More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5670 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5670  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 		 325 aa  632  1e-180  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.26218  normal  0.0546823 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4291  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  79.88 
 
 		 338 aa  504  1e-141  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0131  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  63.67 
 
 		 326 aa  398  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0105  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.62 
 
 		 326 aa  385  1e-106  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.109225  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4763  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63.93 
 
 		 327 aa  387  1e-106  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4284  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.43 
 
 		 323 aa  363  2e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.181861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7557  putative dipeptide ABC transporter (permease protein)  49.21 
 
 		 323 aa  312  4.999999999999999e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3489  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.19 
 
 		 340 aa  300  3e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0425  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.95 
 
 		 324 aa  299  4e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.366309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2572  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.87 
 
 		 340 aa  297  2e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1508  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.37 
 
 		 323 aa  296  4e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.929546  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5234  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47 
 
 		 323 aa  294  1e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2762  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.47 
 
 		 322 aa  293  2e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.3137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3132  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  48.22 
 
 		 340 aa  290  3e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.214587 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2568  ABC transporter permease  50.81 
 
 		 328 aa  281  1e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.577987  normal  0.256762 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1650  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  45.85 
 
 		 323 aa  280  2e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.950445 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0746  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.81 
 
 		 333 aa  278  1e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1615  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.3 
 
 		 340 aa  277  2e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00450006  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2499  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.43 
 
 		 334 aa  273  2.0000000000000002e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0750217 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4253  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.46 
 
 		 336 aa  273  3e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.144815  normal  0.108193 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3319  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.09 
 
 		 327 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3220  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.04 
 
 		 323 aa  269  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.259028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1151  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.11 
 
 		 325 aa  268  7e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.15877 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2013  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  45.11 
 
 		 326 aa  267  2e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2917  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.62 
 
 		 325 aa  263  2e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0648374  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1040  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  47.28 
 
 		 325 aa  264  2e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.314534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4328  putative ABC transporter, permease protein  44.3 
 
 		 325 aa  263  3e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0670  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.47 
 
 		 323 aa  263  4e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.372701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2050  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.08 
 
 		 325 aa  257  1e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2971  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.6 
 
 		 322 aa  256  4e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0636999  normal  0.258787 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3967  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.27 
 
 		 333 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.979958  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.12 
 
 		 334 aa  253  2.0000000000000002e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000955673 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7182  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  45.6 
 
 		 329 aa  253  3e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1223  Nickel-transporting ATPase  42.04 
 
 		 339 aa  253  4.0000000000000004e-66  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0308435 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0562  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.65 
 
 		 322 aa  252  5.000000000000001e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.618484  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2757  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.69 
 
 		 306 aa  251  8.000000000000001e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0785  peptide ABC transporter, permease protein  43.08 
 
 		 332 aa  251  2e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.334762  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1184  dipeptide ABC transporter, permease protein  40.54 
 
 		 333 aa  251  2e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0134333  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5655  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.27 
 
 		 328 aa  249  3e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2812  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.74 
 
 		 336 aa  249  3e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.532586  normal  0.117752 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2548  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.67 
 
 		 328 aa  249  4e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.892452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0736  peptide ABC transporter, permease protein  42.77 
 
 		 327 aa  249  6e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1591  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.45 
 
 		 326 aa  249  6e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.75386 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3081  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  44.69 
 
 		 322 aa  248  1e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.957751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3039  nickel-transporting ATPase  41.74 
 
 		 336 aa  248  1e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.408808 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1235  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  40.88 
 
 		 333 aa  247  2e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.391976  normal  0.26803 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1597  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.64 
 
 		 332 aa  247  2e-64  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.474892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2643  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.82 
 
 		 326 aa  247  2e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2054  peptide ABC transporter permease  41.74 
 
 		 336 aa  247  2e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0359637  normal  0.365039 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1869  ABC-type transport system protein  42.09 
 
 		 324 aa  246  3e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0489  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.14 
 
 		 336 aa  245  6.999999999999999e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3063  alkaline phosphatase  41.44 
 
 		 336 aa  245  9e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.273839 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6143  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.38 
 
 		 329 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.637959  normal  0.0297418 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1409  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.9 
 
 		 313 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0709141  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0478  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.38 
 
 		 321 aa  244  1.9999999999999999e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0408  peptide ABC transporter, permease protein  43.93 
 
 		 319 aa  243  1.9999999999999999e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.599742  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1434  peptide ABC transporter, permease protein  39.94 
 
 		 326 aa  243  3e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.393954  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0395  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.04 
 
 		 334 aa  243  3e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2430  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.44 
 
 		 336 aa  243  3e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3044  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.44 
 
 		 336 aa  243  3e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6391  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, inner membrane subunit  41.21 
 
 		 336 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.314486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2955  alkaline phosphatase  41.21 
 
 		 336 aa  242  5e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3089  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.21 
 
 		 336 aa  243  5e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4911  dipeptide transporter permease DppB  40.59 
 
 		 381 aa  242  6e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5137  putative peptide ABC transporter protein, permease protein  46.67 
 
 		 339 aa  242  6e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0417349 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0933  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.63 
 
 		 313 aa  242  7e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03394  dipeptide transporter  40.48 
 
 		 339 aa  241  1e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0169  Alkaline phosphatase  40.48 
 
 		 339 aa  241  1e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4035  dipeptide transporter permease DppB  40.48 
 
 		 339 aa  241  1e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03345  hypothetical protein  40.48 
 
 		 339 aa  241  1e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3988  dipeptide transporter permease DppB  40.48 
 
 		 339 aa  241  1e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3742  dipeptide transporter permease DppB  40.48 
 
 		 339 aa  241  1e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0172  dipeptide transporter permease DppB  40.48 
 
 		 339 aa  241  1e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1691  alkaline phosphatase  43.24 
 
 		 336 aa  241  1e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.218764 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6558  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.07 
 
 		 329 aa  241  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.487916  normal  0.350225 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3862  dipeptide transporter permease DppB  40.48 
 
 		 339 aa  241  1e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3949  dipeptide transporter permease DppB  40.48 
 
 		 339 aa  241  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.788898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3905  dipeptide transporter permease DppB  40.48 
 
 		 339 aa  240  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3827  dipeptide transporter permease DppB  40.48 
 
 		 339 aa  241  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4009  dipeptide transporter permease DppB  40.48 
 
 		 339 aa  241  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0351  peptide ABC transporter, permease protein  43.61 
 
 		 319 aa  240  2e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3841  dipeptide transporter permease DppB  40.48 
 
 		 339 aa  241  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1136  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.62 
 
 		 309 aa  239  2.9999999999999997e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000195869  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0185  dipeptide transporter permease DppB  40.48 
 
 		 339 aa  240  2.9999999999999997e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.446355  normal  0.432086 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1620  peptide ABC transporter, permease protein  38.63 
 
 		 321 aa  240  2.9999999999999997e-62  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.911317 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2014  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.12 
 
 		 325 aa  239  4e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.169122  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1766  peptide ABC transporter, permease protein  39.94 
 
 		 321 aa  239  5e-62  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.147265  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0657  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.89 
 
 		 313 aa  238  8e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.18227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0221  dipeptide ABC transporter, permease protein  40.54 
 
 		 336 aa  238  1e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1953  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.6 
 
 		 334 aa  238  1e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.186843  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4779  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.69 
 
 		 319 aa  237  2e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000244558 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3906  dipeptide transporter permease DppB  40.12 
 
 		 339 aa  237  2e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4337  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.69 
 
 		 319 aa  237  2e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.692549  normal  0.354058 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3989  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.81 
 
 		 306 aa  236  3e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3257  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  42.81 
 
 		 306 aa  237  3e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1197  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.32 
 
 		 313 aa  236  3e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0692  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.99 
 
 		 321 aa  236  3e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3753  Alkaline phosphatase  39.94 
 
 		 336 aa  236  4e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.634321 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19900  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  44.72 
 
 		 348 aa  236  4e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00317245  hitchhiker  0.000399681 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0386  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.89 
 
 		 312 aa  236  5.0000000000000005e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>