More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0394 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE0394  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, permease protein  100 
 
 
320 aa  631  1e-180  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7557  putative dipeptide ABC transporter (permease protein)  40.68 
 
 
323 aa  266  5e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2572  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.13 
 
 
340 aa  253  3e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3489  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.23 
 
 
340 aa  253  3e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1650  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  42.33 
 
 
323 aa  250  2e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.950445 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5234  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.48 
 
 
323 aa  247  2e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1508  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.06 
 
 
323 aa  247  2e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.929546  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3132  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  39.14 
 
 
340 aa  246  4e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.214587 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4291  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.5 
 
 
338 aa  245  6e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0425  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.16 
 
 
324 aa  245  8e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.366309  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2762  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.13 
 
 
322 aa  245  8e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.3137  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4253  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.62 
 
 
336 aa  241  1e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.144815  normal  0.108193 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1615  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.63 
 
 
340 aa  235  8e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00450006  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0478  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.25 
 
 
321 aa  230  2e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2259  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.11 
 
 
320 aa  226  5.0000000000000005e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000183272  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4284  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.99 
 
 
323 aa  225  9e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.181861  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6143  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.71 
 
 
329 aa  223  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.637959  normal  0.0297418 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2013  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  36.28 
 
 
326 aa  223  3e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0746  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.2 
 
 
333 aa  223  3e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0670  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.24 
 
 
323 aa  222  6e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.372701  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0105  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.12 
 
 
326 aa  222  7e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.109225  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3967  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.24 
 
 
333 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.979958  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0933  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.94 
 
 
313 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3220  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.24 
 
 
323 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.259028  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2985  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.69 
 
 
313 aa  219  6e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.348462  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6558  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.78 
 
 
329 aa  219  7e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.487916  normal  0.350225 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0131  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  36.33 
 
 
326 aa  219  7e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3693  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.62 
 
 
333 aa  219  7e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2797  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.94 
 
 
319 aa  218  1e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4328  putative ABC transporter, permease protein  36.74 
 
 
325 aa  218  1e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0785  peptide ABC transporter, permease protein  34.92 
 
 
332 aa  217  2e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.334762  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2548  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.65 
 
 
328 aa  216  2.9999999999999998e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.892452  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2554  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, permease protein  37.19 
 
 
321 aa  216  2.9999999999999998e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2757  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.45 
 
 
306 aa  216  4e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5762  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35 
 
 
313 aa  216  4e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000799384  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3797  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.02 
 
 
325 aa  216  4e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2257  oligopeptide ABC transporter, permease component  37.19 
 
 
321 aa  216  5.9999999999999996e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0399  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.4 
 
 
325 aa  216  5.9999999999999996e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19900  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  32.49 
 
 
348 aa  215  7e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00317245  hitchhiker  0.000399681 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0657  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.31 
 
 
313 aa  215  7e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.18227  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0736  peptide ABC transporter, permease protein  34.6 
 
 
327 aa  215  8e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0113  nickel-transporting ATPase  36.53 
 
 
336 aa  214  9.999999999999999e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0562  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.41 
 
 
322 aa  214  9.999999999999999e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.618484  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4763  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.42 
 
 
327 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7327  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  36.2 
 
 
306 aa  215  9.999999999999999e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4385  oligopeptide ABC transporter, permease protein  35.42 
 
 
316 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  1.02052e-22 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1151  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.78 
 
 
325 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.15877 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3319  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.12 
 
 
327 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0808  oligopeptide ABC transporter, permease  35.42 
 
 
316 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.282065  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.69 
 
 
313 aa  212  5.999999999999999e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.000789572  normal  0.0157107 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0946  oligopeptide ABC transporter, permease protein  35.11 
 
 
316 aa  212  7e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.170303  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0823  oligopeptide ABC transporter, permease  35.42 
 
 
316 aa  211  1e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.164685  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0632  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.5 
 
 
356 aa  211  1e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.637642  normal  0.973123 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5088  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  35.94 
 
 
313 aa  211  2e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5371  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.96 
 
 
355 aa  209  5e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.543092 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1040  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  37.33 
 
 
325 aa  209  5e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.314534  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1409  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35 
 
 
313 aa  209  5e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0709141  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0139  dipeptide transporter permease DppB  32.94 
 
 
351 aa  209  6e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0804  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.11 
 
 
316 aa  209  6e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00583871  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0997  oligopeptide ABC transporter, permease protein  35.11 
 
 
316 aa  209  7e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.28482e-62 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0089  dipeptide transporter permease DppB  33.23 
 
 
339 aa  209  7e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.297234  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2917  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.99 
 
 
325 aa  209  7e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0648374  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4074  dipeptide transporter permease DppB  33.23 
 
 
339 aa  209  7e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0311  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.92 
 
 
313 aa  208  8e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1001  oligopeptide ABC transporter, permease protein  35.11 
 
 
316 aa  208  1e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1269  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  32.8 
 
 
324 aa  208  1e-52  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7447  ABC transporter, permease  30 
 
 
346 aa  207  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.268858  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3862  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.54 
 
 
313 aa  207  2e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00112579 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0521  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.22 
 
 
321 aa  207  2e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3039  nickel-transporting ATPase  33.23 
 
 
336 aa  207  2e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.408808 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3325  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.44 
 
 
317 aa  207  2e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.650589  normal  0.092891 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1597  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.15 
 
 
332 aa  206  3e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.474892  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1215  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.92 
 
 
313 aa  206  4e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1197  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.62 
 
 
313 aa  206  4e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5670  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.48 
 
 
325 aa  206  5e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.26218  normal  0.0546823 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0196  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.92 
 
 
328 aa  206  5e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2430  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.83 
 
 
336 aa  206  5e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3044  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.83 
 
 
336 aa  206  5e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0881  alkaline phosphatase  33.83 
 
 
336 aa  206  6e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0511  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.11 
 
 
314 aa  206  6e-52  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0859  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.93 
 
 
333 aa  206  6e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000322853  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3402  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.45 
 
 
322 aa  206  6e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.414511 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0920  alkaline phosphatase  33.83 
 
 
336 aa  206  6e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.745476  normal  0.672413 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1978  putative ABC transporter  34.58 
 
 
321 aa  206  6e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.878457  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3392  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.45 
 
 
322 aa  206  6e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3454  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.45 
 
 
322 aa  206  6e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0476049  normal  0.20897 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3774  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35 
 
 
320 aa  205  7e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.542684  normal  0.67395 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16520  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  33.85 
 
 
321 aa  205  9e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.488375  normal  0.713064 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0859  oligopeptide ABC transporter permease  34.8 
 
 
316 aa  205  9e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0909  oligopeptide ABC transporter permease protein  34.8 
 
 
316 aa  205  9e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0836804  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3063  alkaline phosphatase  33.83 
 
 
336 aa  205  9e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.273839 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0924  alkaline phosphatase  33.83 
 
 
336 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2812  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.63 
 
 
336 aa  205  1e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.532586  normal  0.117752 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4297  alkaline phosphatase  33.83 
 
 
336 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.259448  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2499  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.23 
 
 
334 aa  204  1e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0750217 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3004  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.05 
 
 
306 aa  205  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1585  dipeptide ABC transporter, permease protein  33.53 
 
 
335 aa  204  2e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.280526  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0627  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.62 
 
 
306 aa  204  2e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.579769  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2568  ABC transporter permease  34.53 
 
 
328 aa  204  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.577987  normal  0.256762 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0408  peptide ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 
319 aa  203  3e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.599742  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>