55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00180 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_00180  hypothetical protein  100 
 
 		 238 aa  485  1e-136  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0388  hypothetical protein  55.74 
 
 		 235 aa  280  9e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.441494  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2245  hypothetical protein  50.22 
 
 		 237 aa  233  2.0000000000000002e-60  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.241128 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0380  hypothetical protein  40.29 
 
 		 253 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000064309  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2228  hypothetical protein  38.68 
 
 		 263 aa  145  6e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.414181  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2072  hypothetical protein  40.39 
 
 		 262 aa  138  7.999999999999999e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2148  hypothetical protein  38.92 
 
 		 259 aa  135  5e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0800  hypothetical protein  36.94 
 
 		 249 aa  123  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.376791  normal  0.485007 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1445  hypothetical protein  34.96 
 
 		 255 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.12832  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1167  CBS  35.32 
 
 		 233 aa  118  7e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0233095  hitchhiker  0.0000108135 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2248  hypothetical protein  40.28 
 
 		 247 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.251746  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2539  hypothetical protein  33.62 
 
 		 254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.599775 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2397  hypothetical protein  41.22 
 
 		 417 aa  102  6e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0299657 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3697  hypothetical protein  39.71 
 
 		 252 aa  102  6e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4295  hypothetical protein  35.23 
 
 		 280 aa  98.6  7e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.28527  normal  0.0411245 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0755  hypothetical protein  33.33 
 
 		 284 aa  95.9  5e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2453  hypothetical protein  28.15 
 
 		 288 aa  92.4  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.814446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4936  hypothetical protein  39.19 
 
 		 281 aa  90.9  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0226323  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2472  hypothetical protein  29.44 
 
 		 259 aa  90.9  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0130018 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1164  hypothetical protein  31 
 
 		 308 aa  89  5e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0488894  normal  0.160147 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0691  hypothetical protein  32.96 
 
 		 262 aa  87.4  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0614  hypothetical protein  35.22 
 
 		 317 aa  87.4  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.607667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1266  hypothetical protein  34.76 
 
 		 297 aa  85.9  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.649743 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1677  protein of unknown function DUF1499  40.54 
 
 		 138 aa  84  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0774  hypothetical protein  33.11 
 
 		 261 aa  81.6  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1315  AMP-dependent synthetase and ligase  25.38 
 
 		 965 aa  80.9  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.689219  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0504  hypothetical protein  30.51 
 
 		 262 aa  80.5  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5483  hypothetical protein  30.77 
 
 		 231 aa  80.5  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.747945 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0858  hypothetical protein  27.54 
 
 		 263 aa  76.3  0.0000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0949  hypothetical protein  27.73 
 
 		 264 aa  73.2  0.000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3023  hypothetical protein  29.89 
 
 		 259 aa  72  0.000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0975095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2732  hypothetical protein  29.41 
 
 		 259 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.03827 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4393  protein of unknown function DUF1499  28.66 
 
 		 259 aa  70.1  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3126  hypothetical protein  29.48 
 
 		 259 aa  69.3  0.00000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.425452 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1951  hypothetical protein  60.34 
 
 		 60 aa  69.3  0.00000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2900  hypothetical protein  29.48 
 
 		 259 aa  69.3  0.00000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.144571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5003  hypothetical protein  28.48 
 
 		 262 aa  65.5  0.0000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0970477  normal  0.120325 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1085  protein of unknown function DUF1499  32.92 
 
 		 257 aa  63.9  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0551  hypothetical protein  23.21 
 
 		 302 aa  55.1  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.845548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0667  hypothetical protein  40.91 
 
 		 301 aa  50.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.634534  normal  0.958202 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0722  hypothetical protein  39.34 
 
 		 317 aa  48.9  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.405276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3871  protein of unknown function DUF1499  41.38 
 
 		 170 aa  46.6  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.727288 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3821  protein of unknown function DUF1499  41.38 
 
 		 170 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1112  hypothetical protein  47.17 
 
 		 150 aa  45.8  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.117677  normal  0.0235265 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4262  hypothetical protein  32.35 
 
 		 191 aa  46.2  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1069  hypothetical protein  40.35 
 
 		 133 aa  45.4  0.0007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.404225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1553  hypothetical protein  35.2 
 
 		 150 aa  44.7  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0118436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2908  hypothetical protein  34.4 
 
 		 147 aa  43.9  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.405207  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2542  hypothetical protein  47.17 
 
 		 146 aa  43.9  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.322137  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1126  hypothetical protein  21.1 
 
 		 299 aa  44.3  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1805  hypothetical protein  40 
 
 		 152 aa  43.9  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.273509  normal  0.191083 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1554  hypothetical protein  40.68 
 
 		 148 aa  42.7  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000544123 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1824  hypothetical protein  40.68 
 
 		 175 aa  42  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.123685  normal  0.565868 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0470  protein of unknown function DUF1499  31.4 
 
 		 150 aa  42  0.009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11261  hypothetical protein  33.93 
 
 		 127 aa  41.6  0.01  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>