More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1137 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_1137  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
344 aa  687    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0958973 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0896  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.79 
 
 
343 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0622  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.61 
 
 
365 aa  350  2e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0482  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.55 
 
 
363 aa  327  1.0000000000000001e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.182893  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4465  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.09 
 
 
337 aa  234  1.0000000000000001e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0158247  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4093  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.5 
 
 
336 aa  228  1e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.105746  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0049  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.4 
 
 
336 aa  227  3e-58  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.190258  normal  0.544383 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1399  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.39 
 
 
325 aa  226  3e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.895981  normal  0.8818 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1657  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  38.58 
 
 
343 aa  226  6e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.104246  normal  0.622808 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5700  peptide ABC transporter, permease protein  38.89 
 
 
333 aa  224  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.385239  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0039  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.11 
 
 
329 aa  223  4e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4666  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.01 
 
 
332 aa  222  6e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2622  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.88 
 
 
326 aa  221  1.9999999999999999e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1483  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.16 
 
 
326 aa  218  1e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.28032  normal  0.876961 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3401  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.77 
 
 
331 aa  218  2e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.621344  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01320  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  38.97 
 
 
328 aa  215  8e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.655147  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.5 
 
 
336 aa  213  2.9999999999999995e-54  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.63253  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1190  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.45 
 
 
335 aa  212  7e-54  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0930  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.72 
 
 
330 aa  211  1e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6187  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.58 
 
 
329 aa  210  2e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.871135  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0399  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.69 
 
 
325 aa  210  2e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0172  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.67 
 
 
326 aa  208  1e-52  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.774382  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20170  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  39.76 
 
 
325 aa  205  1e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3797  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.47 
 
 
325 aa  204  2e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7457  peptide ABC transporter, permease protein  37.39 
 
 
334 aa  204  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.48372 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1899  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.35 
 
 
328 aa  202  7e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.227474  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06400  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  39.75 
 
 
326 aa  201  9.999999999999999e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.36653  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4451  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.2 
 
 
330 aa  199  7e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.55101  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34920  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  36.45 
 
 
331 aa  199  7.999999999999999e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.949734  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1680  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.25 
 
 
326 aa  198  1.0000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.473692  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2514  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.58 
 
 
323 aa  197  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0635033  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1179  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.63 
 
 
328 aa  196  4.0000000000000005e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2074  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.35 
 
 
325 aa  196  6e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.480445  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0695  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.29 
 
 
335 aa  192  7e-48  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.000367904 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1795  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.23 
 
 
328 aa  191  2e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000162915  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2744  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.95 
 
 
344 aa  191  2e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.480535  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2727  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.52 
 
 
331 aa  189  5e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5781  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.55 
 
 
325 aa  189  5e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.100059 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.76 
 
 
326 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6685  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.64 
 
 
325 aa  186  6e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0249193  normal  0.645834 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2577  ABC-type [(GlcNAc)2] transporter, permease protein  35.03 
 
 
328 aa  185  9e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0481  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.93 
 
 
324 aa  185  1.0000000000000001e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.399045  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4519  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.05 
 
 
330 aa  185  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.736409  normal  0.962109 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2396  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.34 
 
 
325 aa  184  1.0000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3886  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.99 
 
 
339 aa  182  6e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.431953  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03424  hypothetical protein  34.13 
 
 
328 aa  182  8.000000000000001e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002585  (GlcNAc)2 ABC transporter permease component 1  33.83 
 
 
328 aa  181  2e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2054  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.23 
 
 
336 aa  180  2.9999999999999997e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.000423079  normal  0.894594 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0546  peptide ABC transporter, protein inner membrane binding component  34.35 
 
 
324 aa  177  2e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000873967  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2083  ABC transporter, permease  32.93 
 
 
354 aa  177  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.899813  normal  0.534674 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0148  peptide ABC transporter, permease protein  33.23 
 
 
328 aa  176  4e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17750  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  34.44 
 
 
336 aa  173  2.9999999999999996e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0274978  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3995  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.84 
 
 
325 aa  172  5.999999999999999e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3568  oligopeptide ABC transporter, permease  33.54 
 
 
327 aa  172  6.999999999999999e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0709186 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0489  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.95 
 
 
336 aa  172  7.999999999999999e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2502  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.44 
 
 
333 aa  172  9e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0915  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.84 
 
 
338 aa  171  2e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0893  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.84 
 
 
338 aa  170  3e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0185  dipeptide transporter permease DppB  32.94 
 
 
339 aa  169  6e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.446355  normal  0.432086 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2389  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.23 
 
 
329 aa  169  7e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0215  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.64 
 
 
343 aa  167  2e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000546262  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3168  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.43 
 
 
317 aa  167  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0161  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.63 
 
 
336 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.040531  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3827  dipeptide transporter permease DppB  33.33 
 
 
339 aa  166  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3905  dipeptide transporter permease DppB  33.33 
 
 
339 aa  166  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3841  dipeptide transporter permease DppB  33.33 
 
 
339 aa  166  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4009  dipeptide transporter permease DppB  33.33 
 
 
339 aa  166  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3949  dipeptide transporter permease DppB  33.33 
 
 
339 aa  166  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.788898  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4911  dipeptide transporter permease DppB  32.18 
 
 
381 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03394  dipeptide transporter  32.36 
 
 
339 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0169  Alkaline phosphatase  32.36 
 
 
339 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0172  dipeptide transporter permease DppB  32.36 
 
 
339 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4035  dipeptide transporter permease DppB  32.36 
 
 
339 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19900  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  32.83 
 
 
348 aa  164  2.0000000000000002e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00317245  hitchhiker  0.000399681 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3988  dipeptide transporter permease DppB  32.36 
 
 
339 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3862  dipeptide transporter permease DppB  32.36 
 
 
339 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3742  dipeptide transporter permease DppB  32.36 
 
 
339 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03345  hypothetical protein  32.36 
 
 
339 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3906  dipeptide transporter permease DppB  31.88 
 
 
339 aa  163  3e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0683  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.38 
 
 
340 aa  163  4.0000000000000004e-39  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0808523 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3010  ABC transporter related  31.86 
 
 
339 aa  163  4.0000000000000004e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.932121  normal  0.429089 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2197  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.83 
 
 
325 aa  162  6e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000755906  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2748  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.72 
 
 
358 aa  162  6e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0050  dipeptide transporter permease DppB  31.78 
 
 
339 aa  162  7e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.969756  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1677  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.09 
 
 
347 aa  162  8.000000000000001e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.281902  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0139  dipeptide transporter permease DppB  32.48 
 
 
351 aa  162  1e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4097  dipeptide transporter permease DppB  31.59 
 
 
339 aa  161  1e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.710265  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0045  dipeptide transporter permease DppB  31.49 
 
 
339 aa  160  2e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0145  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.55 
 
 
450 aa  160  2e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.570332  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0692  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.8 
 
 
321 aa  159  9e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0521  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.8 
 
 
321 aa  158  1e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.72 
 
 
321 aa  157  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0692911 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1614  oligopeptide ABC transporter, permease protein  30.45 
 
 
304 aa  157  2e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4405  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
325 aa  157  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.271633 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4093  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.56 
 
 
321 aa  158  2e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0394  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, permease protein  29 
 
 
320 aa  157  3e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1269  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  32.8 
 
 
324 aa  157  3e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4074  dipeptide transporter permease DppB  30.9 
 
 
339 aa  157  3e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0089  dipeptide transporter permease DppB  30.9 
 
 
339 aa  157  3e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.297234  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0733  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
328 aa  156  4e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>