NOP2/sun family protein  33.21 
 
 
279 aa  130  3e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.995091  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0700  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  29.24 
 
 
321 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2136  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  31.5 
 
 
484 aa  128  8.000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3594  sun protein  31.46 
 
 
448 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3528  sun protein  31.09 
 
 
448 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0739  NOL1/NOP2/sun family protein  34.08 
 
 
279 aa  127  2.0000000000000002e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.275857  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1328  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  30.18 
 
 
457 aa  127  2.0000000000000002e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.13819  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2792  Fmu (Sun) domain-containing protein  33.61 
 
 
488 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000540709  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1927  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  32.75 
 
 
488 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1848  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  31.87 
 
 
484 aa  126  3e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3851  sun protein  32.85 
 
 
453 aa  126  3e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl196  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  37.44 
 
 
425 aa  125  5e-28  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0292309  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1936  NOL1/NOP2/sun family RNA methylase  31.7 
 
 
481 aa  124  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00306451  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0672  sun protein  29.92 
 
 
451 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0363723  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4706  sun protein  30.19 
 
 
446 aa  124  2e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2236  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  33.09 
 
 
484 aa  124  2e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0282  NOL1/NOP2/sun family RNA methylase  31.87 
 
 
302 aa  123  3e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0571  sun protein  31.23 
 
 
455 aa  122  4e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0809795  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>