More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4519 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_4519  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
330 aa  656    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.736409  normal  0.962109 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1657  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  58.1 
 
 
343 aa  378  1e-104  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.104246  normal  0.622808 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5700  peptide ABC transporter, permease protein  57.67 
 
 
333 aa  366  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.385239  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0896  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.61 
 
 
343 aa  232  6e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4093  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.07 
 
 
336 aa  220  1.9999999999999999e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.105746  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0049  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.28 
 
 
336 aa  217  2e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.190258  normal  0.544383 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4465  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.42 
 
 
337 aa  215  5.9999999999999996e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0158247  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2622  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.13 
 
 
326 aa  210  3e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0039  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.12 
 
 
329 aa  210  3e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6187  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.65 
 
 
329 aa  209  5e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.871135  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01320  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  37.42 
 
 
328 aa  206  5e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.655147  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0930  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.56 
 
 
330 aa  204  1e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0695  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.22 
 
 
335 aa  204  1e-51  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.000367904 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0622  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.19 
 
 
365 aa  204  1e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2744  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.33 
 
 
344 aa  202  5e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.480535  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.38 
 
 
336 aa  202  6e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.63253  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0172  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.42 
 
 
326 aa  200  3e-50  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.774382  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3401  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.94 
 
 
331 aa  198  1.0000000000000001e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.621344  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1483  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.2 
 
 
326 aa  197  2.0000000000000003e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.28032  normal  0.876961 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1399  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.97 
 
 
325 aa  197  2.0000000000000003e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.895981  normal  0.8818 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4451  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.38 
 
 
330 aa  196  5.000000000000001e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.55101  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2514  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.05 
 
 
323 aa  195  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0635033  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2727  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.56 
 
 
331 aa  195  1e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4666  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.94 
 
 
332 aa  194  2e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1795  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.64 
 
 
328 aa  192  4e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000162915  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5781  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.84 
 
 
325 aa  192  5e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.100059 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6685  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.84 
 
 
325 aa  191  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0249193  normal  0.645834 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1680  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.9 
 
 
326 aa  191  2e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.473692  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1137  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.05 
 
 
344 aa  190  2.9999999999999997e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0958973 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0481  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.65 
 
 
324 aa  190  2.9999999999999997e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.399045  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06400  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  35.58 
 
 
326 aa  189  5e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.36653  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0482  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.42 
 
 
363 aa  188  1e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.182893  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34920  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  35.22 
 
 
331 aa  187  2e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.949734  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20170  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  35.89 
 
 
325 aa  184  2.0000000000000003e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0546  peptide ABC transporter, protein inner membrane binding component  35.05 
 
 
324 aa  177  2e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000873967  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1190  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.75 
 
 
335 aa  176  4e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2502  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.88 
 
 
333 aa  176  7e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2396  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.17 
 
 
325 aa  176  7e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1899  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.33 
 
 
328 aa  175  8e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.227474  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3950  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.23 
 
 
334 aa  175  9e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7457  peptide ABC transporter, permease protein  35 
 
 
334 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.48372 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1179  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.68 
 
 
328 aa  173  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3886  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.23 
 
 
339 aa  172  5e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.431953  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2074  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.36 
 
 
325 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.480445  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4291  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.85 
 
 
338 aa  172  5.999999999999999e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.19 
 
 
326 aa  172  7.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03424  hypothetical protein  32.34 
 
 
328 aa  170  3e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0683  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.52 
 
 
340 aa  169  6e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0808523 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0148  peptide ABC transporter, permease protein  32.73 
 
 
328 aa  169  8e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002585  (GlcNAc)2 ABC transporter permease component 1  32.43 
 
 
328 aa  168  1e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4763  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.13 
 
 
327 aa  167  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0161  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.16 
 
 
336 aa  166  4e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.040531  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2577  ABC-type [(GlcNAc)2] transporter, permease protein  31.64 
 
 
328 aa  166  5e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0394  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, permease protein  36.27 
 
 
320 aa  166  6.9999999999999995e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2033  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.74 
 
 
324 aa  166  6.9999999999999995e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0145  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.12 
 
 
450 aa  164  2.0000000000000002e-39  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.570332  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3797  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
325 aa  164  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3010  ABC transporter related  30.24 
 
 
339 aa  163  4.0000000000000004e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.932121  normal  0.429089 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0399  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.62 
 
 
325 aa  162  6e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1677  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.65 
 
 
347 aa  162  6e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.281902  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1766  peptide ABC transporter, permease protein  30.94 
 
 
321 aa  162  9e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.147265  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1614  oligopeptide ABC transporter, permease protein  34.48 
 
 
304 aa  160  3e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.69 
 
 
321 aa  159  5e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0692911 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0215  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.23 
 
 
343 aa  158  9e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000546262  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0527  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.12 
 
 
329 aa  158  9e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2748  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.35 
 
 
358 aa  158  1e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0893  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.08 
 
 
338 aa  158  1e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0915  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.08 
 
 
338 aa  158  1e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0105  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.39 
 
 
326 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.109225  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0920  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.03 
 
 
343 aa  157  2e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.416644 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6805  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.72 
 
 
334 aa  157  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.406574  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1620  peptide ABC transporter, permease protein  29.06 
 
 
321 aa  157  3e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.911317 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2054  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.46 
 
 
336 aa  157  3e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.000423079  normal  0.894594 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17750  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  31.29 
 
 
336 aa  157  3e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0274978  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2117  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.45 
 
 
341 aa  156  4e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1214  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.03 
 
 
344 aa  156  4e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5670  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.76 
 
 
325 aa  156  4e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.26218  normal  0.0546823 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0521  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.06 
 
 
321 aa  155  6e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0408  peptide ABC transporter, permease protein  32.81 
 
 
319 aa  155  7e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.599742  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5892  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.72 
 
 
334 aa  155  7e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1869  ABC-type transport system protein  33.03 
 
 
324 aa  155  7e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0351  peptide ABC transporter, permease protein  32.81 
 
 
319 aa  155  1e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0131  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.55 
 
 
326 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2014  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
325 aa  154  2e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.169122  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0237  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.45 
 
 
335 aa  154  2.9999999999999998e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0397671  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2572  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.59 
 
 
340 aa  153  4e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2259  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.01 
 
 
320 aa  153  4e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000183272  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3168  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.7 
 
 
317 aa  152  7e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3568  oligopeptide ABC transporter, permease  34.06 
 
 
327 aa  152  8e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0709186 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1691  alkaline phosphatase  33.44 
 
 
336 aa  152  8e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.218764 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0692  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.06 
 
 
321 aa  151  2e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0779  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.73 
 
 
339 aa  151  2e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0777268  normal  0.809759 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2593  oligopeptide ABC transporter, permease protein  32.93 
 
 
343 aa  150  3e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1269  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  31.19 
 
 
324 aa  150  4e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1413  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.09 
 
 
331 aa  149  4e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2985  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.49 
 
 
313 aa  149  5e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.348462  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1722  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.42 
 
 
333 aa  149  5e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.181777  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3967  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.9 
 
 
333 aa  149  6e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.979958  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1312  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.44 
 
 
318 aa  149  6e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.823001  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3995  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.7 
 
 
325 aa  149  8e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>