More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1368 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3539  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  92.37 
 
 		 474 aa  895    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2476  nickel-dependent hydrogenase large subunit  67.73 
 
 		 473 aa  676    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.795621  normal  0.410999 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4043  nickel-dependent hydrogenase large subunit  69.07 
 
 		 473 aa  677    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0198059 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1368  nickel-dependent hydrogenase large subunit  100 
 
 		 475 aa  967    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4661  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  70.69 
 
 		 487 aa  715    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0095  nickel-dependent hydrogenase large subunit  69.28 
 
 		 474 aa  692    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4160  nickel-dependent hydrogenase large subunit  69.92 
 
 		 474 aa  702    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2555  NAD-reducing hydrogenase HoxS beta subunit  66.81 
 
 		 476 aa  644    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.148056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0092  nickel-dependent hydrogenase large subunit  69.28 
 
 		 474 aa  693    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.643449 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2716  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  61.31 
 
 		 479 aa  575  1.0000000000000001e-163  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.892044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1113  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  59.7 
 
 		 476 aa  570  1e-161  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.301961  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2718  NAD-reducing hydrogenase, beta subunit  58.4 
 
 		 478 aa  561  1e-158  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2791  nickel-dependent hydrogenase large subunit  60.5 
 
 		 482 aa  553  1e-156  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.119602  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0078  nickel-dependent hydrogenase large subunit  49.15 
 
 		 474 aa  491  1e-137  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2102  nickel-dependent hydrogenase large subunit  49.06 
 
 		 472 aa  473  1e-132  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.782605  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2748  nickel-dependent hydrogenase large subunit  48.5 
 
 		 488 aa  449  1e-125  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2250  nickel-dependent hydrogenase large subunit  48.63 
 
 		 488 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0169608  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0114  NAD-reducing hydrogenase, beta subunit  48.41 
 
 		 494 aa  444  1e-123  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0982  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  47.36 
 
 		 487 aa  437  1e-121  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1459  nickel-dependent hydrogenase large subunit  47.79 
 
 		 504 aa  432  1e-120  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.720227 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3855  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  47.38 
 
 		 507 aa  427  1e-118  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1673  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  46.12 
 
 		 493 aa  424  1e-117  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.521628  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0531  putative nickel-dependent hydrogenase, large subunit  44.82 
 
 		 504 aa  414  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1525  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  44.72 
 
 		 488 aa  412  1e-114  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000894187  hitchhiker  0.00486844 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1215  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  43.63 
 
 		 499 aa  399  9.999999999999999e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0417903 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4113  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  43.44 
 
 		 489 aa  389  1e-107  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0509028  normal  0.183384 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1007  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  43.26 
 
 		 455 aa  370  1e-101  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0615  hydrogenase, group 3, VhuA subunit, putative  42.05 
 
 		 479 aa  363  4e-99  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0588  F420-non-reducing hydrogenase subunit A  41.51 
 
 		 479 aa  363  5.0000000000000005e-99  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000204108  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_553  nickel-dependent hydrogenase, group 3, large subunit  41.39 
 
 		 479 aa  360  4e-98  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0139726  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2221  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  41.32 
 
 		 482 aa  356  3.9999999999999996e-97  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.794889  normal  0.78316 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2258  nickel-dependent hydrogenase large subunit  40.95 
 
 		 486 aa  342  1e-92  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0996  nickel-dependent hydrogenase large subunit  42.37 
 
 		 418 aa  338  9.999999999999999e-92  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0097  nickel-dependent hydrogenase large subunit  40.49 
 
 		 475 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.325648  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0652  F420-non-reducing hydrogenase subunit A  40.53 
 
 		 471 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3537  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  41.32 
 
 		 469 aa  336  7e-91  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0070  nickel-dependent hydrogenase large subunit  39.2 
 
 		 471 aa  335  1e-90  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1651  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  38.97 
 
 		 485 aa  335  1e-90  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1712  F420-non-reducing hydrogenase subunit A  42.03 
 
 		 418 aa  333  3e-90  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0969  nickel-dependent hydrogenase large subunit  42.03 
 
 		 418 aa  333  4e-90  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0977  nickel-dependent hydrogenase large subunit  41.79 
 
 		 418 aa  333  5e-90  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.390644  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4314  nickel-dependent hydrogenase large subunit  39.43 
 
 		 494 aa  330  3e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4292  nickel-dependent hydrogenase large subunit  39.6 
 
 		 494 aa  328  1.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3972  nickel-dependent hydrogenase large subunit  40.86 
 
 		 473 aa  326  5e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000529156 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1215  nickel-dependent hydrogenase large subunit  40.19 
 
 		 418 aa  325  1e-87  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2013  nickel-dependent hydrogenase large subunit  38.19 
 
 		 487 aa  323  6e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3884  nickel-dependent hydrogenase large subunit  40.43 
 
 		 473 aa  316  5e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1553  nickel-dependent hydrogenase large subunit  38.57 
 
 		 479 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4162  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  39.01 
 
 		 494 aa  313  3.9999999999999997e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0906302  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3680  nickel-dependent hydrogenase large subunit  40.08 
 
 		 509 aa  313  4.999999999999999e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0782936  normal  0.503756 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3320  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  40.26 
 
 		 473 aa  311  2e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3954  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  39.37 
 
 		 449 aa  310  4e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.644029 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2419  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  40.39 
 
 		 473 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.954862  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1791  hydrogen dehydrogenase  39.11 
 
 		 449 aa  308  2.0000000000000002e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4306  nickel-dependent hydrogenase large subunit  38.45 
 
 		 498 aa  299  8e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.891144  normal  0.552071 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4496  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  33.91 
 
 		 430 aa  188  2e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.401222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2660  Coenzyme F420 hydrogenase  30.7 
 
 		 433 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.041142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2169  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  32.45 
 
 		 424 aa  176  9.999999999999999e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2097  nickel-dependent hydrogenase large subunit  31.72 
 
 		 424 aa  167  4e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1138  nickel-dependent hydrogenase large subunit  31.9 
 
 		 431 aa  167  5e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1263  hypothetical protein  32.31 
 
 		 433 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.321319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1019  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  30.67 
 
 		 431 aa  165  1.0000000000000001e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00653003 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1256  nickel-dependent hydrogenase large subunit  29.11 
 
 		 430 aa  164  3e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0245  hydrogenase/sulfur reductase, alpha subunit  29.84 
 
 		 426 aa  163  6e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.392685  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1055  nickel-dependent hydrogenase large subunit  32.26 
 
 		 432 aa  162  1e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.620596 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2132  nickel-dependent hydrogenase large subunit  30.97 
 
 		 425 aa  162  1e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0448433  normal  0.0283043 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2605  nickel-dependent hydrogenase large subunit  30.13 
 
 		 439 aa  161  2e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0537031  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0937  [NiFe] hydrogenase, alpha subunit, putative  31.87 
 
 		 422 aa  160  3e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.952693  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0080  nickel-dependent hydrogenase large subunit  29.24 
 
 		 421 aa  158  2e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.303597  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0507  nickel-dependent hydrogenase large subunit  31.25 
 
 		 429 aa  157  4e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2532  hypothetical protein  29.75 
 
 		 430 aa  157  4e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2387  hypothetical protein  30.13 
 
 		 430 aa  155  2e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2590  nickel-dependent hydrogenase large subunit  32.18 
 
 		 433 aa  154  2e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.282401  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2499  nickel-dependent hydrogenase large subunit  29.17 
 
 		 424 aa  154  2e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1929  nickel-dependent hydrogenase large subunit  29.59 
 
 		 425 aa  152  1e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04400  Soluble nickel-dependent hydrogenase, large subunit, HoxH  30.62 
 
 		 419 aa  149  9e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3427  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  28.73 
 
 		 430 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.260108 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3416  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  28.73 
 
 		 430 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.291194  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3479  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  28.73 
 
 		 430 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.441341  normal  0.0523033 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4826  nickel-dependent hydrogenase large subunit  32.03 
 
 		 428 aa  146  6e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.106762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0884  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  26.57 
 
 		 432 aa  142  9.999999999999999e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.912975  normal  0.251676 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1858  nickel-dependent hydrogenase large subunit  30.65 
 
 		 428 aa  136  7.000000000000001e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.940457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1122  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  28.88 
 
 		 425 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3474  nickel-dependent hydrogenase large subunit  28.1 
 
 		 432 aa  132  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.455292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3270  nickel-dependent hydrogenase large subunit  26.69 
 
 		 517 aa  130  5.0000000000000004e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1231  nickel-dependent hydrogenase large subunit  28.22 
 
 		 458 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1969  nickel-dependent hydrogenase large subunit  27.02 
 
 		 514 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.668451  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0649  coenzyme F420-reducing hydrogenase, alpha subunit  27.79 
 
 		 410 aa  126  9e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2332  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  27.72 
 
 		 469 aa  124  3e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1042  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  27.37 
 
 		 485 aa  124  3e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.90765  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0073  nickel-dependent hydrogenase large subunit  26.27 
 
 		 410 aa  123  8e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1787  nickel-dependent hydrogenase large subunit  27.13 
 
 		 481 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.993845  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2174  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  27.68 
 
 		 455 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0015  coenzyme F420-reducing hydrogenase, alpha subunit  25.64 
 
 		 455 aa  120  6e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0110  [Ni/Fe] hydrogenase, group 1, large subunit, putative  25.61 
 
 		 526 aa  119  7.999999999999999e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0452  coenzyme F420-reducing hydrogenase, alpha subunit  27.5 
 
 		 456 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0692  nickel-dependent hydrogenase large subunit  27.8 
 
 		 390 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1071  nickel-dependent hydrogenase large subunit  24.95 
 
 		 470 aa  117  3.9999999999999997e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.018808  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0273  nickel-dependent hydrogenase large subunit  28.41 
 
 		 488 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.328721 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1045  nickel-dependent hydrogenase large subunit  27.55 
 
 		 385 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>