More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6143 on replicon NC_012852
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012852  Rleg_6143  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
329 aa  625  1e-178  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.637959  normal  0.0297418 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6558  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  95.12 
 
 
329 aa  598  1e-170  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.487916  normal  0.350225 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0785  peptide ABC transporter, permease protein  64.81 
 
 
332 aa  406  1.0000000000000001e-112  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.334762  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3967  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63.83 
 
 
333 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.979958  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0736  peptide ABC transporter, permease protein  64.81 
 
 
327 aa  407  1.0000000000000001e-112  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1151  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.24 
 
 
325 aa  325  6e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.15877 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2013  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  53.48 
 
 
326 aa  319  3.9999999999999996e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4328  putative ABC transporter, permease protein  52.68 
 
 
325 aa  314  9.999999999999999e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1040  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  54.97 
 
 
325 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.314534  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2917  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.35 
 
 
325 aa  311  1e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0648374  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3319  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.73 
 
 
327 aa  301  1e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2762  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.63 
 
 
322 aa  271  9e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.3137  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2572  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.01 
 
 
340 aa  271  1e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2548  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.75 
 
 
328 aa  268  1e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.892452  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3132  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  46.58 
 
 
340 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.214587 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3489  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.93 
 
 
340 aa  263  3e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4291  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.63 
 
 
338 aa  261  2e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7182  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  46.01 
 
 
329 aa  255  9e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4253  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.21 
 
 
336 aa  254  1.0000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.144815  normal  0.108193 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2971  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.08 
 
 
322 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0636999  normal  0.258787 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5655  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.32 
 
 
328 aa  253  3e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1978  putative ABC transporter  49.21 
 
 
321 aa  251  2e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.878457  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1508  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.67 
 
 
323 aa  249  5e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.929546  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7557  putative dipeptide ABC transporter (permease protein)  43.77 
 
 
323 aa  248  9e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5234  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.79 
 
 
323 aa  248  1e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1650  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  43.43 
 
 
323 aa  247  2e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.950445 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0425  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.55 
 
 
324 aa  246  4e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.366309  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3220  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.08 
 
 
323 aa  242  5e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.259028  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1564  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  44.3 
 
 
326 aa  242  5e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0141  peptide/opine/nickel ABC transporter inner membrane protein  44.27 
 
 
326 aa  241  1e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.805537 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0746  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.77 
 
 
333 aa  238  9e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1808  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.38 
 
 
328 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2568  ABC transporter permease  43.93 
 
 
328 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.577987  normal  0.256762 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1615  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.19 
 
 
340 aa  231  1e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00450006  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0131  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  40.94 
 
 
326 aa  231  2e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4763  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.24 
 
 
327 aa  231  2e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1235  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  40.12 
 
 
333 aa  226  3e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.391976  normal  0.26803 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5137  putative peptide ABC transporter protein, permease protein  45.19 
 
 
339 aa  226  3e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0417349 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0105  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.8 
 
 
326 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.109225  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0670  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.14 
 
 
323 aa  225  6e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.372701  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4861  putative ABC transporter, permease protein  45.03 
 
 
328 aa  224  1e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.373975  normal  0.482234 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4284  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.09 
 
 
323 aa  223  3e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.181861  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1591  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.94 
 
 
326 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.75386 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1869  ABC-type transport system protein  42.41 
 
 
324 aa  221  9.999999999999999e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2050  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.95 
 
 
325 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3081  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  43.17 
 
 
322 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.957751  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2643  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40 
 
 
326 aa  218  1e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0394  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, permease protein  35.71 
 
 
320 aa  217  2e-55  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1434  peptide ABC transporter, permease protein  39.38 
 
 
326 aa  216  4e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.393954  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5670  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.12 
 
 
325 aa  216  4e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.26218  normal  0.0546823 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0562  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.74 
 
 
322 aa  215  8e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.618484  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2014  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.06 
 
 
325 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.169122  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2033  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.99 
 
 
324 aa  211  1e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3846  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.82 
 
 
307 aa  204  2e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.089816 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2757  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.17 
 
 
306 aa  201  9.999999999999999e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2499  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.06 
 
 
334 aa  201  1.9999999999999998e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0750217 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0478  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.7 
 
 
321 aa  199  5e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1409  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.11 
 
 
313 aa  197  3e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0709141  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1498  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  38.66 
 
 
308 aa  197  3e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.241637  normal  0.263961 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3801  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.39 
 
 
314 aa  196  5.000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.207674 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1001  oligopeptide ABC transporter, permease protein  34.08 
 
 
316 aa  194  1e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0808  oligopeptide ABC transporter, permease  33.12 
 
 
316 aa  194  1e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.282065  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0196  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.75 
 
 
328 aa  194  1e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2554  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, permease protein  34.18 
 
 
321 aa  194  1e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2259  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.78 
 
 
320 aa  194  2e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000183272  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4385  oligopeptide ABC transporter, permease protein  33.12 
 
 
316 aa  194  2e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  1.02052e-22 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0823  oligopeptide ABC transporter, permease  33.44 
 
 
316 aa  193  4e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.164685  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0804  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.44 
 
 
316 aa  193  4e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00583871  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1760  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.63 
 
 
327 aa  193  4e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.303852  normal  0.27124 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2257  oligopeptide ABC transporter, permease component  33.86 
 
 
321 aa  192  5e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2083  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.63 
 
 
327 aa  192  6e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0946  oligopeptide ABC transporter, permease protein  32.8 
 
 
316 aa  192  6e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.170303  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0779  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.54 
 
 
339 aa  192  7e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0777268  normal  0.809759 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3132  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.44 
 
 
326 aa  192  8e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.467018  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2003  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.02 
 
 
315 aa  191  1e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.872908 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4693  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.79 
 
 
324 aa  191  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2593  oligopeptide ABC transporter, permease protein  37.54 
 
 
343 aa  191  1e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1214  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.69 
 
 
344 aa  192  1e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0521  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.02 
 
 
321 aa  191  1e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1355  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.08 
 
 
319 aa  191  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1444  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.67 
 
 
323 aa  190  2.9999999999999997e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2869  transmembrane dipeptide transport system permease ABC transporter protein  37.65 
 
 
325 aa  189  4e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0598671  normal  0.76334 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0997  oligopeptide ABC transporter, permease protein  32.8 
 
 
316 aa  189  5e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.28482e-62 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0210  oligopeptide ABC transporter, permease  33.54 
 
 
318 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0232  oligopeptide ABC transporter permease protein  33.54 
 
 
318 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0267  oligopeptide ABC transporter, permease protein  33.23 
 
 
318 aa  189  7e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0959  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.34 
 
 
311 aa  189  7e-47  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2856  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.8 
 
 
322 aa  189  8e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.205475 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0220  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.85 
 
 
318 aa  189  8e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0262  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.99 
 
 
320 aa  189  8e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.663455  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0249  oligopeptide ABC transporter, permease protein  33.54 
 
 
318 aa  188  9e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0206  oligopeptide ABC transporter, permease  33.23 
 
 
318 aa  188  9e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1275  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, permease protein  36.74 
 
 
317 aa  188  1e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000495045  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0920  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.29 
 
 
343 aa  188  1e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.416644 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0644  oligopeptide ABC transporter, permease protein  35.51 
 
 
314 aa  188  1e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0933  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.19 
 
 
313 aa  188  1e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5256  putative ABC transporter (permease protein)  35.53 
 
 
313 aa  188  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.173409  normal  0.132635 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1413  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.53 
 
 
332 aa  188  1e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.739242 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5079  oligopeptide ABC transporter, permease protein  33.23 
 
 
318 aa  187  2e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.823719  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0859  oligopeptide ABC transporter permease  32.8 
 
 
316 aa  187  2e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>