More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0562 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_0562  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
322 aa  632  1e-180  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.618484  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3489  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.62 
 
 
340 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5234  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.68 
 
 
323 aa  325  8.000000000000001e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2572  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50 
 
 
340 aa  324  1e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1650  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  51.1 
 
 
323 aa  323  2e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.950445 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0425  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.04 
 
 
324 aa  323  2e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.366309  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1508  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.37 
 
 
323 aa  323  3e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.929546  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3132  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  49.21 
 
 
340 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.214587 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7557  putative dipeptide ABC transporter (permease protein)  50.47 
 
 
323 aa  317  2e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1615  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.08 
 
 
340 aa  310  2.9999999999999997e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00450006  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0746  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48 
 
 
333 aa  302  4.0000000000000003e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4253  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.53 
 
 
336 aa  302  6.000000000000001e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.144815  normal  0.108193 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3220  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.85 
 
 
323 aa  302  6.000000000000001e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.259028  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0670  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.94 
 
 
323 aa  300  2e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.372701  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2762  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.82 
 
 
322 aa  284  1.0000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.3137  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4291  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.44 
 
 
338 aa  264  1e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1978  putative ABC transporter  45.11 
 
 
321 aa  259  6e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.878457  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0131  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  44.04 
 
 
326 aa  258  1e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4763  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.87 
 
 
327 aa  251  1e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0105  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.43 
 
 
326 aa  249  3e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.109225  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2548  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.63 
 
 
328 aa  248  9e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.892452  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2013  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  41.75 
 
 
326 aa  248  1e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7182  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  42.9 
 
 
329 aa  247  2e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4328  putative ABC transporter, permease protein  42.99 
 
 
325 aa  246  4e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5655  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.84 
 
 
328 aa  243  3.9999999999999997e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1808  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.87 
 
 
328 aa  241  1e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5670  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.65 
 
 
325 aa  241  1e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.26218  normal  0.0546823 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3989  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.27 
 
 
306 aa  239  5e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3257  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  41.27 
 
 
306 aa  239  5e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3319  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.37 
 
 
327 aa  238  1e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5137  putative peptide ABC transporter protein, permease protein  42.77 
 
 
339 aa  236  3e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0417349 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1136  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.14 
 
 
309 aa  236  3e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000195869  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2568  ABC transporter permease  42.16 
 
 
328 aa  236  4e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.577987  normal  0.256762 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3276  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.27 
 
 
306 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.819891  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1151  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.37 
 
 
325 aa  235  8e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.15877 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4284  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.74 
 
 
323 aa  234  2.0000000000000002e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.181861  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1040  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  42.12 
 
 
325 aa  231  1e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.314534  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2757  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.49 
 
 
306 aa  231  2e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6675  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.26 
 
 
306 aa  229  4e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.432582  normal  0.593084 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4861  putative ABC transporter, permease protein  43.41 
 
 
328 aa  229  4e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.373975  normal  0.482234 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0141  peptide/opine/nickel ABC transporter inner membrane protein  39.81 
 
 
326 aa  229  5e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.805537 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3451  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.54 
 
 
309 aa  228  1e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2917  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.69 
 
 
325 aa  228  1e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0648374  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0859  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.37 
 
 
333 aa  228  1e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000322853  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0521  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.69 
 
 
321 aa  228  1e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0692  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40 
 
 
321 aa  226  3e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2971  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.09 
 
 
322 aa  226  4e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0636999  normal  0.258787 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1752  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.49 
 
 
306 aa  226  4e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0655426  normal  0.0792402 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3967  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.75 
 
 
333 aa  226  6e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.979958  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2054  peptide ABC transporter permease  39.09 
 
 
336 aa  225  7e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0359637  normal  0.365039 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1564  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  40.78 
 
 
326 aa  225  7e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0386  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.94 
 
 
312 aa  223  3e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3753  Alkaline phosphatase  40.06 
 
 
336 aa  223  4e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.634321 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2913  nickel-transporting ATPase  40.25 
 
 
337 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3081  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  38.98 
 
 
322 aa  222  8e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.957751  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1001  oligopeptide ABC transporter, permease protein  39.17 
 
 
316 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.69 
 
 
321 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0692911 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0823  oligopeptide ABC transporter, permease  39.49 
 
 
316 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.164685  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1620  peptide ABC transporter, permease protein  39.75 
 
 
321 aa  220  1.9999999999999999e-56  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.911317 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0183  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter inner membrane protein  39.75 
 
 
336 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2499  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.67 
 
 
334 aa  220  3e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0750217 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2812  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.19 
 
 
336 aa  220  3e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.532586  normal  0.117752 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0804  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.49 
 
 
316 aa  220  3e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00583871  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3039  nickel-transporting ATPase  40.06 
 
 
336 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.408808 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0736  peptide ABC transporter, permease protein  38.63 
 
 
327 aa  219  3.9999999999999997e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0785  peptide ABC transporter, permease protein  38.63 
 
 
332 aa  219  5e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.334762  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0808  oligopeptide ABC transporter, permease  39.23 
 
 
316 aa  219  5e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.282065  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0139  dipeptide transporter permease DppB  38.63 
 
 
351 aa  219  5e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1223  Nickel-transporting ATPase  37.13 
 
 
339 aa  219  5e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0308435 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4385  oligopeptide ABC transporter, permease protein  38.85 
 
 
316 aa  219  5e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  1.02052e-22 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0997  oligopeptide ABC transporter, permease protein  39.17 
 
 
316 aa  219  6e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.28482e-62 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1444  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.48 
 
 
323 aa  218  8.999999999999998e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0478  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.91 
 
 
321 aa  218  1e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6391  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, inner membrane subunit  39.75 
 
 
336 aa  218  1e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.314486  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3089  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.56 
 
 
336 aa  218  1e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2955  alkaline phosphatase  39.44 
 
 
336 aa  218  1e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4367  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.69 
 
 
313 aa  218  2e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.380096  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0859  oligopeptide ABC transporter permease  39.17 
 
 
316 aa  217  2e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6143  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.85 
 
 
329 aa  217  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.637959  normal  0.0297418 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2849  ABC transporter permease protein  38.24 
 
 
313 aa  217  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.585703  normal  0.643564 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0909  oligopeptide ABC transporter permease protein  39.17 
 
 
316 aa  217  2e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0836804  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0946  oligopeptide ABC transporter, permease protein  38.54 
 
 
316 aa  218  2e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.170303  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0113  nickel-transporting ATPase  37.58 
 
 
336 aa  216  2.9999999999999998e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13220  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  37.46 
 
 
308 aa  216  5e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.444748  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0010  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.54 
 
 
308 aa  216  5e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0221  dipeptide ABC transporter, permease protein  39.13 
 
 
336 aa  215  7e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1766  peptide ABC transporter, permease protein  39.06 
 
 
321 aa  215  8e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.147265  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5642  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  40.59 
 
 
316 aa  215  9.999999999999999e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0251003  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6558  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.54 
 
 
329 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.487916  normal  0.350225 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2430  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.82 
 
 
336 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3044  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.82 
 
 
336 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3063  alkaline phosphatase  38.82 
 
 
336 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.273839 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5350  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  37.78 
 
 
359 aa  214  1.9999999999999998e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0211  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.12 
 
 
308 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.452226  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1409  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.19 
 
 
313 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0709141  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0615  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.44 
 
 
321 aa  213  2.9999999999999995e-54  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.793124  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4562  dipeptide ABC transporter, permease protein  40.13 
 
 
336 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3801  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40 
 
 
314 aa  213  3.9999999999999995e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.207674 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4239  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  39.81 
 
 
336 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0349667  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0270  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.13 
 
 
321 aa  213  4.9999999999999996e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.350596  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>