More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0944 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_0944  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
338 aa  680    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000124721  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0871  inner membrane ABC transporter permease protein  54.84 
 
 
342 aa  383  1e-105  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00639  ABC transporter permease component  54.97 
 
 
341 aa  382  1e-105  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001854  putative transmembrane ABC transporter protein  54.57 
 
 
341 aa  381  1e-104  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2154  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.4 
 
 
350 aa  300  2e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.431982 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1449  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.22 
 
 
350 aa  293  3e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2016  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.23 
 
 
344 aa  291  7e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.887108 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2992  ABC transporter, inner membrane subunit  44.22 
 
 
350 aa  292  7e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0712485  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6369  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.64 
 
 
350 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.673623  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1709  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.64 
 
 
350 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1724  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.06 
 
 
350 aa  290  4e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.106153  normal  0.226487 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0396  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.29 
 
 
354 aa  288  8e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1855  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.2 
 
 
462 aa  287  1e-76  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.685434  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5000  ABC transporter, inner membrane subunit  43.93 
 
 
350 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.47497  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2421  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.07 
 
 
344 aa  283  3.0000000000000004e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00114687  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2974  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.57 
 
 
342 aa  282  7.000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.552398  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1236  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.66 
 
 
354 aa  281  1e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2742  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.21 
 
 
344 aa  280  3e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.564581  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1274  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.86 
 
 
345 aa  275  7e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000273194 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2129  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.44 
 
 
344 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.291354  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2059  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.85 
 
 
357 aa  267  2e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.270311  normal  0.8272 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3473  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.54 
 
 
357 aa  265  7e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4148  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.25 
 
 
357 aa  265  1e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0120356  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3487  ABC transporter permease  40.62 
 
 
360 aa  264  1e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1757  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  41.29 
 
 
357 aa  265  1e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.443887  normal  0.0467925 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1963  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.15 
 
 
347 aa  265  1e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1542  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.67 
 
 
352 aa  264  1e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.74003  normal  0.452756 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2093  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.15 
 
 
347 aa  264  1e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41140  ABC transporter permease  40.62 
 
 
360 aa  264  1e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3718  ABC transporter, permease protein  41.29 
 
 
357 aa  264  2e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1103  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.24 
 
 
358 aa  264  2e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1717  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.25 
 
 
357 aa  264  2e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.552339  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1215  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.15 
 
 
347 aa  263  3e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.54297 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1637  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  43.4 
 
 
345 aa  263  3e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.648202  normal  0.318212 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3720  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.97 
 
 
357 aa  263  4e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00285143  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2080  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.86 
 
 
347 aa  262  6e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.338378  normal  0.937484 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6016  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.86 
 
 
347 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.658809  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2061  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.86 
 
 
347 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.251429  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2500  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.7 
 
 
345 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0191785  normal  0.0206964 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2128  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  43.42 
 
 
350 aa  261  1e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.385957  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29660  oligopeptide ABC transporter, inner membrane permease component  41.46 
 
 
361 aa  261  2e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.124853  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5370  ABC transporter, inner membrane subunit  42.57 
 
 
347 aa  260  2e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.190291  normal  0.861053 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1979  ABC transporter, permease protein  43.6 
 
 
370 aa  259  3e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00000000494739  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3727  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40 
 
 
369 aa  259  6e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1382  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.44 
 
 
346 aa  258  1e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00200208  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2145  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.52 
 
 
349 aa  258  1e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1174  transmembrane ABC transporter protein  44.03 
 
 
351 aa  257  2e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0000600892  normal  0.310327 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1917  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.32 
 
 
345 aa  257  2e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.14249  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2546  ABC transporter, permease protein  43.02 
 
 
346 aa  256  4e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00426967  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3813  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.61 
 
 
345 aa  256  4e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0689271 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2180  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  40.56 
 
 
357 aa  256  5e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.776832 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3533  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.73 
 
 
369 aa  256  5e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0507851  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2492  ABC transporter, permease protein  42.57 
 
 
346 aa  256  6e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0860653  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1381  ABC transporter, permease protein  42.57 
 
 
346 aa  256  6e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.238328  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1772  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.45 
 
 
369 aa  256  6e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.02836 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3205  ABC transporter, permease protein  42.57 
 
 
346 aa  256  6e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000674085  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2108  ABC transporter, permease protein  42.57 
 
 
346 aa  256  6e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0366053  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2634  putative ABC transport system, membrane protein  43.02 
 
 
455 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0725782  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1109  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.3 
 
 
350 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.651204 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1015  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.02 
 
 
350 aa  253  3e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.939942  decreased coverage  0.0094028 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0290  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  38.9 
 
 
369 aa  253  3e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3915  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39 
 
 
363 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4212  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.18 
 
 
369 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.477185  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1811  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.32 
 
 
345 aa  252  6e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0525112  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0380  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.9 
 
 
369 aa  251  1e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.530667  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3359  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.16 
 
 
363 aa  251  1e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.710892  normal  0.120793 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1614  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.67 
 
 
366 aa  250  2e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.26731 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0179  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.78 
 
 
364 aa  251  2e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0100071  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2271  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.11 
 
 
363 aa  250  2e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3365  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.89 
 
 
360 aa  249  3e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3641  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.01 
 
 
368 aa  249  6e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0421438 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7053  oligopeptide ABC transporter membrane protein  38.8 
 
 
370 aa  249  6e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.295774  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1947  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.06 
 
 
354 aa  249  6e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.162998  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0389  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.77 
 
 
365 aa  248  7e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0428619  normal  0.991349 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0344  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.77 
 
 
365 aa  248  7e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1410  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.38 
 
 
355 aa  248  8e-65  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.486837 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0516  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.67 
 
 
367 aa  248  8e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.968567  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2050  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.87 
 
 
325 aa  248  1e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0423  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.5 
 
 
365 aa  248  1e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2647  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.51 
 
 
352 aa  247  2e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.783246  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2033  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.23 
 
 
324 aa  247  2e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4082  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.78 
 
 
366 aa  247  2e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3077  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.23 
 
 
352 aa  247  3e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.837168 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2634  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.69 
 
 
371 aa  246  3e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.177277  normal  0.471787 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1235  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  37.98 
 
 
333 aa  246  4e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.391976  normal  0.26803 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2366  inner membrane ABC transporter permease protein YejB  40.33 
 
 
364 aa  245  6e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0667635  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2411  inner membrane ABC transporter permease protein YejB  40.33 
 
 
364 aa  245  6e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.026734 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2457  inner membrane ABC transporter permease YejB  40.33 
 
 
364 aa  245  6e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0971989  normal  0.973927 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2714  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.23 
 
 
352 aa  245  6.999999999999999e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.124868 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2568  inner membrane ABC transporter permease YejB  40.33 
 
 
364 aa  245  6.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0013511 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1434  peptide ABC transporter, permease protein  39.47 
 
 
326 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.393954  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2643  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.28 
 
 
326 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3253  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.31 
 
 
347 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2712  ABC transporter, permease protein  38.02 
 
 
366 aa  244  1.9999999999999999e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0449  putative peptide transport system permease protein  38.36 
 
 
373 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2787  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.02 
 
 
366 aa  244  1.9999999999999999e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.399987  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1496  ABC transporter permease  38.02 
 
 
366 aa  244  1.9999999999999999e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1539  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.61 
 
 
361 aa  244  1.9999999999999999e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2454  inner membrane ABC transporter permease YejB  40.06 
 
 
364 aa  243  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000645449 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1591  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.98 
 
 
326 aa  241  9e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.75386 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>