More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I0871 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011312  VSAL_I0871  inner membrane ABC transporter permease protein  100 
 
 
342 aa  691    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00639  ABC transporter permease component  78.72 
 
 
341 aa  566  1e-160  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001854  putative transmembrane ABC transporter protein  78.72 
 
 
341 aa  565  1e-160  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0944  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.84 
 
 
338 aa  379  1e-104  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000124721  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2016  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.27 
 
 
344 aa  301  1e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.887108 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2421  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.23 
 
 
344 aa  293  4e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00114687  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1236  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.14 
 
 
354 aa  289  4e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2974  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.18 
 
 
342 aa  281  1e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.552398  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0396  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.17 
 
 
354 aa  281  1e-74  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2742  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.48 
 
 
344 aa  280  3e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.564581  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1855  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.59 
 
 
462 aa  277  2e-73  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.685434  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1103  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.57 
 
 
358 aa  274  1.0000000000000001e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2128  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  41.5 
 
 
350 aa  274  1.0000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.385957  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2992  ABC transporter, inner membrane subunit  40.29 
 
 
350 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0712485  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1174  transmembrane ABC transporter protein  41.95 
 
 
351 aa  273  3e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0000600892  normal  0.310327 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1109  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.5 
 
 
350 aa  272  7e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.651204 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2154  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.21 
 
 
350 aa  272  7e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.431982 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1015  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.21 
 
 
350 aa  271  1e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.939942  decreased coverage  0.0094028 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2145  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.99 
 
 
349 aa  271  2e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1449  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.71 
 
 
350 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2129  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40 
 
 
344 aa  270  4e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.291354  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1274  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.58 
 
 
345 aa  269  5.9999999999999995e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000273194 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1724  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40 
 
 
350 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.106153  normal  0.226487 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1963  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.82 
 
 
347 aa  266  4e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6369  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.42 
 
 
350 aa  266  4e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.673623  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2093  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.52 
 
 
347 aa  266  4e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1709  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.42 
 
 
350 aa  266  4e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2080  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.23 
 
 
347 aa  266  5e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.338378  normal  0.937484 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1979  ABC transporter, permease protein  41.11 
 
 
370 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00000000494739  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6016  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.23 
 
 
347 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.658809  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2061  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.23 
 
 
347 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.251429  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5000  ABC transporter, inner membrane subunit  39.71 
 
 
350 aa  265  7e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.47497  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1215  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.82 
 
 
347 aa  265  7e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.54297 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5370  ABC transporter, inner membrane subunit  39.94 
 
 
347 aa  265  1e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.190291  normal  0.861053 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1381  ABC transporter, permease protein  41.11 
 
 
346 aa  263  2e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.238328  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2546  ABC transporter, permease protein  41.11 
 
 
346 aa  263  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00426967  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2492  ABC transporter, permease protein  41.11 
 
 
346 aa  263  2e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0860653  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2108  ABC transporter, permease protein  41.11 
 
 
346 aa  263  2e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0366053  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3205  ABC transporter, permease protein  41.11 
 
 
346 aa  263  2e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000674085  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2634  putative ABC transport system, membrane protein  41.4 
 
 
455 aa  263  3e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0725782  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3813  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.24 
 
 
345 aa  261  8.999999999999999e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0689271 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1382  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.23 
 
 
346 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00200208  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2500  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.23 
 
 
345 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0191785  normal  0.0206964 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1947  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.27 
 
 
354 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.162998  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1637  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  39.36 
 
 
345 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.648202  normal  0.318212 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29660  oligopeptide ABC transporter, inner membrane permease component  39.04 
 
 
361 aa  253  5.000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.124853  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3253  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.37 
 
 
347 aa  252  6e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1915  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.06 
 
 
364 aa  252  8.000000000000001e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1811  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.37 
 
 
345 aa  251  1e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0525112  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1917  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.37 
 
 
345 aa  251  1e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.14249  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0290  ABC transporter substrate binding inner membrane protein  38.07 
 
 
358 aa  251  1e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1644  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.06 
 
 
365 aa  250  3e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.639895  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1542  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.68 
 
 
352 aa  249  4e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.74003  normal  0.452756 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2903  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  38.18 
 
 
354 aa  247  2e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00817715  normal  0.390731 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3742  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  39.89 
 
 
354 aa  247  2e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.234646  normal  0.979022 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2647  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.19 
 
 
352 aa  247  2e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.783246  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0534  putative peptide ABC transporter, permease protein  39.61 
 
 
360 aa  247  2e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41140  ABC transporter permease  38.2 
 
 
360 aa  247  2e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3077  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.9 
 
 
352 aa  246  3e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.837168 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3487  ABC transporter permease  38.2 
 
 
360 aa  246  3e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3473  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.85 
 
 
357 aa  246  4e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4148  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.29 
 
 
357 aa  245  6.999999999999999e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0120356  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2714  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.68 
 
 
352 aa  245  6.999999999999999e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.124868 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1717  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.57 
 
 
357 aa  245  8e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.552339  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3247  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.67 
 
 
364 aa  245  9e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.559652  normal  0.0140397 
 
 
-
 
NC_004310  BR0008  ABC transporter, permease protein  38.78 
 
 
365 aa  245  9.999999999999999e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3030  peptide ABC transporter, permease protein  38.18 
 
 
354 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.175953  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2059  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.07 
 
 
357 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.270311  normal  0.8272 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3720  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.57 
 
 
357 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00285143  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1410  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.64 
 
 
355 aa  243  3e-63  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.486837 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0008  ABC transporter, permease protein  38.5 
 
 
365 aa  243  3e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00620347  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2180  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  36.72 
 
 
357 aa  242  6e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.776832 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2358  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.16 
 
 
362 aa  242  7e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0883439 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0703  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  38.16 
 
 
362 aa  242  7e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1434  peptide ABC transporter, permease protein  37.13 
 
 
326 aa  241  1e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.393954  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1757  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  36.08 
 
 
357 aa  241  1e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.443887  normal  0.0467925 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3074  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  39.09 
 
 
353 aa  241  1e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3718  ABC transporter, permease protein  36.08 
 
 
357 aa  240  2e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37870  putative peptide ABC transporter, permease protein  38.14 
 
 
357 aa  241  2e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000955556  normal  0.178623 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1539  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.2 
 
 
361 aa  240  2.9999999999999997e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2433  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.23 
 
 
365 aa  239  4e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2271  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.33 
 
 
363 aa  239  4e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2712  ABC transporter, permease protein  36.46 
 
 
366 aa  239  5e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2787  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.46 
 
 
366 aa  239  5e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.399987  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1496  ABC transporter permease  36.46 
 
 
366 aa  239  5e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0013  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.5 
 
 
365 aa  239  5e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0654461  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3915  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.27 
 
 
363 aa  238  9e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3641  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.69 
 
 
368 aa  238  1e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0421438 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02108  predicted oligopeptide transporter subunit  37.4 
 
 
364 aa  237  2e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.123294  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1479  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.4 
 
 
364 aa  237  2e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.210696  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2316  ABC transporter, permease protein  37.4 
 
 
364 aa  237  2e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2568  inner membrane ABC transporter permease YejB  38.23 
 
 
364 aa  237  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0013511 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2327  ABC transporter, permease protein  37.4 
 
 
364 aa  237  2e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0047912 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2457  inner membrane ABC transporter permease YejB  38.23 
 
 
364 aa  237  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0971989  normal  0.973927 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0179  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.61 
 
 
364 aa  237  2e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0100071  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3316  ABC transporter, permease protein  37.4 
 
 
364 aa  237  2e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.655724  normal  0.226821 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2411  inner membrane ABC transporter permease protein YejB  38.23 
 
 
364 aa  237  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.026734 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2476  ABC transporter, permease protein  37.4 
 
 
364 aa  237  2e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2366  inner membrane ABC transporter permease protein YejB  38.23 
 
 
364 aa  237  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0667635  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3365  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.03 
 
 
360 aa  237  2e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>