42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0774 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_0774  hypothetical protein  100 
 
 		 261 aa  525  1e-148  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0691  hypothetical protein  39.45 
 
 		 262 aa  162  7e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0504  hypothetical protein  37.5 
 
 		 262 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2472  hypothetical protein  34.14 
 
 		 259 aa  121  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0130018 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4295  hypothetical protein  33.33 
 
 		 280 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.28527  normal  0.0411245 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0755  hypothetical protein  33.46 
 
 		 284 aa  117  3e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1164  hypothetical protein  34.14 
 
 		 308 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0488894  normal  0.160147 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0551  hypothetical protein  30.24 
 
 		 302 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.845548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2453  hypothetical protein  31.8 
 
 		 288 aa  112  7.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.814446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4936  hypothetical protein  32.6 
 
 		 281 aa  106  5e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0226323  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1266  hypothetical protein  33.2 
 
 		 297 aa  106  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.649743 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0388  hypothetical protein  34.44 
 
 		 235 aa  96.7  4e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.441494  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2245  hypothetical protein  35.37 
 
 		 237 aa  94.7  1e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.241128 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2732  hypothetical protein  32.68 
 
 		 259 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.03827 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0800  hypothetical protein  28.08 
 
 		 249 aa  91.7  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.376791  normal  0.485007 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3023  hypothetical protein  31.76 
 
 		 259 aa  90.1  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0975095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4393  protein of unknown function DUF1499  32.94 
 
 		 259 aa  89.4  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0667  hypothetical protein  27.61 
 
 		 301 aa  87  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.634534  normal  0.958202 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0949  hypothetical protein  30 
 
 		 264 aa  84.7  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0614  hypothetical protein  31.3 
 
 		 317 aa  84  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.607667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0380  hypothetical protein  28.64 
 
 		 253 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000064309  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2900  hypothetical protein  30.83 
 
 		 259 aa  82.8  0.000000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.144571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3126  hypothetical protein  30.83 
 
 		 259 aa  82.8  0.000000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.425452 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0722  hypothetical protein  26.69 
 
 		 317 aa  82.8  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.405276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00180  hypothetical protein  33.11 
 
 		 238 aa  82.4  0.000000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1126  hypothetical protein  26.48 
 
 		 299 aa  79.3  0.00000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1167  CBS  27.98 
 
 		 233 aa  77.8  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0233095  hitchhiker  0.0000108135 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2228  hypothetical protein  33.11 
 
 		 263 aa  77  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.414181  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1445  hypothetical protein  31.03 
 
 		 255 aa  73.6  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.12832  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0858  hypothetical protein  28.85 
 
 		 263 aa  69.3  0.00000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3697  hypothetical protein  26.57 
 
 		 252 aa  69.3  0.00000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5003  hypothetical protein  34.64 
 
 		 262 aa  69.3  0.00000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0970477  normal  0.120325 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2397  hypothetical protein  33.77 
 
 		 417 aa  67.4  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0299657 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2072  hypothetical protein  28.27 
 
 		 262 aa  66.6  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2148  hypothetical protein  32.21 
 
 		 259 aa  66.2  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5483  hypothetical protein  31.44 
 
 		 231 aa  65.9  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.747945 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2539  hypothetical protein  30.38 
 
 		 254 aa  65.9  0.0000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.599775 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2248  hypothetical protein  27.22 
 
 		 247 aa  61.6  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.251746  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1085  protein of unknown function DUF1499  36.96 
 
 		 257 aa  60.1  0.00000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1677  protein of unknown function DUF1499  40.43 
 
 		 138 aa  54.3  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1951  hypothetical protein  44.44 
 
 		 60 aa  48.1  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4262  hypothetical protein  26.67 
 
 		 191 aa  43.1  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>