More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1189 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_1189  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
335 aa  657    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0375099  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1601  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  72.24 
 
 
335 aa  494  1e-139  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1667  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  72.24 
 
 
335 aa  494  1e-139  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1782  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  66.27 
 
 
335 aa  444  1e-123  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00282517  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0408  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.75 
 
 
340 aa  336  2.9999999999999997e-91  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.449597  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1382  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.49 
 
 
341 aa  310  2.9999999999999997e-83  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.714161  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4119  binding-protein-dependent transporter inner membrane protein  45.24 
 
 
341 aa  308  9e-83  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1510  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  45.83 
 
 
341 aa  307  2.0000000000000002e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000209407  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5077  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.9 
 
 
341 aa  304  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.568033 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0365  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.73 
 
 
341 aa  296  3e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0358  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.73 
 
 
341 aa  296  3e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1184  dipeptide ABC transporter, permease protein  40.3 
 
 
333 aa  284  1.0000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0134333  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2723  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.84 
 
 
363 aa  282  6.000000000000001e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0299866  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2454  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.3 
 
 
363 aa  274  2.0000000000000002e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000136904 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18030  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  41 
 
 
360 aa  271  8.000000000000001e-72  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.111375  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0604  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.9 
 
 
337 aa  270  2e-71  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.538486  hitchhiker  0.000000050567 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1223  Nickel-transporting ATPase  40.3 
 
 
339 aa  268  7e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0308435 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2453  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40 
 
 
334 aa  268  8.999999999999999e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17389  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1496  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.41 
 
 
337 aa  268  1e-70  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.992492  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5117  ABC transporter permease  39.76 
 
 
336 aa  267  2e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0859  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.64 
 
 
333 aa  267  2e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000322853  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0705  ABC-type oligopeptide transport system permease  43.88 
 
 
340 aa  266  4e-70  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.797816  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1353  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.39 
 
 
334 aa  266  4e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58440  ABC transporter permease  39.76 
 
 
336 aa  266  4e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.514083  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2499  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.84 
 
 
334 aa  265  5.999999999999999e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0750217 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0812  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  39.46 
 
 
336 aa  265  8.999999999999999e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.153061  normal  0.318777 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3263  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.41 
 
 
347 aa  263  2e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15391  putative ABC transporter, oligopeptides  43.88 
 
 
367 aa  264  2e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.134058  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1637  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.06 
 
 
341 aa  264  2e-69  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.188587  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2357  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  37.8 
 
 
336 aa  263  3e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0452163  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11441  putative ABC transporter of oligopeptides  41.62 
 
 
339 aa  262  4.999999999999999e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.333035  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0924  alkaline phosphatase  39.76 
 
 
336 aa  261  8e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4297  alkaline phosphatase  39.16 
 
 
336 aa  260  2e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.259448  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4562  dipeptide ABC transporter, permease protein  39.46 
 
 
336 aa  260  2e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4239  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  38.86 
 
 
336 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0349667  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0113  nickel-transporting ATPase  37.2 
 
 
336 aa  259  5.0000000000000005e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.34 
 
 
334 aa  259  5.0000000000000005e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000955673 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0881  alkaline phosphatase  38.86 
 
 
336 aa  259  6e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0920  alkaline phosphatase  38.86 
 
 
336 aa  259  6e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.745476  normal  0.672413 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3753  Alkaline phosphatase  37.16 
 
 
336 aa  257  2e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.634321 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0221  dipeptide ABC transporter, permease protein  36.56 
 
 
336 aa  257  2e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0183  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter inner membrane protein  37.46 
 
 
336 aa  257  2e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0489  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.16 
 
 
336 aa  256  3e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1254  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.09 
 
 
335 aa  256  3e-67  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.905382  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3039  nickel-transporting ATPase  37.05 
 
 
336 aa  256  4e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.408808 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2812  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.81 
 
 
336 aa  256  4e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.532586  normal  0.117752 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2955  alkaline phosphatase  36.94 
 
 
336 aa  256  5e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0420  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.8 
 
 
337 aa  255  6e-67  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2913  nickel-transporting ATPase  37.35 
 
 
337 aa  255  6e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3089  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.94 
 
 
336 aa  255  9e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6391  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, inner membrane subunit  36.34 
 
 
336 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.314486  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0212  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter permease  40.9 
 
 
363 aa  253  5.000000000000001e-66  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0206086  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0066  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.01 
 
 
334 aa  251  1e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3063  alkaline phosphatase  36.45 
 
 
336 aa  251  1e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.273839 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08851  putative ABC transporter, oligopeptides  42.51 
 
 
339 aa  251  2e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0045  dipeptide transporter permease DppB  36.58 
 
 
339 aa  249  5e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0050  dipeptide transporter permease DppB  36.58 
 
 
339 aa  248  7e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.969756  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2641  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.39 
 
 
332 aa  248  1e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1953  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.91 
 
 
334 aa  248  1e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.186843  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2430  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.14 
 
 
336 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3044  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.14 
 
 
336 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0454  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.58 
 
 
335 aa  247  2e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.948745  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1691  alkaline phosphatase  38.25 
 
 
336 aa  246  4e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.218764 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3905  dipeptide transporter permease DppB  37.35 
 
 
339 aa  246  4.9999999999999997e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2196  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.33 
 
 
334 aa  245  6e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3949  dipeptide transporter permease DppB  37.06 
 
 
339 aa  244  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.788898  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3841  dipeptide transporter permease DppB  37.06 
 
 
339 aa  244  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3827  dipeptide transporter permease DppB  37.06 
 
 
339 aa  244  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4009  dipeptide transporter permease DppB  37.06 
 
 
339 aa  244  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2054  peptide ABC transporter permease  37.65 
 
 
336 aa  244  9.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0359637  normal  0.365039 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0089  dipeptide transporter permease DppB  36.58 
 
 
339 aa  244  1.9999999999999999e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.297234  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0244  dipeptide ABC transporter, permease protein DppB  35.95 
 
 
336 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4074  dipeptide transporter permease DppB  36.58 
 
 
339 aa  244  1.9999999999999999e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0438  dipeptide ABC transporter, permease protein  35.65 
 
 
336 aa  243  3e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.287178  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1059  putative ABC transporter, oligopeptides  41.69 
 
 
340 aa  243  3e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0257  dipeptide ABC transporter, permease protein DppB  35.65 
 
 
336 aa  243  3e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0183254  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4097  dipeptide transporter permease DppB  36.76 
 
 
339 aa  243  3e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.710265  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0139  dipeptide transporter permease DppB  36.28 
 
 
351 aa  243  3e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0480  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.88 
 
 
334 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00673258  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0840  alkaline phosphatase  38.25 
 
 
336 aa  242  5e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3906  dipeptide transporter permease DppB  36.47 
 
 
339 aa  243  5e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0395  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.91 
 
 
334 aa  242  7e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4911  dipeptide transporter permease DppB  36.28 
 
 
381 aa  241  9e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12510  dipeptide ABC transporter, inner membrane permease component  38.55 
 
 
336 aa  241  9e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0113626  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0391  Nickel-transporting ATPase  36.56 
 
 
334 aa  241  9e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.941274  normal  0.201292 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5350  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  37.46 
 
 
359 aa  241  9e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11531  putative ABC transporter, oligopeptides  42.34 
 
 
340 aa  241  9e-63  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03394  dipeptide transporter  36.28 
 
 
339 aa  241  1e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0169  Alkaline phosphatase  36.28 
 
 
339 aa  241  1e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3377  dipeptide ABC transporter, permease protein  35.01 
 
 
338 aa  241  1e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03345  hypothetical protein  36.28 
 
 
339 aa  241  1e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2921  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.37 
 
 
336 aa  241  1e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2120  dipeptide ABC transporter, permease protein  35.01 
 
 
338 aa  241  1e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.192679  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0172  dipeptide transporter permease DppB  36.28 
 
 
339 aa  241  1e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3862  dipeptide transporter permease DppB  36.28 
 
 
339 aa  241  1e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3988  dipeptide transporter permease DppB  36.28 
 
 
339 aa  241  1e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4035  dipeptide transporter permease DppB  36.28 
 
 
339 aa  241  1e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0185  dipeptide transporter permease DppB  36.47 
 
 
339 aa  241  1e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.446355  normal  0.432086 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3742  dipeptide transporter permease DppB  36.28 
 
 
339 aa  241  1e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0423  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.95 
 
 
334 aa  240  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0103751  normal  0.0395583 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>