More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0733 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_0733  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
328 aa  651    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2378  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.62 
 
 
327 aa  352  5.9999999999999994e-96  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0410349  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1269  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  40.37 
 
 
324 aa  236  3e-61  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1493  peptide ABC transporter, permease protein  40.44 
 
 
324 aa  226  4e-58  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1283  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.44 
 
 
324 aa  226  4e-58  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3568  oligopeptide ABC transporter, permease  41.88 
 
 
327 aa  217  2e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0709186 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2013  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  38.75 
 
 
326 aa  207  2e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19900  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  38.11 
 
 
348 aa  207  2e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00317245  hitchhiker  0.000399681 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5781  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.31 
 
 
325 aa  206  4e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.100059 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3132  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  38.87 
 
 
340 aa  205  9e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.214587 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0859  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.33 
 
 
339 aa  205  9e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5371  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.84 
 
 
355 aa  204  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.543092 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3197  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.46 
 
 
328 aa  205  1e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  unclonable  0.0000000643204  unclonable  0.00000000002362 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6685  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37 
 
 
325 aa  205  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0249193  normal  0.645834 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1399  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.46 
 
 
325 aa  202  6e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.895981  normal  0.8818 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3489  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.54 
 
 
340 aa  202  6e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2572  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.87 
 
 
340 aa  202  8e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4291  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.49 
 
 
338 aa  201  9.999999999999999e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1766  peptide ABC transporter, permease protein  38.27 
 
 
321 aa  200  1.9999999999999998e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.147265  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1312  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.62 
 
 
318 aa  200  1.9999999999999998e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.823001  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0632  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.54 
 
 
356 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.637642  normal  0.973123 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0163  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.43 
 
 
361 aa  199  3.9999999999999996e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0521  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.04 
 
 
321 aa  199  3.9999999999999996e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0344  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.1 
 
 
323 aa  199  6e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0481  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.77 
 
 
324 aa  199  6e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.399045  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5234  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.02 
 
 
323 aa  199  7e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3797  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.58 
 
 
325 aa  197  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0210  oligopeptide ABC transporter, permease  34.98 
 
 
318 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0232  oligopeptide ABC transporter permease protein  34.98 
 
 
318 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2757  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.48 
 
 
306 aa  198  1.0000000000000001e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0249  oligopeptide ABC transporter, permease protein  34.98 
 
 
318 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.65 
 
 
321 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0692911 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0425  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.02 
 
 
324 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.366309  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1899  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.6 
 
 
328 aa  197  3e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.227474  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2762  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.04 
 
 
322 aa  197  3e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.3137  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16520  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  34.8 
 
 
321 aa  196  4.0000000000000005e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.488375  normal  0.713064 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2197  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.78 
 
 
325 aa  196  4.0000000000000005e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000755906  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0562  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.64 
 
 
322 aa  195  8.000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.618484  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0329  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.69 
 
 
326 aa  195  8.000000000000001e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0219  oligopeptide ABC transporter permease  35.39 
 
 
307 aa  195  1e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2727  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.12 
 
 
331 aa  194  1e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0242  oligopeptide ABC transporter, permease protein  35.39 
 
 
307 aa  195  1e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01320  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  36 
 
 
328 aa  195  1e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.655147  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2389  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.75 
 
 
329 aa  194  2e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0206  oligopeptide ABC transporter, permease  34.16 
 
 
318 aa  194  2e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2083  ABC transporter, permease  34.89 
 
 
354 aa  194  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.899813  normal  0.534674 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3774  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.86 
 
 
320 aa  194  2e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.542684  normal  0.67395 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3319  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.2 
 
 
327 aa  194  2e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1189  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.93 
 
 
335 aa  194  3e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0375099  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1434  peptide ABC transporter, permease protein  36.36 
 
 
326 aa  193  3e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.393954  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0930  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.15 
 
 
330 aa  193  3e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3436  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.02 
 
 
315 aa  193  4e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.24032  normal  0.535319 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5079  oligopeptide ABC transporter, permease protein  34.16 
 
 
318 aa  193  4e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.823719  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1662  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.68 
 
 
314 aa  192  5e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.409377 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0399  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.89 
 
 
325 aa  192  5e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2622  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.71 
 
 
326 aa  192  6e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0394  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, permease protein  37.73 
 
 
320 aa  191  1e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0220  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.85 
 
 
318 aa  191  1e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0449  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.17 
 
 
316 aa  191  1e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.143195 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34920  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  36.59 
 
 
331 aa  191  1e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.949734  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0209  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.54 
 
 
318 aa  191  1e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2259  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.71 
 
 
320 aa  191  1e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000183272  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0267  oligopeptide ABC transporter, permease protein  33.23 
 
 
318 aa  191  2e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3649  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.05 
 
 
316 aa  191  2e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0627  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.89 
 
 
306 aa  190  2e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.579769  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1151  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.82 
 
 
325 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.15877 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2789  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.51 
 
 
306 aa  191  2e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6558  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.69 
 
 
329 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.487916  normal  0.350225 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1614  oligopeptide ABC transporter, permease protein  36.48 
 
 
304 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1620  peptide ABC transporter, permease protein  37.5 
 
 
321 aa  190  2.9999999999999997e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.911317 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0246  oligopeptide ABC transporter, permease protein  34.2 
 
 
307 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0542782  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4233  oligopeptide transport, system permease  34.23 
 
 
306 aa  189  4e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4245  oligopeptide ABC transporter, permease  34.23 
 
 
306 aa  189  4e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2971  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.64 
 
 
322 aa  189  4e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0636999  normal  0.258787 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4284  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.17 
 
 
323 aa  189  4e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.181861  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4610  oligopeptide ABC transporter, permease protein  34.23 
 
 
306 aa  189  4e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0131  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.67 
 
 
326 aa  189  5e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4392  oligopeptide ABC transporter permease  35.27 
 
 
306 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4732  oligopeptide ABC transporter permease protein  35.27 
 
 
306 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3276  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.17 
 
 
306 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.819891  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.67 
 
 
326 aa  188  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3257  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  34.17 
 
 
306 aa  188  1e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1680  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.89 
 
 
326 aa  188  1e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.473692  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1601  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.74 
 
 
335 aa  188  1e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3989  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.17 
 
 
306 aa  188  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2760  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.69 
 
 
316 aa  188  1e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6143  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.69 
 
 
329 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.637959  normal  0.0297418 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2744  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.2 
 
 
344 aa  187  2e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.480535  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2396  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.53 
 
 
325 aa  187  2e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3967  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.96 
 
 
333 aa  187  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.979958  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2033  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.92 
 
 
324 aa  187  2e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4253  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.47 
 
 
336 aa  187  2e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.144815  normal  0.108193 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4763  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.17 
 
 
327 aa  187  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1483  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.11 
 
 
326 aa  187  2e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.28032  normal  0.876961 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2548  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.58 
 
 
328 aa  187  2e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.892452  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4328  putative ABC transporter, permease protein  39.2 
 
 
325 aa  187  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0644  oligopeptide ABC transporter, permease protein  32.92 
 
 
314 aa  187  3e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2014  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.73 
 
 
325 aa  186  3e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.169122  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2958  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.11 
 
 
315 aa  187  3e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1667  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.44 
 
 
335 aa  187  3e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>