More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I2577 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011312  VSAL_I2577  ABC-type [(GlcNAc)2] transporter, permease protein  100 
 
 
328 aa  658    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0148  peptide ABC transporter, permease protein  89.63 
 
 
328 aa  607  9.999999999999999e-173  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03424  hypothetical protein  83.84 
 
 
328 aa  585  1e-166  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002585  (GlcNAc)2 ABC transporter permease component 1  83.54 
 
 
328 aa  583  1e-166  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2744  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.07 
 
 
344 aa  360  2e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.480535  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5781  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.78 
 
 
325 aa  359  3e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.100059 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6685  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.09 
 
 
325 aa  358  6e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0249193  normal  0.645834 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0399  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.22 
 
 
325 aa  312  5.999999999999999e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3797  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.38 
 
 
325 aa  308  1.0000000000000001e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.2 
 
 
326 aa  306  3e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2396  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.85 
 
 
325 aa  304  2.0000000000000002e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2074  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.99 
 
 
325 aa  293  4e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.480445  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1899  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.46 
 
 
328 aa  266  2e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.227474  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1399  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.92 
 
 
325 aa  266  4e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.895981  normal  0.8818 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0930  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.59 
 
 
330 aa  265  8e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0546  peptide ABC transporter, protein inner membrane binding component  41.85 
 
 
324 aa  264  1e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000873967  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0481  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.31 
 
 
324 aa  263  2e-69  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.399045  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0172  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.2 
 
 
326 aa  261  8.999999999999999e-69  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.774382  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1483  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.85 
 
 
326 aa  256  2e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.28032  normal  0.876961 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3401  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.55 
 
 
331 aa  256  5e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.621344  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34920  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  40.54 
 
 
331 aa  253  3e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.949734  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0039  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.06 
 
 
329 aa  252  6e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2727  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.82 
 
 
331 aa  251  1e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2622  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.02 
 
 
326 aa  251  2e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01320  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  40.37 
 
 
328 aa  250  2e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.655147  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2514  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.46 
 
 
323 aa  247  2e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0635033  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7457  peptide ABC transporter, permease protein  40.3 
 
 
334 aa  247  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.48372 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20170  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  41.59 
 
 
325 aa  246  3e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6187  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.39 
 
 
329 aa  243  3.9999999999999997e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.871135  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1680  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.24 
 
 
326 aa  242  5e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.473692  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06400  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  41.29 
 
 
326 aa  231  2e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.36653  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0915  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.67 
 
 
338 aa  226  4e-58  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0489  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.14 
 
 
336 aa  226  4e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0893  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.67 
 
 
338 aa  226  6e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17750  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  38.02 
 
 
336 aa  220  3e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0274978  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1179  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.08 
 
 
328 aa  215  9e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2502  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.65 
 
 
333 aa  213  2.9999999999999995e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0896  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.13 
 
 
343 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0215  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.53 
 
 
343 aa  210  3e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000546262  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2054  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.95 
 
 
336 aa  209  5e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.000423079  normal  0.894594 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4405  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.03 
 
 
325 aa  204  1e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.271633 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3010  ABC transporter related  34.36 
 
 
339 aa  204  2e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.932121  normal  0.429089 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2197  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.02 
 
 
325 aa  204  2e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000755906  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0263  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.5 
 
 
331 aa  202  4e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.594312  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4465  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.56 
 
 
337 aa  202  6e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0158247  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1269  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  36.56 
 
 
324 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0113  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.67 
 
 
320 aa  200  1.9999999999999998e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0617346  normal  0.17443 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21750  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  34.65 
 
 
362 aa  200  3e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.211245  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4093  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.98 
 
 
336 aa  199  3.9999999999999996e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.105746  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0049  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.12 
 
 
336 aa  199  6e-50  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.190258  normal  0.544383 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1657  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  37.5 
 
 
343 aa  198  7.999999999999999e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.104246  normal  0.622808 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0329  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.31 
 
 
326 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2389  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.09 
 
 
329 aa  196  5.000000000000001e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3568  oligopeptide ABC transporter, permease  36.36 
 
 
327 aa  196  6e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0709186 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0859  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.36 
 
 
339 aa  195  8.000000000000001e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1190  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.23 
 
 
335 aa  194  2e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1493  peptide ABC transporter, permease protein  36.68 
 
 
324 aa  191  1e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1283  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.68 
 
 
324 aa  191  1e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0482  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.89 
 
 
363 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.182893  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1795  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.74 
 
 
328 aa  188  9e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000162915  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5700  peptide ABC transporter, permease protein  34.94 
 
 
333 aa  188  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.385239  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1596  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.49 
 
 
329 aa  187  2e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.349408  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4666  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.92 
 
 
332 aa  187  2e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1546  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.49 
 
 
329 aa  187  2e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.201303  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1434  peptide ABC transporter, permease protein  35.62 
 
 
326 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.393954  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0394  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, permease protein  34.78 
 
 
320 aa  184  2.0000000000000003e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1137  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.03 
 
 
344 aa  183  4.0000000000000006e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0958973 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19900  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  34.06 
 
 
348 aa  182  5.0000000000000004e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00317245  hitchhiker  0.000399681 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2762  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.89 
 
 
322 aa  182  8.000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.3137  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0486  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
335 aa  182  1e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0237  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.32 
 
 
335 aa  181  2e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0397671  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.73 
 
 
336 aa  181  2e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.63253  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2378  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.58 
 
 
327 aa  180  2.9999999999999997e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0410349  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4795  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.02 
 
 
319 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.540957  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3886  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.85 
 
 
339 aa  180  4e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.431953  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1235  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.29 
 
 
333 aa  179  5.999999999999999e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.391976  normal  0.26803 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7447  ABC transporter, permease  33.96 
 
 
346 aa  177  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.268858  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3995  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.92 
 
 
325 aa  177  2e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3168  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.23 
 
 
317 aa  177  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1554  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.76 
 
 
329 aa  176  3e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.136155  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3465  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.72 
 
 
319 aa  176  3e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0197211  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2083  ABC transporter, permease  33.65 
 
 
354 aa  177  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.899813  normal  0.534674 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0408  peptide ABC transporter, permease protein  32.3 
 
 
319 aa  176  5e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.599742  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3656  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.22 
 
 
331 aa  176  5e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0220  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.51 
 
 
318 aa  176  6e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0351  peptide ABC transporter, permease protein  32.3 
 
 
319 aa  175  8e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0622  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.14 
 
 
365 aa  175  9e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1722  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.13 
 
 
333 aa  175  9.999999999999999e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.181777  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4683  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.37 
 
 
305 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5079  oligopeptide ABC transporter, permease protein  31.58 
 
 
318 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.823719  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2014  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.88 
 
 
325 aa  173  5e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.169122  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3489  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.82 
 
 
340 aa  172  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0246  oligopeptide ABC transporter, permease protein  31.82 
 
 
307 aa  171  1e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0542782  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0267  oligopeptide ABC transporter, permease protein  30.65 
 
 
318 aa  171  2e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1614  oligopeptide ABC transporter, permease protein  33.76 
 
 
304 aa  171  2e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0209  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.58 
 
 
318 aa  170  3e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2033  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.64 
 
 
324 aa  170  4e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0206  oligopeptide ABC transporter, permease  30.96 
 
 
318 aa  169  5e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0344  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.62 
 
 
323 aa  169  5e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0139  dipeptide transporter permease DppB  32.25 
 
 
351 aa  168  1e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>