More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0929 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0929  oligopeptide ABC transporter, permease protein  100 
 
 
332 aa  670    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00370734  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0329  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.45 
 
 
326 aa  224  2e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3568  oligopeptide ABC transporter, permease  36.13 
 
 
327 aa  210  3e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0709186 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0859  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.76 
 
 
339 aa  205  9e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0344  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.94 
 
 
323 aa  195  1e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1614  oligopeptide ABC transporter, permease protein  34.09 
 
 
304 aa  192  8e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1269  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  34.59 
 
 
324 aa  182  6e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2396  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.22 
 
 
325 aa  180  2e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2197  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.68 
 
 
325 aa  178  9e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000755906  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2744  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.29 
 
 
344 aa  178  1e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.480535  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2630  peptide ABC transporter, permease protein, putative  34.17 
 
 
317 aa  177  2e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.238597  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6685  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.8 
 
 
325 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0249193  normal  0.645834 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3197  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.46 
 
 
328 aa  177  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  unclonable  0.0000000643204  unclonable  0.00000000002362 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5781  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.48 
 
 
325 aa  177  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.100059 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3995  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.1 
 
 
325 aa  177  3e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1036  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.59 
 
 
308 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3489  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.06 
 
 
340 aa  172  5e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0733  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.72 
 
 
328 aa  172  5e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1399  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.12 
 
 
325 aa  171  1e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.895981  normal  0.8818 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0399  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.29 
 
 
325 aa  171  2e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2622  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.81 
 
 
326 aa  170  3e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0039  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.06 
 
 
329 aa  170  3e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1493  peptide ABC transporter, permease protein  34.38 
 
 
324 aa  170  4e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1283  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.38 
 
 
324 aa  170  4e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0896  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.04 
 
 
343 aa  169  5e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0481  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.82 
 
 
324 aa  169  8e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.399045  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3797  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.29 
 
 
325 aa  168  1e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0893  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.35 
 
 
338 aa  167  2e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1680  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.45 
 
 
326 aa  166  4e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.473692  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0930  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.05 
 
 
330 aa  166  4e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1508  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.77 
 
 
323 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.929546  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5234  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.1 
 
 
323 aa  165  8e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0915  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.03 
 
 
338 aa  165  9e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2727  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.12 
 
 
331 aa  164  1.0000000000000001e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0394  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, permease protein  29.91 
 
 
320 aa  164  2.0000000000000002e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2514  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
323 aa  164  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0635033  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0746  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.31 
 
 
333 aa  163  3e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3132  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.8 
 
 
340 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.214587 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.89 
 
 
326 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1615  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.19 
 
 
340 aa  162  5.0000000000000005e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00450006  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1650  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33 
 
 
323 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.950445 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0425  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.18 
 
 
324 aa  161  1e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.366309  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2572  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.65 
 
 
340 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0871  inner membrane ABC transporter permease protein  32.04 
 
 
342 aa  160  4e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1235  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.9 
 
 
333 aa  160  4e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.391976  normal  0.26803 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2074  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.71 
 
 
325 aa  159  4e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.480445  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0859  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.96 
 
 
333 aa  159  5e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000322853  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4130  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.71 
 
 
324 aa  159  7e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0148  peptide ABC transporter, permease protein  30.89 
 
 
328 aa  159  7e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2577  ABC-type [(GlcNAc)2] transporter, permease protein  32.49 
 
 
328 aa  159  8e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01320  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  32.81 
 
 
328 aa  159  9e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.655147  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3168  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.87 
 
 
317 aa  158  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7457  peptide ABC transporter, permease protein  30.63 
 
 
334 aa  158  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.48372 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7557  putative dipeptide ABC transporter (permease protein)  32.35 
 
 
323 aa  158  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1434  peptide ABC transporter, permease protein  32.82 
 
 
326 aa  157  2e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.393954  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001854  putative transmembrane ABC transporter protein  33.23 
 
 
341 aa  157  2e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4093  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.87 
 
 
336 aa  157  2e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.105746  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2548  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.01 
 
 
328 aa  157  2e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.892452  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03424  hypothetical protein  30.77 
 
 
328 aa  157  2e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00639  ABC transporter permease component  33.23 
 
 
341 aa  157  2e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1437  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.93 
 
 
326 aa  157  2e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0562  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.27 
 
 
322 aa  157  2e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.618484  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1483  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.71 
 
 
326 aa  157  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.28032  normal  0.876961 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19900  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  33.23 
 
 
348 aa  158  2e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00317245  hitchhiker  0.000399681 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1849  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.57 
 
 
329 aa  157  3e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4284  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.65 
 
 
323 aa  155  7e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.181861  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0330  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.03 
 
 
327 aa  155  7e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0232196  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1137  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.23 
 
 
344 aa  155  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0958973 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20170  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  31.55 
 
 
325 aa  155  1e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34920  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  32.51 
 
 
331 aa  155  1e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.949734  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2762  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.57 
 
 
322 aa  155  1e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.3137  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0172  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.58 
 
 
326 aa  155  1e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.774382  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002585  (GlcNAc)2 ABC transporter permease component 1  30.25 
 
 
328 aa  155  1e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0632  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.01 
 
 
356 aa  154  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.637642  normal  0.973123 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0238  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.91 
 
 
322 aa  154  2e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.438501  normal  0.539415 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3220  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.09 
 
 
323 aa  154  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.259028  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0105  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.64 
 
 
326 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.109225  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2033  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.62 
 
 
324 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1554  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.13 
 
 
329 aa  153  4e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.136155  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2643  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.57 
 
 
326 aa  153  4e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4405  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.01 
 
 
325 aa  153  5e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.271633 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7447  ABC transporter, permease  31.43 
 
 
346 aa  152  7e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.268858  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6187  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.86 
 
 
329 aa  151  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.871135  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1899  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.3 
 
 
328 aa  151  1e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.227474  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2453  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.53 
 
 
334 aa  151  1e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17389  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2499  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.21 
 
 
334 aa  150  2e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0750217 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1190  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.48 
 
 
335 aa  150  2e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2050  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.85 
 
 
325 aa  151  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2797  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.79 
 
 
319 aa  150  2e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4253  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.63 
 
 
336 aa  151  2e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.144815  normal  0.108193 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2971  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.7 
 
 
322 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0636999  normal  0.258787 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06400  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  32.38 
 
 
326 aa  150  3e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.36653  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0808  oligopeptide ABC transporter, permease  32.09 
 
 
316 aa  149  5e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.282065  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2083  ABC transporter, permease  32.59 
 
 
354 aa  149  5e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.899813  normal  0.534674 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0215  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.3 
 
 
343 aa  149  6e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000546262  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2378  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30 
 
 
327 aa  149  6e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0410349  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4291  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.37 
 
 
338 aa  149  8e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3886  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.7 
 
 
339 aa  148  1.0000000000000001e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.431953  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1795  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.63 
 
 
328 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000162915  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1591  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.92 
 
 
326 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.75386 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>