More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02812 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_02812  TonB system biopolymer transport component  100 
 
 
174 aa  354  3.9999999999999996e-97  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00324688  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2988  MotA/TolQ/ExbB proton channel  85.06 
 
 
174 aa  308  2.9999999999999997e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.649663  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1627  MotA/TolQ/ExbB proton channel  72.99 
 
 
175 aa  269  1e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.399285  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2716  MotA/TolQ/ExbB proton channel  72.99 
 
 
175 aa  269  1e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00531183  decreased coverage  0.0000000102251 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3754  biopolymer transport exbB protein  74.71 
 
 
174 aa  269  2e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1664  MotA/TolQ/ExbB proton channel  72.67 
 
 
175 aa  267  5e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0648284  normal  0.131005 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1642  MotA/TolQ/ExbB proton channel  72.41 
 
 
175 aa  267  5.9999999999999995e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.188502  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2462  MotA/TolQ/ExbB proton channel  71.84 
 
 
175 aa  266  8e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.055341  hitchhiker  0.00000243033 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1519  MotA/TolQ/ExbB proton channel  71.26 
 
 
175 aa  265  2e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2624  MotA/TolQ/ExbB proton channel  71.26 
 
 
175 aa  265  2.9999999999999995e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00200443  hitchhiker  0.00000116003 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2476  MotA/TolQ/ExbB proton channel  70.11 
 
 
175 aa  265  2.9999999999999995e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.428605  hitchhiker  0.0000502877 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2532  MotA/TolQ/ExbB proton channel  71.26 
 
 
175 aa  265  2.9999999999999995e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0137546  unclonable  0.0000227076 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3077  MotA/TolQ/ExbB proton channel  69.54 
 
 
175 aa  261  4.999999999999999e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00037771  hitchhiker  0.00001604 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2624  MotA/TolQ/ExbB proton channel  68.39 
 
 
175 aa  259  1e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000822503  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1256  MotA/TolQ/ExbB proton channel  67.82 
 
 
175 aa  256  9e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.80948  hitchhiker  0.000146738 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1573  MotA/TolQ/ExbB proton channel  68.39 
 
 
174 aa  255  2e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.119512  hitchhiker  0.00360168 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2423  MotA/TolQ/ExbB proton channel  67.24 
 
 
175 aa  255  3e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00161058  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2650  MotA/TolQ/ExbB proton channel  66.67 
 
 
174 aa  252  2.0000000000000002e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.026005  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1826  TonB system transport protein ExbB2  69.38 
 
 
160 aa  240  9e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06758  hypothetical protein  55.94 
 
 
184 aa  185  3e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000846  ferric siderophore transport system biopolymer transport protein ExbB  54.17 
 
 
184 aa  179  1e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3974  biopolymer transport exbB protein  47.02 
 
 
175 aa  171  3.9999999999999995e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0903  TonB system transport protein ExbB3  46.2 
 
 
177 aa  165  4e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001858  ferric siderophore transport system biopolymer transport protein ExbB  45.66 
 
 
175 aa  164  5e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0113  TonB system transport protein ExbB2  50.66 
 
 
169 aa  163  1.0000000000000001e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00635  biopolymer transport protein  45.09 
 
 
175 aa  163  1.0000000000000001e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1062  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50 
 
 
173 aa  162  3e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.641565  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1152  TonB system transport protein ExbB2  48.12 
 
 
180 aa  160  8.000000000000001e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0870  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.44 
 
 
178 aa  150  1e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0354  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  47.02 
 
 
175 aa  144  8.000000000000001e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0226486  normal  0.429001 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0608  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.94 
 
 
174 aa  144  9e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00236146  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03433  TonB system biopolymer transport component  54.47 
 
 
132 aa  133  1.9999999999999998e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3870  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.21 
 
 
182 aa  115  3e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1617  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.33 
 
 
177 aa  80.9  0.000000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.223503  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1518  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.87 
 
 
451 aa  80.9  0.000000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.298092  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2154  biopolymer transport protein (ExbB)-like  31.95 
 
 
208 aa  79.7  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2651  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.87 
 
 
451 aa  79  0.00000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.12619  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1825  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  33.33 
 
 
451 aa  77.8  0.00000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1572  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.55 
 
 
451 aa  77  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0356539  hitchhiker  0.00010475 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2625  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.84 
 
 
451 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00264646  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2424  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.53 
 
 
450 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00633842  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1737  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.19 
 
 
201 aa  74.7  0.0000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0638355  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2717  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.53 
 
 
451 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0125203  decreased coverage  0.0000000188451 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1663  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50 
 
 
451 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0204687  normal  0.14505 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1641  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50 
 
 
451 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0893157  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1626  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50 
 
 
451 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.171295  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3078  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50 
 
 
451 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00501831  hitchhiker  0.0000206592 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2625  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.65 
 
 
451 aa  72  0.000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000348965  hitchhiker  0.00000191471 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2463  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.65 
 
 
451 aa  72  0.000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00080951  hitchhiker  0.00000350745 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2533  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.87 
 
 
451 aa  72  0.000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0106655  unclonable  0.0000291193 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2477  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.3 
 
 
451 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.373641  hitchhiker  0.000065853 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1255  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  41.76 
 
 
451 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.429171  unclonable  0.0000153929 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1061  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.82 
 
 
469 aa  69.7  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.297335  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3975  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  28.31 
 
 
457 aa  68.6  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0437  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  27.5 
 
 
165 aa  67.4  0.00000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.383605  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3871  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.91 
 
 
449 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0904  Biopolymer transport protein TolR  29.63 
 
 
453 aa  66.2  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0436  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  31.29 
 
 
403 aa  65.5  0.0000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0887055  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2673  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.12 
 
 
253 aa  65.5  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0848  TolR-like transport protein  44.74 
 
 
470 aa  65.1  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.638917  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03434  putative Tol protein  28.76 
 
 
454 aa  62.8  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2150  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.28 
 
 
208 aa  62.8  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.162411  normal  0.347505 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1616  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.67 
 
 
469 aa  63.2  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3523  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.03 
 
 
172 aa  62.8  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3755  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  27.98 
 
 
449 aa  62.4  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1153  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  34.04 
 
 
457 aa  60.8  0.000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0112  biopolymer transport protein TolR  39.76 
 
 
451 aa  60.8  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0869  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.98 
 
 
462 aa  59.7  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0607  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.88 
 
 
478 aa  60.1  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00882438  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2178  putative tolQ-type transport protein  38.46 
 
 
211 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25490  putative tolQ-type transport protein  38.46 
 
 
211 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0178753  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06759  hypothetical protein  38.67 
 
 
455 aa  59.3  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2061  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.41 
 
 
209 aa  58.9  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.590103 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2153  transport protein TolQ-like  44.78 
 
 
474 aa  58.5  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.337835  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001857  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  43.48 
 
 
453 aa  58.2  0.00000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00636  biopolymer transport protein  43.48 
 
 
453 aa  58.2  0.00000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000847  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  43.1 
 
 
455 aa  57.8  0.00000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2815  biopolymer transport proteins-like  29.83 
 
 
464 aa  57  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00525326  hitchhiker  0.00000294383 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2238  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  35.23 
 
 
607 aa  56.6  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.363335  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1738  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.65 
 
 
576 aa  55.8  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000125272  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2300  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.71 
 
 
215 aa  55.5  0.0000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1396  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.75 
 
 
220 aa  55.1  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.739677  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3524  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.08 
 
 
469 aa  55.1  0.0000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2404  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.09 
 
 
555 aa  54.7  0.0000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0528  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.61 
 
 
246 aa  54.7  0.0000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1654  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.44 
 
 
480 aa  54.3  0.0000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.759397  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1655  MotA/TolQ/ExbB proton channel  24.86 
 
 
218 aa  54.3  0.0000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.393099  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0561  MotA/TolQ/ExbB proton channel  25.28 
 
 
199 aa  53.5  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.305166 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0453  biopolymer transport proteins-like  33.72 
 
 
465 aa  53.5  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.204978  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3325  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.81 
 
 
234 aa  53.5  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.642372 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0603  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.46 
 
 
217 aa  53.5  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.708114  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3204  protein TolQ  32.38 
 
 
239 aa  53.9  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.129492  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1743  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.74 
 
 
208 aa  53.9  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0923  protein TolQ  29.52 
 
 
248 aa  53.9  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.130209 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1436  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.14 
 
 
218 aa  53.9  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  0.726638 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0966  MotA/TolQ/ExbB proton channel  25.25 
 
 
206 aa  52.8  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000271628  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4433  protein TolQ  29.81 
 
 
238 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0339426  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4594  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.2 
 
 
215 aa  53.1  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0809  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.21 
 
 
227 aa  53.1  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0353  TonB system biopolymer transport component  40.85 
 
 
460 aa  53.1  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.899068  normal  0.349209 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>