More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0622 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_0622  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
365 aa  739    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0482  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.15 
 
 
363 aa  355  7.999999999999999e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.182893  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1137  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.61 
 
 
344 aa  346  4e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0958973 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0896  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.48 
 
 
343 aa  325  1e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4465  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.74 
 
 
337 aa  229  4e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0158247  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0049  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.5 
 
 
336 aa  219  3.9999999999999997e-56  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.190258  normal  0.544383 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6187  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.87 
 
 
329 aa  218  1e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.871135  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4666  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.32 
 
 
332 aa  215  9.999999999999999e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01320  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  36.25 
 
 
328 aa  214  1.9999999999999998e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.655147  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4093  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.83 
 
 
336 aa  214  2.9999999999999995e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.105746  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2622  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.76 
 
 
326 aa  213  3.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.01 
 
 
336 aa  207  3e-52  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.63253  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0930  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.54 
 
 
330 aa  204  2e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4451  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.44 
 
 
330 aa  203  5e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.55101  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1795  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.4 
 
 
328 aa  202  5e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000162915  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3797  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.98 
 
 
325 aa  203  5e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1483  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.76 
 
 
326 aa  201  1.9999999999999998e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.28032  normal  0.876961 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1190  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.75 
 
 
335 aa  201  1.9999999999999998e-50  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0399  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.76 
 
 
325 aa  199  6e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1657  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  34.14 
 
 
343 aa  199  7.999999999999999e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.104246  normal  0.622808 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4519  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.19 
 
 
330 aa  198  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.736409  normal  0.962109 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1179  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.64 
 
 
328 aa  197  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5700  peptide ABC transporter, permease protein  33.64 
 
 
333 aa  197  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.385239  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1399  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.8 
 
 
325 aa  197  2.0000000000000003e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.895981  normal  0.8818 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3401  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.74 
 
 
331 aa  197  3e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.621344  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0039  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.82 
 
 
329 aa  196  6e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34920  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  33.53 
 
 
331 aa  194  1e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.949734  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2727  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.21 
 
 
331 aa  194  2e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1899  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.4 
 
 
328 aa  193  4e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.227474  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0172  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.86 
 
 
326 aa  192  8e-48  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.774382  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06400  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  36.31 
 
 
326 aa  192  1e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.36653  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2514  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.06 
 
 
323 aa  190  2.9999999999999997e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0635033  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6685  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.71 
 
 
325 aa  189  7e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0249193  normal  0.645834 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0481  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.74 
 
 
324 aa  189  7e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.399045  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2074  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.25 
 
 
325 aa  188  1e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.480445  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2744  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.53 
 
 
344 aa  188  1e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.480535  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1680  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.13 
 
 
326 aa  187  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.473692  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3886  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.59 
 
 
339 aa  187  3e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.431953  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0215  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.55 
 
 
343 aa  186  7e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000546262  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17750  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  33.13 
 
 
336 aa  185  1.0000000000000001e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0274978  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7457  peptide ABC transporter, permease protein  35.01 
 
 
334 aa  185  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.48372 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5781  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.79 
 
 
325 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.100059 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2396  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.71 
 
 
325 aa  181  2e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0915  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.64 
 
 
338 aa  179  4.999999999999999e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0893  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.72 
 
 
338 aa  177  2e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20170  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  31.91 
 
 
325 aa  177  2e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1670  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.84 
 
 
335 aa  176  4e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.851486 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0546  peptide ABC transporter, protein inner membrane binding component  32.62 
 
 
324 aa  176  6e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000873967  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002585  (GlcNAc)2 ABC transporter permease component 1  33.04 
 
 
328 aa  176  8e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0812  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.33 
 
 
336 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.153061  normal  0.318777 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2577  ABC-type [(GlcNAc)2] transporter, permease protein  32.14 
 
 
328 aa  175  9.999999999999999e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0148  peptide ABC transporter, permease protein  31.83 
 
 
328 aa  174  1.9999999999999998e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03424  hypothetical protein  32.93 
 
 
328 aa  174  2.9999999999999996e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4239  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.45 
 
 
336 aa  173  5e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0349667  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4562  dipeptide ABC transporter, permease protein  32.45 
 
 
336 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0840  alkaline phosphatase  32.46 
 
 
336 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2502  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.94 
 
 
333 aa  171  1e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0695  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.32 
 
 
335 aa  171  1e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.000367904 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0139  dipeptide transporter permease DppB  31.43 
 
 
351 aa  171  2e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5117  ABC transporter permease  33.24 
 
 
336 aa  171  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3104  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.11 
 
 
306 aa  170  3e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58440  ABC transporter permease  32.94 
 
 
336 aa  170  3e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.514083  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0237  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.14 
 
 
335 aa  170  3e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0397671  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0113  nickel-transporting ATPase  31.67 
 
 
336 aa  169  6e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3995  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.21 
 
 
325 aa  169  7e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0881  alkaline phosphatase  32.65 
 
 
336 aa  169  9e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0920  alkaline phosphatase  32.65 
 
 
336 aa  169  9e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.745476  normal  0.672413 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0924  alkaline phosphatase  32.65 
 
 
336 aa  169  9e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4297  alkaline phosphatase  32.65 
 
 
336 aa  169  1e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.259448  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0161  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.76 
 
 
336 aa  168  1e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.040531  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1530  dipeptide ABC transporter, permease protein  31.87 
 
 
335 aa  167  2e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.755182  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.71 
 
 
326 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0050  dipeptide transporter permease DppB  31.79 
 
 
339 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.969756  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1585  dipeptide ABC transporter, permease protein  31.96 
 
 
335 aa  167  2.9999999999999998e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.280526  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3232  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  31.38 
 
 
335 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.624237  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0105  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.8 
 
 
326 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.109225  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3970  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.38 
 
 
335 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4074  dipeptide transporter permease DppB  31.7 
 
 
339 aa  166  4e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0089  dipeptide transporter permease DppB  31.7 
 
 
339 aa  166  4e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.297234  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2054  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.21 
 
 
336 aa  166  5e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.000423079  normal  0.894594 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0045  dipeptide transporter permease DppB  31.79 
 
 
339 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1583  alkaline phosphatase  32.46 
 
 
335 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.354079  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0131  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.58 
 
 
326 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00798  predicted peptide transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  32.11 
 
 
306 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.472093  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2811  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.11 
 
 
306 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.473558  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2813  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.11 
 
 
306 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00815  hypothetical protein  32.11 
 
 
306 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.558182  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0889  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  32.11 
 
 
306 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.952014  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0856  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  32.11 
 
 
306 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0982  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  32.11 
 
 
306 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2985  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.93 
 
 
313 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.348462  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0902  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  32.11 
 
 
306 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3568  oligopeptide ABC transporter, permease  33.54 
 
 
327 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0709186 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0489  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.56 
 
 
336 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3964  hypothetical protein  31.09 
 
 
335 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.1929 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2054  peptide ABC transporter permease  36.09 
 
 
336 aa  164  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0359637  normal  0.365039 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3168  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.43 
 
 
317 aa  163  4.0000000000000004e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1691  alkaline phosphatase  34.86 
 
 
336 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.218764 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3906  dipeptide transporter permease DppB  30.2 
 
 
339 aa  162  6e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2812  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.27 
 
 
336 aa  162  6e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.532586  normal  0.117752 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>