More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3886 on replicon NC_013744
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013744  Htur_3886  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
339 aa  674    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.431953  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4093  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.88 
 
 
336 aa  316  4e-85  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.105746  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4465  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.4 
 
 
337 aa  308  1.0000000000000001e-82  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0158247  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0049  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.29 
 
 
336 aa  300  2e-80  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.190258  normal  0.544383 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1190  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.54 
 
 
335 aa  289  5.0000000000000004e-77  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4666  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.81 
 
 
332 aa  288  9e-77  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2117  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.6 
 
 
341 aa  285  7e-76  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.88 
 
 
336 aa  274  2.0000000000000002e-72  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.63253  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4451  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.46 
 
 
330 aa  260  3e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.55101  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0896  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.72 
 
 
343 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2744  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.73 
 
 
344 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.480535  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3401  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.06 
 
 
331 aa  196  6e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.621344  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1795  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.53 
 
 
328 aa  194  2e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000162915  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17750  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  34.12 
 
 
336 aa  191  1e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0274978  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2054  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.12 
 
 
336 aa  187  2e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.000423079  normal  0.894594 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0622  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.59 
 
 
365 aa  187  3e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002585  (GlcNAc)2 ABC transporter permease component 1  31.55 
 
 
328 aa  184  2.0000000000000003e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5781  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.02 
 
 
325 aa  184  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.100059 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6685  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.02 
 
 
325 aa  184  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0249193  normal  0.645834 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1657  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  32.53 
 
 
343 aa  184  3e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.104246  normal  0.622808 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03424  hypothetical protein  31.25 
 
 
328 aa  183  4.0000000000000006e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1137  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.99 
 
 
344 aa  182  6e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0958973 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0148  peptide ABC transporter, permease protein  32.14 
 
 
328 aa  182  6e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34920  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  34.91 
 
 
331 aa  181  2e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.949734  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0683  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.87 
 
 
340 aa  180  2.9999999999999997e-44  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0808523 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2577  ABC-type [(GlcNAc)2] transporter, permease protein  31.85 
 
 
328 aa  180  4e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1899  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.24 
 
 
328 aa  180  4e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.227474  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0482  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.39 
 
 
363 aa  179  4.999999999999999e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.182893  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2727  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.44 
 
 
331 aa  179  8e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0930  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.12 
 
 
330 aa  178  1e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.4 
 
 
326 aa  178  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06400  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  32.39 
 
 
326 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.36653  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3010  ABC transporter related  33.23 
 
 
339 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.932121  normal  0.429089 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0733  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.74 
 
 
328 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1179  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.94 
 
 
328 aa  172  5.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00639  ABC transporter permease component  31.2 
 
 
341 aa  171  1e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1274  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.43 
 
 
345 aa  171  2e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000273194 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1399  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.91 
 
 
325 aa  171  2e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.895981  normal  0.8818 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01320  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  32.44 
 
 
328 aa  170  3e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.655147  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001854  putative transmembrane ABC transporter protein  30.9 
 
 
341 aa  169  4e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2074  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.33 
 
 
325 aa  169  5e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.480445  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3797  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.63 
 
 
325 aa  167  2e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2016  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.65 
 
 
344 aa  166  4e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.887108 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2622  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.96 
 
 
326 aa  166  5e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2421  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.14 
 
 
344 aa  166  5.9999999999999996e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00114687  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5700  peptide ABC transporter, permease protein  30.36 
 
 
333 aa  166  6.9999999999999995e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.385239  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3489  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.94 
 
 
340 aa  166  8e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0220  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.91 
 
 
318 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0399  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.33 
 
 
325 aa  165  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0039  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.54 
 
 
329 aa  164  2.0000000000000002e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2154  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.76 
 
 
350 aa  164  2.0000000000000002e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.431982 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1483  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.15 
 
 
326 aa  163  3e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.28032  normal  0.876961 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6187  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.25 
 
 
329 aa  163  5.0000000000000005e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.871135  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0206  oligopeptide ABC transporter, permease  29.91 
 
 
318 aa  162  6e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4519  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.23 
 
 
330 aa  162  6e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.736409  normal  0.962109 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2259  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.82 
 
 
320 aa  162  7e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000183272  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1931  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems, permease component  30.51 
 
 
305 aa  162  8.000000000000001e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0209  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.61 
 
 
318 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2757  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.93 
 
 
306 aa  162  9e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2974  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.23 
 
 
342 aa  162  9e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.552398  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0210  oligopeptide ABC transporter, permease  28.48 
 
 
318 aa  161  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5079  oligopeptide ABC transporter, permease protein  29.61 
 
 
318 aa  162  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.823719  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0232  oligopeptide ABC transporter permease protein  28.48 
 
 
318 aa  161  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2748  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.82 
 
 
358 aa  161  1e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21750  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  30.75 
 
 
362 aa  161  1e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.211245  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0249  oligopeptide ABC transporter, permease protein  28.18 
 
 
318 aa  161  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0083  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.01 
 
 
334 aa  160  2e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2129  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.09 
 
 
344 aa  160  3e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.291354  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2572  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.67 
 
 
340 aa  159  5e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7457  peptide ABC transporter, permease protein  30.86 
 
 
334 aa  159  5e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.48372 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1437  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.86 
 
 
326 aa  159  6e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0267  oligopeptide ABC transporter, permease protein  28.48 
 
 
318 aa  159  6e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2742  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.99 
 
 
344 aa  159  7e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.564581  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2396  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.53 
 
 
325 aa  159  8e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4097  dipeptide transporter permease DppB  30.92 
 
 
339 aa  158  1e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.710265  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1869  ABC-type transport system protein  31.72 
 
 
324 aa  158  1e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0489  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.84 
 
 
336 aa  158  1e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1413  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.05 
 
 
332 aa  158  1e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.739242 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0546  peptide ABC transporter, protein inner membrane binding component  31.63 
 
 
324 aa  158  1e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000873967  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3906  dipeptide transporter permease DppB  30.77 
 
 
339 aa  159  1e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4562  dipeptide ABC transporter, permease protein  29.65 
 
 
336 aa  157  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1449  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.06 
 
 
350 aa  157  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2322  binding-protein-dependent transporter inner membrane protein  29.7 
 
 
348 aa  157  2e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0219  oligopeptide ABC transporter permease  29.15 
 
 
307 aa  157  3e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0242  oligopeptide ABC transporter, permease protein  29.15 
 
 
307 aa  157  3e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4239  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  29.65 
 
 
336 aa  156  4e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0349667  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2992  ABC transporter, inner membrane subunit  30.06 
 
 
350 aa  156  4e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0712485  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0246  oligopeptide ABC transporter, permease protein  29.78 
 
 
307 aa  156  4e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0542782  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1214  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.34 
 
 
344 aa  156  5.0000000000000005e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3905  dipeptide transporter permease DppB  30.57 
 
 
339 aa  156  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3949  dipeptide transporter permease DppB  30.57 
 
 
339 aa  156  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.788898  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4009  dipeptide transporter permease DppB  30.57 
 
 
339 aa  156  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3841  dipeptide transporter permease DppB  30.57 
 
 
339 aa  156  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0867  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.25 
 
 
308 aa  156  6e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3827  dipeptide transporter permease DppB  30.57 
 
 
339 aa  156  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0871  inner membrane ABC transporter permease protein  30.14 
 
 
342 aa  155  7e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3132  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  29.59 
 
 
340 aa  155  7e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.214587 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4074  dipeptide transporter permease DppB  30.06 
 
 
339 aa  155  7e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0089  dipeptide transporter permease DppB  30.06 
 
 
339 aa  155  7e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.297234  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0396  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.95 
 
 
354 aa  155  7e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>