More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_1045 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009635  Maeo_1045  nickel-dependent hydrogenase large subunit  100 
 
 		 385 aa  795    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0692  nickel-dependent hydrogenase large subunit  72.82 
 
 		 390 aa  610  1e-173  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0196  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  70 
 
 		 390 aa  587  1e-167  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1291  coenzyme F420 hydrogenase, subunit alpha  69.74 
 
 		 390 aa  584  1e-166  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.333817  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0627  nickel-dependent hydrogenase large subunit  70.26 
 
 		 390 aa  586  1e-166  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.931032 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0649  coenzyme F420-reducing hydrogenase, alpha subunit  50.51 
 
 		 410 aa  359  5e-98  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0073  nickel-dependent hydrogenase large subunit  51.03 
 
 		 410 aa  358  9.999999999999999e-98  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2174  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  40.28 
 
 		 455 aa  283  5.000000000000001e-75  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0015  coenzyme F420-reducing hydrogenase, alpha subunit  36.55 
 
 		 455 aa  269  7e-71  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2332  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  37.27 
 
 		 469 aa  266  5.999999999999999e-70  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0084  coenzyme F420 hydrogenase, subunit alpha  35.94 
 
 		 455 aa  251  1e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.0042117  normal  0.0638209 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2287  coenzyme F420 hydrogenase, subunit alpha  36.26 
 
 		 456 aa  249  9e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.304616 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0452  coenzyme F420-reducing hydrogenase, alpha subunit  36.72 
 
 		 456 aa  241  2e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0479  coenzyme F420 hydrogenase  35.49 
 
 		 437 aa  222  9e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.654505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2023  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  32.64 
 
 		 438 aa  214  1.9999999999999998e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.113638 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0969  nickel-dependent hydrogenase large subunit  32.55 
 
 		 418 aa  159  7e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1712  F420-non-reducing hydrogenase subunit A  32.78 
 
 		 418 aa  159  9e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0977  nickel-dependent hydrogenase large subunit  32.55 
 
 		 418 aa  158  2e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.390644  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1007  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  28.7 
 
 		 455 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0996  nickel-dependent hydrogenase large subunit  31.88 
 
 		 418 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0078  nickel-dependent hydrogenase large subunit  29.5 
 
 		 474 aa  144  3e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1553  nickel-dependent hydrogenase large subunit  30.56 
 
 		 479 aa  143  5e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1215  nickel-dependent hydrogenase large subunit  30.55 
 
 		 418 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0070  nickel-dependent hydrogenase large subunit  27.21 
 
 		 471 aa  139  7.999999999999999e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0652  F420-non-reducing hydrogenase subunit A  28.41 
 
 		 471 aa  137  5e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3972  nickel-dependent hydrogenase large subunit  29.55 
 
 		 473 aa  134  3e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000529156 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3884  nickel-dependent hydrogenase large subunit  28.37 
 
 		 473 aa  126  7e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1940  hydrogen:quinone oxidoreductase  29.47 
 
 		 475 aa  126  8.000000000000001e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4160  nickel-dependent hydrogenase large subunit  27.76 
 
 		 474 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3320  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  26.19 
 
 		 473 aa  124  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0097  nickel-dependent hydrogenase large subunit  37.16 
 
 		 475 aa  124  3e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.325648  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2102  nickel-dependent hydrogenase large subunit  27.74 
 
 		 472 aa  124  4e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.782605  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0080  nickel-dependent hydrogenase large subunit  28.21 
 
 		 421 aa  124  4e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.303597  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2718  NAD-reducing hydrogenase, beta subunit  26.85 
 
 		 478 aa  123  7e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1231  nickel-dependent hydrogenase large subunit  27.08 
 
 		 458 aa  122  9.999999999999999e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2013  nickel-dependent hydrogenase large subunit  25.35 
 
 		 487 aa  120  3e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1673  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  24.67 
 
 		 493 aa  120  3e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.521628  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0884  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  26.29 
 
 		 432 aa  120  3e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.912975  normal  0.251676 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1215  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  27.67 
 
 		 499 aa  118  9.999999999999999e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0417903 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1113  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  27.62 
 
 		 476 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.301961  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0114  NAD-reducing hydrogenase, beta subunit  25.84 
 
 		 494 aa  117  3e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3537  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  25.93 
 
 		 469 aa  117  3e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2419  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  25.71 
 
 		 473 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.954862  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1787  nickel-dependent hydrogenase large subunit  25.28 
 
 		 481 aa  113  5e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.993845  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3539  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  26.78 
 
 		 474 aa  113  5e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1459  nickel-dependent hydrogenase large subunit  24 
 
 		 504 aa  112  9e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.720227 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2476  nickel-dependent hydrogenase large subunit  25.82 
 
 		 473 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.795621  normal  0.410999 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0092  nickel-dependent hydrogenase large subunit  25.88 
 
 		 474 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.643449 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0095  nickel-dependent hydrogenase large subunit  25.88 
 
 		 474 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4661  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  33.02 
 
 		 487 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1122  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  28.2 
 
 		 425 aa  110  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2716  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  26.17 
 
 		 479 aa  110  6e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.892044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2250  nickel-dependent hydrogenase large subunit  23.94 
 
 		 488 aa  110  6e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0169608  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_553  nickel-dependent hydrogenase, group 3, large subunit  24.28 
 
 		 479 aa  109  7.000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0139726  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1368  nickel-dependent hydrogenase large subunit  27.14 
 
 		 475 aa  108  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0615  hydrogenase, group 3, VhuA subunit, putative  25.05 
 
 		 479 aa  107  4e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1969  nickel-dependent hydrogenase large subunit  27.03 
 
 		 514 aa  106  6e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.668451  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0531  putative nickel-dependent hydrogenase, large subunit  23.11 
 
 		 504 aa  106  6e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3954  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  26.12 
 
 		 449 aa  105  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.644029 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1248  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  26.36 
 
 		 488 aa  105  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.210122 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0982  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  25.06 
 
 		 487 aa  105  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2555  NAD-reducing hydrogenase HoxS beta subunit  25.12 
 
 		 476 aa  104  2e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.148056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2791  nickel-dependent hydrogenase large subunit  26.76 
 
 		 482 aa  104  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.119602  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1019  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  28.3 
 
 		 431 aa  103  4e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00653003 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2258  nickel-dependent hydrogenase large subunit  23.73 
 
 		 486 aa  103  7e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3855  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  23.83 
 
 		 507 aa  102  9e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2660  Coenzyme F420 hydrogenase  25.67 
 
 		 433 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.041142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1651  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  25.23 
 
 		 485 aa  102  2e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0273  nickel-dependent hydrogenase large subunit  27.4 
 
 		 488 aa  100  3e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.328721 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3270  nickel-dependent hydrogenase large subunit  26.16 
 
 		 517 aa  100  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2748  nickel-dependent hydrogenase large subunit  22.2 
 
 		 488 aa  100  5e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3427  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  26.53 
 
 		 430 aa  99.8  6e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.260108 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4043  nickel-dependent hydrogenase large subunit  24.77 
 
 		 473 aa  99.4  9e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0198059 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1791  hydrogen dehydrogenase  25.62 
 
 		 449 aa  99.4  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0523  nickel-dependent hydrogenase large subunit  25.63 
 
 		 578 aa  98.2  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1263  hypothetical protein  26.57 
 
 		 433 aa  98.6  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.321319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3416  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  26.28 
 
 		 430 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.291194  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3479  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  26.28 
 
 		 430 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.441341  normal  0.0523033 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1858  nickel-dependent hydrogenase large subunit  26.63 
 
 		 428 aa  97.8  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.940457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4113  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  25.74 
 
 		 489 aa  96.7  6e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0509028  normal  0.183384 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0507  nickel-dependent hydrogenase large subunit  25.65 
 
 		 429 aa  96.3  9e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0805  nickel-dependent hydrogenase large subunit  27.51 
 
 		 465 aa  95.5  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3680  nickel-dependent hydrogenase large subunit  25.64 
 
 		 509 aa  95.5  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0782936  normal  0.503756 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2169  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  28.79 
 
 		 424 aa  95.9  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0588  F420-non-reducing hydrogenase subunit A  29.15 
 
 		 479 aa  95.5  2e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000204108  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2135  periplasmic (NiFeSe) hydrogenase, large subunit, selenocysteine-containing  25.45 
 
 		 488 aa  94.7  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4496  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  23.96 
 
 		 430 aa  94.4  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.401222  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2249  nickel-dependent hydrogenase large subunit  27.01 
 
 		 423 aa  93.6  5e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1071  nickel-dependent hydrogenase large subunit  27.55 
 
 		 470 aa  93.6  5e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.018808  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1525  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  23.81 
 
 		 488 aa  93.2  7e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000894187  hitchhiker  0.00486844 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2503  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  24.46 
 
 		 567 aa  92  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153272 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0511  nickel-dependent hydrogenase large subunit  42.02 
 
 		 577 aa  91.7  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0478  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  42.02 
 
 		 577 aa  91.3  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1256  nickel-dependent hydrogenase large subunit  24.66 
 
 		 430 aa  91.3  2e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0506  nickel-dependent hydrogenase large subunit  42.02 
 
 		 577 aa  92  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4826  nickel-dependent hydrogenase large subunit  26.48 
 
 		 428 aa  91.3  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.106762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1929  nickel-dependent hydrogenase large subunit  26.49 
 
 		 425 aa  90.5  4e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3520  nickel-dependent hydrogenase large subunit  41.88 
 
 		 567 aa  89  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2221  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  30.65 
 
 		 482 aa  88.6  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.794889  normal  0.78316 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04400  Soluble nickel-dependent hydrogenase, large subunit, HoxH  25.84 
 
 		 419 aa  87.4  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>