More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5371 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_5371  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
355 aa  698    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.543092 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2083  ABC transporter, permease  56.55 
 
 
354 aa  381  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.899813  normal  0.534674 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19900  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  56.46 
 
 
348 aa  377  1e-103  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00317245  hitchhiker  0.000399681 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0632  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.03 
 
 
356 aa  375  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.637642  normal  0.973123 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3465  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.75 
 
 
319 aa  355  6.999999999999999e-97  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0197211  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7447  ABC transporter, permease  51.52 
 
 
346 aa  344  1e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.268858  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3197  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.32 
 
 
328 aa  334  1e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  unclonable  0.0000000643204  unclonable  0.00000000002362 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5234  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.75 
 
 
323 aa  224  1e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0425  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.89 
 
 
324 aa  223  4e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.366309  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1508  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.32 
 
 
323 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.929546  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4291  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.56 
 
 
338 aa  218  8.999999999999998e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4284  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.72 
 
 
323 aa  215  7e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.181861  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2259  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.56 
 
 
320 aa  212  7e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000183272  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2985  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.63 
 
 
313 aa  211  2e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.348462  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0489  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.8 
 
 
336 aa  209  7e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1691  alkaline phosphatase  37.57 
 
 
336 aa  206  3e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.218764 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1650  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  40.98 
 
 
323 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.950445 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2389  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.65 
 
 
329 aa  205  1e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2762  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.38 
 
 
322 aa  204  2e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.3137  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2453  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.13 
 
 
334 aa  204  2e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17389  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7557  putative dipeptide ABC transporter (permease protein)  38.89 
 
 
323 aa  203  4e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0478  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.56 
 
 
321 aa  202  8e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0394  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, permease protein  33.96 
 
 
320 aa  202  9e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2812  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.9 
 
 
336 aa  201  9.999999999999999e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.532586  normal  0.117752 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.69 
 
 
313 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.000789572  normal  0.0157107 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0408  peptide ABC transporter, permease protein  38.77 
 
 
319 aa  201  1.9999999999999998e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.599742  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3232  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  36.83 
 
 
335 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.624237  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0351  peptide ABC transporter, permease protein  38.77 
 
 
319 aa  201  1.9999999999999998e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0746  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.64 
 
 
333 aa  201  1.9999999999999998e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3970  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.83 
 
 
335 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2797  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.71 
 
 
319 aa  200  3.9999999999999996e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0733  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.84 
 
 
328 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5300  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  39.01 
 
 
316 aa  200  3.9999999999999996e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.340844  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1269  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  36.59 
 
 
324 aa  199  5e-50  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1953  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.04 
 
 
334 aa  199  5e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.186843  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3489  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.54 
 
 
340 aa  199  5e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3325  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.63 
 
 
317 aa  199  5e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.650589  normal  0.092891 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2197  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.58 
 
 
325 aa  199  7e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000755906  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3964  hypothetical protein  36.23 
 
 
335 aa  199  7e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.1929 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0423  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.24 
 
 
334 aa  199  9e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0103751  normal  0.0395583 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3989  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.74 
 
 
306 aa  199  9e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2572  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.29 
 
 
340 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3257  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  35.74 
 
 
306 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1670  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.45 
 
 
335 aa  198  1.0000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.851486 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2054  peptide ABC transporter permease  36.69 
 
 
336 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0359637  normal  0.365039 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1215  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.01 
 
 
313 aa  197  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3104  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.07 
 
 
306 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0391  Nickel-transporting ATPase  34.94 
 
 
334 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.941274  normal  0.201292 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0401  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.01 
 
 
313 aa  197  3e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5762  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.58 
 
 
313 aa  197  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000799384  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1136  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.69 
 
 
309 aa  197  3e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000195869  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0670  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.17 
 
 
323 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.372701  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0045  dipeptide transporter permease DppB  36.42 
 
 
339 aa  196  5.000000000000001e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2499  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.73 
 
 
334 aa  196  6e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0750217 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1189  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.22 
 
 
335 aa  196  6e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0375099  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3039  nickel-transporting ATPase  37.57 
 
 
336 aa  196  6e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.408808 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0050  dipeptide transporter permease DppB  36.42 
 
 
339 aa  195  8.000000000000001e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.969756  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0010  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.39 
 
 
308 aa  195  9e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3636  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.72 
 
 
334 aa  195  1e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.273901  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3276  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.42 
 
 
306 aa  195  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.819891  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2209  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.88 
 
 
313 aa  195  1e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.459958  normal  0.0393248 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1615  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.65 
 
 
340 aa  195  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00450006  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3753  Alkaline phosphatase  37.09 
 
 
336 aa  195  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.634321 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4763  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.04 
 
 
327 aa  194  1e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1434  peptide ABC transporter, permease protein  35.6 
 
 
326 aa  194  2e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.393954  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5350  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  33.89 
 
 
359 aa  194  2e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5670  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.88 
 
 
325 aa  194  2e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.26218  normal  0.0546823 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1184  dipeptide ABC transporter, permease protein  33.43 
 
 
333 aa  194  2e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0134333  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2013  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  38.39 
 
 
326 aa  194  2e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3132  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  38.41 
 
 
340 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.214587 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0183  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter inner membrane protein  37.09 
 
 
336 aa  194  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1409  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.76 
 
 
306 aa  194  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.14841  normal  0.0482429 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0959  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.54 
 
 
311 aa  194  2e-48  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0395  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.05 
 
 
334 aa  194  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1223  Nickel-transporting ATPase  35.33 
 
 
339 aa  194  3e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0308435 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0627  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.89 
 
 
306 aa  193  3e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.579769  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0562  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.54 
 
 
322 aa  193  3e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.618484  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4911  dipeptide transporter permease DppB  35.14 
 
 
381 aa  193  4e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3906  dipeptide transporter permease DppB  36.12 
 
 
339 aa  192  7e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0131  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  37.54 
 
 
326 aa  192  7e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0209  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.89 
 
 
318 aa  192  8e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5088  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  38.94 
 
 
313 aa  192  8e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3995  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.56 
 
 
325 aa  192  8e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4592  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.14 
 
 
306 aa  192  8e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.740963 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0206  oligopeptide ABC transporter, permease  35 
 
 
318 aa  192  1e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3168  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.75 
 
 
317 aa  192  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0139  dipeptide transporter permease DppB  34.93 
 
 
351 aa  192  1e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3004  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.45 
 
 
306 aa  191  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1583  alkaline phosphatase  36.42 
 
 
335 aa  191  1e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.354079  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1752  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.11 
 
 
306 aa  191  2e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0655426  normal  0.0792402 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4215  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.05 
 
 
315 aa  191  2e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5079  oligopeptide ABC transporter, permease protein  35 
 
 
318 aa  191  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.823719  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2430  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.28 
 
 
336 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3089  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.2 
 
 
336 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3044  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.28 
 
 
336 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3063  alkaline phosphatase  37.28 
 
 
336 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.273839 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2955  alkaline phosphatase  37.2 
 
 
336 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2568  ABC transporter permease  39.94 
 
 
328 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.577987  normal  0.256762 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0933  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.94 
 
 
313 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0481  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.05 
 
 
324 aa  190  2.9999999999999997e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.399045  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>