More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_1828 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_3555  glycogen debranching enzyme GlgX  49.43 
 
 		 755 aa  667    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0361037 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3459  glycogen debranching enzyme GlgX  47.8 
 
 		 758 aa  665    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  unclonable  0.0095234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1850  glycogen debranching enzyme GlgX  49.72 
 
 		 779 aa  667    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.369764  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1530  glycogen debranching enzyme GlgX  51.07 
 
 		 704 aa  644    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.376415  normal  0.0851861 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4055  glycogen debranching protein GlgX  49.55 
 
 		 717 aa  648    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6324  glycosyl hydrolase (glycogen debranching enzyme)  49.12 
 
 		 691 aa  641    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.24347  normal  0.874434 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3980  glycogen debranching enzyme GlgX  49.19 
 
 		 712 aa  651    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.524127  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0238  glycogen operon protein GlgX  50.14 
 
 		 754 aa  652    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.137822  normal  0.662509 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3752  glycogen debranching enzyme GlgX  53.27 
 
 		 720 aa  684    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.742598  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3130  glycogen operon protein GlgX  46.86 
 
 		 727 aa  651    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.167727  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0819  glycogen operon protein GlgX, putative  51.85 
 
 		 702 aa  641    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0962499  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2997  glycoside hydrolase, family alpha amylase catalytic subunit  47.29 
 
 		 727 aa  656    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2267  glycogen debranching enzyme GlgX  50.72 
 
 		 691 aa  667    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.138313  normal  0.255699 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0618  glycogen debranching enzyme GlgX  51.85 
 
 		 702 aa  641    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.385691  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1206  glycogen debranching enzyme GlgX  48.42 
 
 		 692 aa  656    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1736  glycogen debranching enzyme GlgX  51.85 
 
 		 702 aa  641    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1740  glycogen debranching protein GlgX  48.07 
 
 		 706 aa  653    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.152679  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2544  glycogen debranching protein GlgX  49.18 
 
 		 719 aa  655    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2226  glycosidase  50.97 
 
 		 694 aa  660    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2449  putative glycosyl hydrolase  50.79 
 
 		 688 aa  655    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2884  glycogen debranching enzyme  51.07 
 
 		 704 aa  645    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.499516  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7031  glycogen debranching protein GlgX  51.38 
 
 		 708 aa  649    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.261677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1136  glycogen debranching enzyme GlgX  51.87 
 
 		 704 aa  671    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.55158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5568  glycosyl hydrolase (glycogen debranching enzyme)  49.7 
 
 		 745 aa  650    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03371  glycogen debranching enzyme GlgX  50.29 
 
 		 720 aa  654    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.13804  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1565  glycogen debranching enzyme GlgX  51.85 
 
 		 702 aa  641    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.122779  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1788  glycogen debranching enzyme GlgX  49.55 
 
 		 717 aa  646    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4166  glycogen debranching enzyme GlgX  47.92 
 
 		 693 aa  640    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.830683  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0505  glycogen debranching protein GlgX  49.36 
 
 		 714 aa  675    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.299874  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1606  glycogen debranching protein GlgX  49.58 
 
 		 729 aa  660    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.333423  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5877  glycogen debranching enzyme GlgX  48.8 
 
 		 718 aa  640    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0567  glycogen debranching enzyme GlgX  51.69 
 
 		 722 aa  687    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1828  glycogen debranching enzyme GlgX  100 
 
 		 697 aa  1426    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.418777 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6824  glycogen debranching enzyme GlgX  52.2 
 
 		 739 aa  667    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.100045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1549  glycogen debranching enzyme GlgX  99.28 
 
 		 697 aa  1414    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.177873 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1881  glycogen debranching protein GlgX  48.49 
 
 		 691 aa  650    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2254  glycogen debranching protein GlgX  47.65 
 
 		 733 aa  635    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2937  glycogen debranching enzyme GlgX  52.14 
 
 		 703 aa  649    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3116  glycogen debranching protein GlgX  50.83 
 
 		 698 aa  636    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.479948 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3654  glycogen debranching enzyme GlgX  49.7 
 
 		 717 aa  648    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0348768 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2158  glycogen debranching protein GlgX  47.88 
 
 		 719 aa  662    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0345133  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0988  glycogen operon protein  46.18 
 
 		 716 aa  646    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.25479 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1227  glycogen debranching protein GlgX  48.78 
 
 		 719 aa  652    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170759 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3626  glycogen debranching protein GlgX  49.15 
 
 		 701 aa  646    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0135941 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1189  glycogen debranching protein GlgX  47.9 
 
 		 688 aa  637    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.50354  normal  0.29921 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1322  glycogen operon protein GlgX  47.31 
 
 		 738 aa  642    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0099235  normal  0.0986293 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2864  putative glycogen operon protein GlgX  51.37 
 
 		 739 aa  654    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3485  glycogen debranching protein GlgX  48.56 
 
 		 692 aa  653    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1463  glycogen debranching protein GlgX  48.07 
 
 		 692 aa  650    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4390  glycogen debranching enzyme GlgX  49.86 
 
 		 737 aa  639    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.497261 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5289  glycogen debranching enzyme GlgX  47.59 
 
 		 738 aa  646    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1333  glycogen debranching protein GlgX  50.75 
 
 		 705 aa  652    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0242466  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3335  glycogen debranching enzyme GlgX  47.66 
 
 		 755 aa  671    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.242143  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1775  glycogen debranching enzyme GlgX  49.64 
 
 		 701 aa  640    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.318288  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0317  glycogen debranching protein GlgX  49.29 
 
 		 715 aa  667    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1819  glycogen debranching enzyme GlgX  48.21 
 
 		 717 aa  648    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.11344  normal  0.553566 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2676  glycogen debranching enzyme GlgX  52.09 
 
 		 691 aa  692    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0537  glycogen debranching enzyme GlgX  51.85 
 
 		 702 aa  641    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0902  glycogen debranching enzyme GlgX  51.11 
 
 		 694 aa  662    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.934485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1112  glycogen debranching enzyme GlgX  50.5 
 
 		 688 aa  654    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.758297  normal  0.439261 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1151  glycogen debranching enzyme GlgX  48.3 
 
 		 756 aa  667    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.911208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01859  glycogen debranching enzyme GlgX  49.78 
 
 		 710 aa  645    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1486  glycogen debranching enzyme GlgX  72.19 
 
 		 705 aa  1001    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000700154 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1463  glycogen debranching enzyme GlgX  51.89 
 
 		 708 aa  670    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.66197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36630  putative glycosyl hydrolase  50.82 
 
 		 716 aa  661    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0278347  normal  0.953744 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3146  glycogen debranching enzyme GlgX  50.07 
 
 		 716 aa  659    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.371141  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6496  glycogen debranching enzyme GlgX  50.75 
 
 		 705 aa  652    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0828061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7550  glycogen debranching enzyme GlgX  69.22 
 
 		 702 aa  979    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.317676  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1249  glycogen debranching enzyme GlgX  48.3 
 
 		 735 aa  638    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6085  glycogen debranching enzyme GlgX  50.6 
 
 		 705 aa  652    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0291933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4873  glycogen debranching enzyme GlgX  50.57 
 
 		 757 aa  672    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.325281  normal  0.0620959 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1782  glycogen debranching enzyme GlgX  49.71 
 
 		 688 aa  653    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24860  glycogen debranching enzyme  48.88 
 
 		 720 aa  647    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.624836  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0543  glycogen debranching enzyme GlgX  50.46 
 
 		 704 aa  651    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0247855  normal  0.604467 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5335  glycogen debranching enzyme GlgX  50.15 
 
 		 723 aa  667    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0240771 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3936  glycogen debranching enzyme GlgX  49.72 
 
 		 766 aa  667    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0659462  normal  0.365741 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1982  glycogen debranching enzyme GlgX  51.12 
 
 		 721 aa  679    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0850587  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1692  glycogen debranching enzyme GlgX  93.54 
 
 		 697 aa  1314    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5488  glycogen debranching enzyme GlgX  51.38 
 
 		 708 aa  655    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.168137  decreased coverage  0.0000616357 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1088  glycogen debranching enzyme GlgX  47.81 
 
 		 718 aa  650    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.231339 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6785  glycogen debranching enzyme GlgX  47.86 
 
 		 718 aa  637    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6811  glycogen debranching enzyme GlgX  69.16 
 
 		 702 aa  957    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.37065 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3138  glycogen debranching enzyme GlgX  47.8 
 
 		 758 aa  666    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.157891 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1337  glycogen debranching enzyme GlgX  51.85 
 
 		 702 aa  641    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4049  glycogen debranching enzyme GlgX  49.72 
 
 		 766 aa  667    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.928409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1542  glycogen debranching enzyme GlgX  51.85 
 
 		 702 aa  641    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2282  glycogen debranching enzyme GlgX  51.42 
 
 		 704 aa  673    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0218366  hitchhiker  0.000957469 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1891  glycogen debranching enzyme GlgX  48.45 
 
 		 707 aa  635  1e-180  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16660  glycogen debranching enzyme GlgX  46.59 
 
 		 720 aa  634  1e-180  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.038626 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3681  glycogen debranching protein GlgX  48.06 
 
 		 692 aa  632  1e-180  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6323  glycogen debranching enzyme GlgX  48.38 
 
 		 704 aa  634  1e-180  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.431119  normal  0.149748 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2253  glycogen debranching enzyme GlgX  50.85 
 
 		 703 aa  633  1e-180  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.146745 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2909  glycogen debranching enzyme GlgX  47.67 
 
 		 751 aa  635  1e-180  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.506693  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6129  glycogen debranching enzyme GlgX  50.96 
 
 		 717 aa  633  1e-180  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.872744 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0396  glycogen debranching enzyme GlgX  45.72 
 
 		 726 aa  633  1e-180  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.153348  normal  0.926984 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4425  glycogen debranching enzyme GlgX  51.5 
 
 		 697 aa  633  1e-180  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5729  glycogen debranching enzyme GlgX  46.54 
 
 		 723 aa  634  1e-180  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2618  glycogen debranching enzyme GlgX  47.65 
 
 		 752 aa  629  1e-179  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0936116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0647  glycogen debranching enzyme GlgX  46.31 
 
 		 722 aa  629  1e-179  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.539207  normal  0.291924 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5593  glycogen debranching enzyme GlgX  48.1 
 
 		 704 aa  629  1e-179  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>