More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0215 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_0215  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
343 aa  679    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000546262  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0915  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  64.86 
 
 
338 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0893  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  64.56 
 
 
338 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17750  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  44.07 
 
 
336 aa  302  6.000000000000001e-81  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0274978  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0489  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.54 
 
 
336 aa  298  8e-80  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1596  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.56 
 
 
329 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.349408  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1546  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.56 
 
 
329 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.201303  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0263  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.6 
 
 
331 aa  284  2.0000000000000002e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.594312  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1554  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.24 
 
 
329 aa  282  7.000000000000001e-75  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.136155  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3656  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.05 
 
 
331 aa  270  2.9999999999999997e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0911  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems, permease components  41.14 
 
 
331 aa  264  2e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.970668  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1677  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.51 
 
 
347 aa  246  4e-64  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.281902  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0039  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.67 
 
 
329 aa  243  3.9999999999999997e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0161  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.03 
 
 
336 aa  239  2.9999999999999997e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.040531  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1483  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.18 
 
 
326 aa  238  9e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.28032  normal  0.876961 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01320  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  35.19 
 
 
328 aa  236  3e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.655147  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2622  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.06 
 
 
326 aa  236  4e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0172  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.8 
 
 
326 aa  233  5e-60  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.774382  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34920  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  36.25 
 
 
331 aa  232  8.000000000000001e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.949734  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2074  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.58 
 
 
325 aa  231  1e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.480445  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06400  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  39.37 
 
 
326 aa  230  3e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.36653  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0399  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.2 
 
 
325 aa  229  4e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2727  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.72 
 
 
331 aa  226  4e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3797  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.89 
 
 
325 aa  225  7e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0930  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.09 
 
 
330 aa  224  2e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1899  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.08 
 
 
328 aa  224  2e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.227474  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0481  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.76 
 
 
324 aa  221  9.999999999999999e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.399045  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3401  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.31 
 
 
331 aa  217  2e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.621344  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2514  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.18 
 
 
323 aa  217  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0635033  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2744  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.39 
 
 
344 aa  217  2e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.480535  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03424  hypothetical protein  38.55 
 
 
328 aa  217  2e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002585  (GlcNAc)2 ABC transporter permease component 1  38.25 
 
 
328 aa  216  4e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20170  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  37.16 
 
 
325 aa  215  8e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2396  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.27 
 
 
325 aa  214  1.9999999999999998e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6187  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.76 
 
 
329 aa  214  1.9999999999999998e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.871135  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0237  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.16 
 
 
335 aa  213  2.9999999999999995e-54  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0397671  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2054  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.98 
 
 
336 aa  213  4.9999999999999996e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.000423079  normal  0.894594 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7457  peptide ABC transporter, permease protein  34.95 
 
 
334 aa  212  7e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.48372 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2577  ABC-type [(GlcNAc)2] transporter, permease protein  38.53 
 
 
328 aa  210  3e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0148  peptide ABC transporter, permease protein  37.05 
 
 
328 aa  209  5e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1399  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.13 
 
 
325 aa  209  5e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.895981  normal  0.8818 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0630  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.14 
 
 
334 aa  209  8e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.403532  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4465  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.12 
 
 
337 aa  208  1e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0158247  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1680  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.38 
 
 
326 aa  206  4e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.473692  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1722  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.59 
 
 
333 aa  206  5e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.181777  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3950  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.63 
 
 
334 aa  205  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6685  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.26 
 
 
325 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0249193  normal  0.645834 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5892  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.93 
 
 
334 aa  200  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0486  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.78 
 
 
335 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3010  ABC transporter related  33.83 
 
 
339 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.932121  normal  0.429089 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5781  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.26 
 
 
325 aa  197  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.100059 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1795  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.43 
 
 
328 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000162915  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6805  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
334 aa  196  7e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.406574  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0905  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.21 
 
 
334 aa  194  2e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4666  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.43 
 
 
332 aa  193  3e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2748  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.43 
 
 
358 aa  193  3e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0852  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.89 
 
 
335 aa  192  5e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.707865  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0049  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.94 
 
 
336 aa  192  6e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.190258  normal  0.544383 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0875  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.78 
 
 
335 aa  191  1e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.82979  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21750  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  34.72 
 
 
362 aa  190  4e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.211245  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4093  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.91 
 
 
336 aa  186  3e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.105746  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2502  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.34 
 
 
333 aa  186  6e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0896  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.54 
 
 
343 aa  186  7e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0622  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.55 
 
 
365 aa  186  7e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0527  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.33 
 
 
329 aa  184  1.0000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0083  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.93 
 
 
334 aa  184  3e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.74 
 
 
326 aa  181  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1620  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.13 
 
 
334 aa  178  1e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000109875  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1179  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.73 
 
 
328 aa  172  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1190  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.76 
 
 
335 aa  172  1e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0859  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.69 
 
 
339 aa  171  2e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0546  peptide ABC transporter, protein inner membrane binding component  33.54 
 
 
324 aa  170  4e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000873967  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0329  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.91 
 
 
326 aa  169  6e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2389  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.03 
 
 
329 aa  168  1e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1657  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  30.53 
 
 
343 aa  166  4e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.104246  normal  0.622808 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1137  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.64 
 
 
344 aa  166  5.9999999999999996e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0958973 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0800  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.01 
 
 
322 aa  163  4.0000000000000004e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.358314  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3568  oligopeptide ABC transporter, permease  32.4 
 
 
327 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0709186 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.26 
 
 
336 aa  162  7e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.63253  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4538  peptide ABC transporter, permease protein  30.79 
 
 
315 aa  162  1e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0210  oligopeptide ABC transporter, permease  34.25 
 
 
318 aa  160  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19900  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  29.27 
 
 
348 aa  161  2e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00317245  hitchhiker  0.000399681 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0232  oligopeptide ABC transporter permease protein  34.25 
 
 
318 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5700  peptide ABC transporter, permease protein  31.01 
 
 
333 aa  160  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.385239  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0249  oligopeptide ABC transporter, permease protein  34.25 
 
 
318 aa  160  3e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1510  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.46 
 
 
341 aa  160  3e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000209407  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0812  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.82 
 
 
336 aa  160  3e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.153061  normal  0.318777 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.22 
 
 
321 aa  159  6e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0692911 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0521  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31 
 
 
321 aa  159  8e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0369  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.04 
 
 
316 aa  158  1e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0881  alkaline phosphatase  33.43 
 
 
336 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0394  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, permease protein  31.64 
 
 
320 aa  157  2e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0733  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.85 
 
 
328 aa  157  2e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7447  ABC transporter, permease  28.61 
 
 
346 aa  157  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.268858  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0695  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.48 
 
 
335 aa  157  2e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.000367904 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0920  alkaline phosphatase  33.43 
 
 
336 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.745476  normal  0.672413 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4297  alkaline phosphatase  33.72 
 
 
336 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.259448  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0924  alkaline phosphatase  33.72 
 
 
336 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4291  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.99 
 
 
338 aa  157  3e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0683  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.63 
 
 
340 aa  156  4e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0808523 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>