More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_2378 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_2378  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
327 aa  663    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0410349  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0733  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.62 
 
 
328 aa  351  1e-95  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1269  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  38.64 
 
 
324 aa  221  9.999999999999999e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1899  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.23 
 
 
328 aa  208  1e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.227474  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1614  oligopeptide ABC transporter, permease protein  34.64 
 
 
304 aa  206  4e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1036  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.22 
 
 
308 aa  205  7e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1493  peptide ABC transporter, permease protein  38.87 
 
 
324 aa  204  2e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1283  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.87 
 
 
324 aa  204  2e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0425  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.73 
 
 
324 aa  203  4e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.366309  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2762  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.2 
 
 
322 aa  202  8e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.3137  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5234  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.11 
 
 
323 aa  201  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2013  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  36.68 
 
 
326 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5371  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.4 
 
 
355 aa  201  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.543092 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4328  putative ABC transporter, permease protein  36.31 
 
 
325 aa  199  7e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0959  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.04 
 
 
311 aa  198  1.0000000000000001e-49  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0394  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, permease protein  34.17 
 
 
320 aa  197  2.0000000000000003e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1752  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.22 
 
 
319 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.17237 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2572  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.25 
 
 
340 aa  196  3e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1151  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.02 
 
 
325 aa  197  3e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.15877 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3197  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.19 
 
 
328 aa  196  6e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  unclonable  0.0000000643204  unclonable  0.00000000002362 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0568  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.22 
 
 
321 aa  194  1e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4291  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.39 
 
 
338 aa  194  1e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19900  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  34.48 
 
 
348 aa  194  2e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00317245  hitchhiker  0.000399681 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1766  peptide ABC transporter, permease protein  35.09 
 
 
321 aa  194  2e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.147265  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3489  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.92 
 
 
340 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2197  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.05 
 
 
325 aa  194  2e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000755906  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1508  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.53 
 
 
323 aa  194  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.929546  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2643  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.73 
 
 
326 aa  193  3e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2577  ABC-type [(GlcNAc)2] transporter, permease protein  35.58 
 
 
328 aa  193  3e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3220  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.8 
 
 
323 aa  193  4e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.259028  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3568  oligopeptide ABC transporter, permease  36.22 
 
 
327 aa  193  4e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0709186 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2259  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.99 
 
 
320 aa  193  4e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000183272  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3132  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.92 
 
 
340 aa  192  5e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.214587 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2502  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.24 
 
 
333 aa  192  8e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0210  oligopeptide ABC transporter, permease  35 
 
 
318 aa  191  1e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0232  oligopeptide ABC transporter permease protein  35 
 
 
318 aa  191  1e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.96 
 
 
321 aa  191  1e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0692911 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1667  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.43 
 
 
335 aa  191  1e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1601  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.43 
 
 
335 aa  191  1e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0249  oligopeptide ABC transporter, permease protein  35 
 
 
318 aa  191  2e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2548  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37 
 
 
328 aa  191  2e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.892452  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0692  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.47 
 
 
321 aa  191  2e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1312  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.56 
 
 
318 aa  190  2.9999999999999997e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.823001  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0615  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.28 
 
 
321 aa  189  5e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.793124  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7447  ABC transporter, permease  34.16 
 
 
346 aa  189  5e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.268858  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6143  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.02 
 
 
329 aa  189  7e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.637959  normal  0.0297418 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0172  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.8 
 
 
326 aa  188  9e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.774382  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7557  putative dipeptide ABC transporter (permease protein)  33.85 
 
 
323 aa  188  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1040  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.59 
 
 
325 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.314534  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1650  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.53 
 
 
323 aa  188  1e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.950445 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0105  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.64 
 
 
326 aa  188  1e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.109225  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0521  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.02 
 
 
321 aa  188  1e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2789  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.29 
 
 
306 aa  187  2e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5300  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  34.58 
 
 
316 aa  187  2e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.340844  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4284  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.81 
 
 
323 aa  187  2e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.181861  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0131  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.87 
 
 
326 aa  187  3e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4253  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.16 
 
 
336 aa  187  3e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.144815  normal  0.108193 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2917  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.7 
 
 
325 aa  186  4e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0648374  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1615  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.26 
 
 
340 aa  186  4e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00450006  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6685  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.16 
 
 
325 aa  186  4e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0249193  normal  0.645834 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2389  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.85 
 
 
329 aa  186  5e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0219  oligopeptide ABC transporter permease  35.39 
 
 
307 aa  186  6e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0242  oligopeptide ABC transporter, permease protein  35.39 
 
 
307 aa  186  6e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2083  ABC transporter, permease  33.23 
 
 
354 aa  185  7e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.899813  normal  0.534674 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1591  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.38 
 
 
326 aa  186  7e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.75386 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3797  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.37 
 
 
325 aa  185  8e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2727  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.57 
 
 
331 aa  185  9e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0267  oligopeptide ABC transporter, permease protein  33.12 
 
 
318 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0896  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.9 
 
 
343 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1189  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.63 
 
 
335 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0375099  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5781  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.54 
 
 
325 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.100059 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0562  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.06 
 
 
322 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.618484  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0163  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.14 
 
 
361 aa  184  1.0000000000000001e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1620  peptide ABC transporter, permease protein  33.23 
 
 
321 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.911317 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0238  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.37 
 
 
322 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.438501  normal  0.539415 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1808  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.21 
 
 
328 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0632  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.22 
 
 
356 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.637642  normal  0.973123 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2797  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.48 
 
 
319 aa  184  2.0000000000000003e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0399  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
325 aa  184  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0481  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.29 
 
 
324 aa  184  2.0000000000000003e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.399045  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0206  oligopeptide ABC transporter, permease  32.5 
 
 
318 aa  183  3e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0220  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.5 
 
 
318 aa  184  3e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1434  peptide ABC transporter, permease protein  34.77 
 
 
326 aa  183  4.0000000000000006e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.393954  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03424  hypothetical protein  34.05 
 
 
328 aa  183  4.0000000000000006e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2033  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.69 
 
 
324 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4405  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.64 
 
 
325 aa  182  5.0000000000000004e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.271633 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0930  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.42 
 
 
330 aa  182  8.000000000000001e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2396  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.44 
 
 
325 aa  182  9.000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3168  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.86 
 
 
317 aa  182  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2958  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.12 
 
 
315 aa  181  1e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2050  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.66 
 
 
325 aa  180  2e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0148  peptide ABC transporter, permease protein  33.94 
 
 
328 aa  181  2e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1235  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.88 
 
 
333 aa  180  2e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.391976  normal  0.26803 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0209  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.19 
 
 
318 aa  181  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6558  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.38 
 
 
329 aa  181  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.487916  normal  0.350225 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002585  (GlcNAc)2 ABC transporter permease component 1  34.05 
 
 
328 aa  181  2e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0785  peptide ABC transporter, permease protein  32.19 
 
 
332 aa  180  2.9999999999999997e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.334762  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3967  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.45 
 
 
333 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.979958  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7457  peptide ABC transporter, permease protein  34.26 
 
 
334 aa  180  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.48372 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1399  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.06 
 
 
325 aa  179  4e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.895981  normal  0.8818 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>