More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4093 on replicon NC_013744
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013744  Htur_4093  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
336 aa  666    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.105746  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0049  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.93 
 
 
336 aa  357  1.9999999999999998e-97  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.190258  normal  0.544383 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4666  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.03 
 
 
332 aa  355  5.999999999999999e-97  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4465  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.93 
 
 
337 aa  353  2.9999999999999997e-96  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0158247  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1190  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.52 
 
 
335 aa  323  3e-87  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4451  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.39 
 
 
330 aa  321  9.000000000000001e-87  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.55101  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3886  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.88 
 
 
339 aa  316  4e-85  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.431953  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.72 
 
 
336 aa  313  1.9999999999999998e-84  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.63253  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2117  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.71 
 
 
341 aa  276  5e-73  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0896  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.94 
 
 
343 aa  247  2e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1795  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.54 
 
 
328 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000162915  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0930  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.73 
 
 
330 aa  233  3e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34920  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  37.84 
 
 
331 aa  228  1e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.949734  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1137  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.5 
 
 
344 aa  228  1e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0958973 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1399  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.81 
 
 
325 aa  224  2e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.895981  normal  0.8818 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01320  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  36.36 
 
 
328 aa  223  3e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.655147  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1483  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.65 
 
 
326 aa  219  6e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.28032  normal  0.876961 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0039  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.55 
 
 
329 aa  218  1e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0172  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.12 
 
 
326 aa  217  2e-55  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.774382  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3401  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.73 
 
 
331 aa  215  8e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.621344  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06400  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  39.61 
 
 
326 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.36653  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0622  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.83 
 
 
365 aa  214  1.9999999999999998e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2514  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.89 
 
 
323 aa  213  2.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0635033  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6187  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.65 
 
 
329 aa  213  4.9999999999999996e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.871135  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1179  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.24 
 
 
328 aa  212  5.999999999999999e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6685  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.12 
 
 
325 aa  212  7e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0249193  normal  0.645834 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5781  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.12 
 
 
325 aa  211  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.100059 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0695  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.39 
 
 
335 aa  210  3e-53  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.000367904 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0399  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.17 
 
 
325 aa  208  9e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0915  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.82 
 
 
338 aa  208  1e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0148  peptide ABC transporter, permease protein  37.24 
 
 
328 aa  208  1e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4519  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.07 
 
 
330 aa  207  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.736409  normal  0.962109 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0893  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.82 
 
 
338 aa  207  2e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2622  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.13 
 
 
326 aa  207  3e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2727  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.81 
 
 
331 aa  206  6e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1657  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  36.76 
 
 
343 aa  205  1e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.104246  normal  0.622808 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20170  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  36.56 
 
 
325 aa  203  3e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0481  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.98 
 
 
324 aa  203  4e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.399045  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3797  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.81 
 
 
325 aa  203  4e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17750  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  36.62 
 
 
336 aa  202  5e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0274978  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2577  ABC-type [(GlcNAc)2] transporter, permease protein  36.98 
 
 
328 aa  199  3.9999999999999996e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.67 
 
 
326 aa  199  5e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1680  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.36 
 
 
326 aa  199  5e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.473692  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0683  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.24 
 
 
340 aa  199  5e-50  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0808523 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0489  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.5 
 
 
336 aa  199  7e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03424  hypothetical protein  35.44 
 
 
328 aa  198  9e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5700  peptide ABC transporter, permease protein  35.83 
 
 
333 aa  198  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.385239  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0482  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.62 
 
 
363 aa  196  4.0000000000000005e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.182893  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7457  peptide ABC transporter, permease protein  34.04 
 
 
334 aa  195  8.000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.48372 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1899  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.44 
 
 
328 aa  194  1e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.227474  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2744  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.36 
 
 
344 aa  193  3e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.480535  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002585  (GlcNAc)2 ABC transporter permease component 1  34.53 
 
 
328 aa  193  3e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1596  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.89 
 
 
329 aa  192  7e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.349408  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1546  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.89 
 
 
329 aa  192  7e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.201303  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2054  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.15 
 
 
336 aa  191  2e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.000423079  normal  0.894594 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0161  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.15 
 
 
336 aa  190  2.9999999999999997e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.040531  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1437  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.17 
 
 
326 aa  190  4e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0329  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.27 
 
 
326 aa  189  5.999999999999999e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3010  ABC transporter related  34.05 
 
 
339 aa  187  3e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.932121  normal  0.429089 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0215  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.91 
 
 
343 aa  186  3e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000546262  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2074  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.13 
 
 
325 aa  186  6e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.480445  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0871  inner membrane ABC transporter permease protein  32.36 
 
 
342 aa  184  2.0000000000000003e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58440  ABC transporter permease  33.64 
 
 
336 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.514083  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00639  ABC transporter permease component  31.79 
 
 
341 aa  181  1e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001854  putative transmembrane ABC transporter protein  31.21 
 
 
341 aa  178  1e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5234  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.79 
 
 
323 aa  178  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2396  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.54 
 
 
325 aa  178  2e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1269  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  32.21 
 
 
324 aa  177  2e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5117  ABC transporter permease  32.71 
 
 
336 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1670  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
335 aa  176  4e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.851486 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0486  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
335 aa  176  4e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0546  peptide ABC transporter, protein inner membrane binding component  34.97 
 
 
324 aa  176  6e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000873967  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0425  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.17 
 
 
324 aa  176  7e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.366309  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2389  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.82 
 
 
329 aa  175  8e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0394  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, permease protein  32.21 
 
 
320 aa  175  9e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5892  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.52 
 
 
334 aa  175  9e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1677  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.04 
 
 
347 aa  175  9e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.281902  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1620  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.37 
 
 
334 aa  175  9e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000109875  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6805  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.13 
 
 
334 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.406574  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0881  alkaline phosphatase  33.65 
 
 
336 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0920  alkaline phosphatase  33.65 
 
 
336 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.745476  normal  0.672413 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1722  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.71 
 
 
333 aa  175  9.999999999999999e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.181777  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2378  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.73 
 
 
327 aa  174  1.9999999999999998e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0410349  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12510  dipeptide ABC transporter, inner membrane permease component  34.32 
 
 
336 aa  174  1.9999999999999998e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0113626  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4297  alkaline phosphatase  33.65 
 
 
336 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.259448  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2083  ABC transporter, permease  30.3 
 
 
354 aa  174  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.899813  normal  0.534674 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0924  alkaline phosphatase  33.33 
 
 
336 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1493  peptide ABC transporter, permease protein  31.68 
 
 
324 aa  172  5e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1283  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.68 
 
 
324 aa  172  5e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3995  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.37 
 
 
325 aa  172  5.999999999999999e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0812  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.08 
 
 
336 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.153061  normal  0.318777 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0842  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.29 
 
 
478 aa  172  5.999999999999999e-42  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.420686  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4239  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.45 
 
 
336 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0349667  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0113  nickel-transporting ATPase  32.63 
 
 
336 aa  172  7.999999999999999e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4562  dipeptide ABC transporter, permease protein  31.16 
 
 
336 aa  171  1e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0733  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.84 
 
 
328 aa  171  2e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4291  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.4 
 
 
338 aa  171  2e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0263  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.83 
 
 
331 aa  171  2e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.594312  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2812  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.58 
 
 
336 aa  170  3e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.532586  normal  0.117752 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2050  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.83 
 
 
325 aa  170  3e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>